林麝微卫星标记开发与圈养种群遗传多样性分析
摘要 | 第5-6页 |
abstract | 第6-7页 |
第一章 文献综述 | 第10-18页 |
1.1 研究背景 | 第10页 |
1.2 分子标记 | 第10-12页 |
1.2.1 分子标记的概念 | 第10页 |
1.2.2 分子标记的发展 | 第10-12页 |
1.3 微卫星 | 第12-16页 |
1.3.1 微卫星标记原理及分类 | 第12页 |
1.3.2 微卫星的分离方法 | 第12-14页 |
1.3.3 微卫星的应用 | 第14-16页 |
1.3.3.1 遗传多样性分析 | 第14页 |
1.3.3.2 个体鉴定及亲缘关系鉴定 | 第14-15页 |
1.3.3.3 遗传图谱构建 | 第15页 |
1.3.3.4 性状关联分析 | 第15-16页 |
1.4 林麝分子遗传学研究进展 | 第16-17页 |
1.5 本研究目的与意义 | 第17-18页 |
第二章 林麝微卫星标记开发 | 第18-38页 |
2.1 材料与方法 | 第18-26页 |
2.1.1 实验材料 | 第18页 |
2.1.2 主要仪器及试剂 | 第18-20页 |
2.1.3 序列合成 | 第20页 |
2.1.4 实验方法 | 第20-26页 |
2.1.4.1 林麝基因组DNA的提取 | 第20页 |
2.1.4.2 林麝基因组DNA的检测 | 第20-21页 |
2.1.4.3 基因组酶切 | 第21页 |
2.1.4.4 酶切产物回收 | 第21页 |
2.1.4.5 接头的制备 | 第21页 |
2.1.4.6 回收DNA片段与接头的连接 | 第21页 |
2.1.4.7 连接产物的预扩增 | 第21-22页 |
2.1.4.8 生物素探针杂交 | 第22页 |
2.1.4.9 磁珠富集微卫星DNA片段 | 第22页 |
2.1.4.10 微卫星富集产物的扩增 | 第22页 |
2.1.4.11 连接T载体 | 第22-23页 |
2.1.4.12 大肠杆菌转化实验 | 第23页 |
2.1.4.13 阳性克隆的筛选 | 第23-24页 |
2.1.4.14 引物设计 | 第24页 |
2.1.4.15 引物多态性检测 | 第24-26页 |
2.2 实验结果与分析 | 第26-35页 |
2.2.1 基因组DNA的提取结果 | 第26页 |
2.2.2 酶切及连接产物扩增结果 | 第26-27页 |
2.2.3 磁珠富集产物的扩增结果 | 第27-28页 |
2.2.4 阳性克隆的筛选结果 | 第28页 |
2.2.5 测序结果 | 第28-30页 |
2.2.6 引物的设计结果 | 第30-32页 |
2.2.7 引物多态性分析 | 第32-35页 |
2.3 讨论 | 第35-37页 |
2.3.1 磁珠富集法的选择 | 第35-36页 |
2.3.2 样品的采集 | 第36页 |
2.3.3 林麝微卫星类型分布特征 | 第36页 |
2.3.4 微卫星位点分析 | 第36-37页 |
2.4 小结 | 第37-38页 |
第三章 圈养林麝遗传多样性分析 | 第38-47页 |
3.1 材料与方法 | 第38-41页 |
3.1.1 实验材料 | 第38页 |
3.1.2 实验仪器与试剂 | 第38页 |
3.1.3 实验方法 | 第38-41页 |
3.1.3.1 基因组DNA提取 | 第38页 |
3.1.3.2 多态引物选择 | 第38-39页 |
3.1.3.3 引物PCR扩增及电泳检测 | 第39页 |
3.1.3.4 数据分析 | 第39-41页 |
3.2 结果与分析 | 第41-44页 |
3.2.1 微卫星多态性 | 第41页 |
3.2.2 种群遗传多样性 | 第41页 |
3.2.3 Hardy-Weinberg平衡 | 第41页 |
3.2.4 等位基因频率 | 第41-43页 |
3.2.5 聚类分析 | 第43-44页 |
3.3 讨论 | 第44-46页 |
3.3.1 样本量的选择 | 第44页 |
3.3.2 种群遗传多样性 | 第44-45页 |
3.3.3 Hardy-Weinberg平衡 | 第45页 |
3.3.4 稀有等位基因 | 第45-46页 |
3.3.5 圈养林麝种群遗传多样性保护的建议 | 第46页 |
3.4 小结 | 第46-47页 |
结论 | 第47-48页 |
参考文献 | 第48-54页 |
附录 | 第54-58页 |
致谢 | 第58-60页 |
作者简介 | 第60页 |