| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第1章 绪论 | 第9-21页 |
| 1.1 哺乳动物脊柱及胸部骨骼元件的进化修饰 | 第9-11页 |
| 1.2 哺乳动物附肢的进化修饰 | 第11-12页 |
| 1.3 同源框基因简介 | 第12-15页 |
| 1.3.1 Hox基因的命名 | 第12-13页 |
| 1.3.2 Hox基因的进化 | 第13-15页 |
| 1.4 Hox基因在轴向骨骼发育过程中的作用 | 第15-18页 |
| 1.4.1 Hox基因突变对轴向骨骼的影响 | 第15-16页 |
| 1.4.2 Hox基因表达在轴向骨骼发育中的作用 | 第16-18页 |
| 1.5 Hox基因在附肢发育中的作用 | 第18-19页 |
| 1.6 Hox基因在四足动物中的进化修饰研究进展 | 第19-20页 |
| 1.7 研究目的和意义 | 第20-21页 |
| 第2章 分析方法 | 第21-28页 |
| 2.1 Hox基因组获取及基因注释 | 第21页 |
| 2.2 Hox基因间隔区比较及重复序列的检测 | 第21-22页 |
| 2.3 Hox基因及调控因子编码序列进化枝特异的氨基酸改变 | 第22-24页 |
| 2.4 选择压力分析 | 第24-26页 |
| 2.5 特异的氨基酸改变及正选择位点在蛋白质三维结构中的分布 | 第26页 |
| 2.6 趋同或平行氨基酸替代 | 第26-28页 |
| 第3章 结果 | 第28-47页 |
| 3.1 哺乳动物Hox基因的结构特征 | 第28页 |
| 3.2 重复序列的分布 | 第28-31页 |
| 3.3 进化枝特异的氨基酸替代 | 第31-33页 |
| 3.4 正选择分析 | 第33-42页 |
| 3.5 适应性突变位点在相应蛋白质空间结构的分布 | 第42-46页 |
| 3.6 Hox基因在哺乳动物中的趋同或平行进化分析 | 第46-47页 |
| 第4章 讨论 | 第47-53页 |
| 4.1 Hox cluster组织结构的差异与哺乳动表型有关 | 第47-48页 |
| 4.2 Hox基因表达模式的改变参与哺乳动物表型的修饰 | 第48-49页 |
| 4.3 Hox基因适应性进化驱使哺乳动物表型的进化改变 | 第49-51页 |
| 4.4 分子趋同与相似表型的产生 | 第51-53页 |
| 总结 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-61页 |
| 在读期间发表的学术论文及研究成果 | 第61-62页 |
| 附录A | 第62-69页 |
| 附录B | 第69-70页 |
| 附录C | 第70-72页 |
| 附录D | 第72-73页 |
| 致谢 | 第73-74页 |
