| 致谢 | 第7-8页 |
| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 缩略词表 | 第12-16页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-33页 |
| 引言 | 第16页 |
| 1 侧根研究进展 | 第16-25页 |
| 1.1 植物根系组成及发生形态 | 第16-18页 |
| 1.2 侧根发生过程及起始机制 | 第18-20页 |
| 1.2.1 侧根发生过程 | 第18页 |
| 1.2.2 侧根起始机制 | 第18-20页 |
| 1.3 生长素对侧根起始发生的影响 | 第20-21页 |
| 1.4 水稻侧根及相关突变体研究 | 第21-25页 |
| 2 生长素信号途径 | 第25-27页 |
| 2.1 泛素蛋白酶系统简介 | 第25-26页 |
| 2.2 Aux/IAA和ARF蛋白互作 | 第26-27页 |
| 3 植物细胞亲环素的生物学功能 | 第27-28页 |
| 4 锌指结构蛋白研究进展 | 第28-32页 |
| 4.1 WRKY蛋白的分类和结构 | 第29-30页 |
| 4.2 WRKY蛋白作用机制 | 第30页 |
| 4.3 WRKY蛋白研究进展 | 第30-32页 |
| 5 本研究的目的和意义 | 第32-33页 |
| 第二章 OsCYP2干扰植株表型鉴定及生长素信号响应分析 | 第33-46页 |
| 1 材料和方法 | 第33-38页 |
| 1.1 材料 | 第33页 |
| 1.2 试验方法 | 第33-37页 |
| 1.2.1 试验材料培养 | 第33-34页 |
| 1.2.2 OsCYP2基因的RT-PCR表达分析 | 第34-35页 |
| 1.2.3 生长素响应基因的RT-PCR表达分析 | 第35-37页 |
| 1.2.3.1 RNA提取 | 第35-36页 |
| 1.2.3.2 RT-PCR | 第36-37页 |
| 1.3 OsCYP2基因表达模式分析 | 第37-38页 |
| 1.3.1 转化植株GUS组织化学反应 | 第37-38页 |
| 1.3.2 启动子调控元件预测 | 第38页 |
| 2 结果分析 | 第38-44页 |
| 2.1 不同干扰株系中OsCYP2的表达分析 | 第38页 |
| 2.2 植株侧根表型分析 | 第38-40页 |
| 2.3 OsCYP2基因RT-PCR表达分析 | 第40页 |
| 2.4 OsCYP2基因表达模式 | 第40-43页 |
| 2.4.1 转化植物GUS报告基因检测 | 第40-41页 |
| 2.4.2 OsCYP2基因启动子调控元件预测 | 第41-43页 |
| 2.5 生长素响应基因的RT-PCR表达分析 | 第43-44页 |
| 3 小结与讨论 | 第44-46页 |
| 第三章 OsCYP2干扰植株的表达谱分析及验证 | 第46-62页 |
| 1 材料和方法 | 第46-53页 |
| 1.1 材料 | 第46页 |
| 1.2 试验方法 | 第46-53页 |
| 1.2.1 总RNA提取 | 第46页 |
| 1.2.2 表达谱分析数据方法 | 第46-51页 |
| 1.2.2.1 原始数据过滤统计 | 第46-47页 |
| 1.2.2.2 基因定量分析 | 第47页 |
| 1.2.2.3 差异基因筛选 | 第47-48页 |
| 1.2.2.4 差异基因的GO功能显著性富集分析 | 第48-50页 |
| 1.2.2.5 差异基因的Pathway显著性富集分析 | 第50-51页 |
| 1.2.3 RT-PCR验证 | 第51-53页 |
| 2 结果分析 | 第53-61页 |
| 2.1 表达谱结果分析 | 第53-61页 |
| 2.1.1 差异表达基因筛选 | 第53-56页 |
| 2.1.2 差异表达基因的GO显著性富集分析 | 第56页 |
| 2.1.3 差异表达基因的KEGG显著性富集分析 | 第56页 |
| 2.1.4 水稻侧根发育调控及生长素基因筛选 | 第56-61页 |
| 2.2 RT-PCR验证 | 第61页 |
| 3 小结与讨论 | 第61-62页 |
| 第四章 OsCYP2互作蛋白的筛选及鉴定 | 第62-87页 |
| 1 材料与方法 | 第62-78页 |
| 1.1 材料 | 第62-63页 |
| 1.2 试验方法 | 第63-77页 |
| 1.2.1 水稻cDNA文库构建 | 第63-67页 |
| 1.2.1.1 mRNA纯化 | 第63-64页 |
| 1.2.1.2 cDNA第一链合成 | 第64-65页 |
| 1.2.1.3 cDNA第二链合成 | 第65页 |
| 1.2.1.4 蛋白酶K消化 | 第65-66页 |
| 1.2.1.5 cDNA末端连接Adaptor | 第66页 |
| 1.2.1.6 除去短链cDNA | 第66-67页 |
| 1.2.2 cDNA文库和pGADT7载体连接 | 第67页 |
| 1.2.3 BD-bait载体构建 | 第67-68页 |
| 1.2.4 目的片段回收和大肠杆菌转化 | 第68页 |
| 1.2.5 酵母感受态细胞制备 | 第68-69页 |
| 1.2.6 BD-bait载体自激活及毒性检测 | 第69-70页 |
| 1.2.7 AD-prey转化酵母Y187 | 第70-71页 |
| 1.2.8 酵母双杂交筛选与OsCYP2蛋白互作的靶蛋白 | 第71-72页 |
| 1.2.9 分离及鉴定阳性互作蛋白 | 第72-73页 |
| 1.2.10 His tag蛋白提取 | 第73-74页 |
| 1.2.11 GST pull down | 第74-76页 |
| 1.2.12 western blot | 第76-77页 |
| 1.3 OsZFP的同源比对 | 第77-78页 |
| 2 结果分析与讨论 | 第78-86页 |
| 2.1 cDNA文库构建 | 第78-79页 |
| 2.2 钓饵载体自激活及毒性检测 | 第79-80页 |
| 2.3 酵母双杂交筛选鉴定与OsCYP2蛋白互作的靶蛋白 | 第80-82页 |
| 2.4 阳性互作蛋白的一对一鉴定 | 第82-84页 |
| 2.5 OsZFP同源分析 | 第84-86页 |
| 3 小结 | 第86-87页 |
| 第五章 OsZFP调控水稻侧根发育的功能研究 | 第87-100页 |
| 1 材料与方法 | 第87-94页 |
| 1.1 材料 | 第87-88页 |
| 1.2 试验方法 | 第88-94页 |
| 1.2.1 OsZFP基因干扰表达载体构建 | 第88-89页 |
| 1.2.2 亚细胞定位载体构建 | 第89-90页 |
| 1.2.3 农杆菌转化 | 第90页 |
| 1.2.4 干扰表达载体转基因水稻鉴定 | 第90-91页 |
| 1.2.5 转基因水稻表型鉴定 | 第91页 |
| 1.2.6 亚细胞定位 | 第91-93页 |
| 1.2.7 生长素响应基因的RT-PCR表达量检测 | 第93-94页 |
| 2 结果分析 | 第94-99页 |
| 2.1 OsZFP干扰表达载体构建及农杆菌转化 | 第94-95页 |
| 2.2 OsZFP干扰植株表型初步分析 | 第95-97页 |
| 2.3 OsZFP:GFP融合蛋白在水稻原生质体内的亚细胞定位分析 | 第97-98页 |
| 2.4 生长素响应基因相对表达量分析 | 第98-99页 |
| 3 小结与讨论 | 第99-100页 |
| 第六章 结论与展望 | 第100-103页 |
| 1 结论 | 第100-101页 |
| 2 展望 | 第101-103页 |
| 2.1 OsCYP2和OsZFP基因双敲除突变体对侧根发育影响 | 第101页 |
| 2.2 OsZFP基因表达模式及启动子分析 | 第101页 |
| 2.3 OsCYP2和OsZFP基因转录调控因子的筛选与鉴定 | 第101-102页 |
| 2.4 与OsZFP蛋白互作的靶蛋白筛选与鉴定 | 第102-103页 |
| 参考文献 | 第103-115页 |
| 博士期间发表论著 | 第115页 |
