| 摘要 | 第1-11页 |
| Abstract | 第11-27页 |
| 符号说明 | 第27-30页 |
| 第一章 基于血清原发性肝癌甲基化谱的筛选 | 第30-80页 |
| 第一节 引言 | 第30-45页 |
| 第二节 实验材料和方法 | 第45-59页 |
| ·标本收集 | 第45-46页 |
| ·DNA 的提取 | 第46-47页 |
| ·重亚硫酸盐转换 | 第47-48页 |
| ·Human Methylation 450K 芯片检测 | 第48-54页 |
| ·重亚硫酸盐测序验证 | 第54-56页 |
| ·数据分析 | 第56-59页 |
| 第三节 实验结果 | 第59-72页 |
| ·全基因组甲基化水平对比 | 第59-60页 |
| ·差异甲基化位点的染色体分布 | 第60-64页 |
| ·差异甲基化位点的基因分布 | 第64-65页 |
| ·超甲基化位点的筛选和聚类分析 | 第65-66页 |
| ·基因本体论和基因功能富集分析 | 第66-67页 |
| ·基因间相互关系分析 | 第67-69页 |
| ·超甲基化位点的验证 | 第69-72页 |
| 第四节 讨论 | 第72-79页 |
| 第五节 结论 | 第79-80页 |
| 第二章 基于外周血原发性肝细胞癌诊断模型的建立 | 第80-135页 |
| 第一节 引言 | 第80-89页 |
| 第二节 实验材料和方法 | 第89-107页 |
| ·样本的纳入要求及分组 | 第89页 |
| ·外周血样品总 RNA 的提取 | 第89-90页 |
| ·cDNA 的合成与纯化 | 第90-92页 |
| ·cRNA 的合成与纯化 | 第92-94页 |
| ·cRNA 的片段化 | 第94页 |
| ·芯片的杂交 | 第94-95页 |
| ·芯片的洗脱和染色 | 第95-96页 |
| ·芯片的扫描及数据分析 | 第96页 |
| ·GeXP 单个基因扩增 | 第96-97页 |
| ·GeXP 多重基因扩增 | 第97-99页 |
| ·多基因联合分析 | 第99-107页 |
| 第三节 实验结果 | 第107-123页 |
| ·基因芯片的质量控制 | 第107-108页 |
| ·差异基因的筛选 | 第108-110页 |
| ·GenomeLab GeXP Genetic system 单重检测基因特异性 | 第110页 |
| ·GenomeLab GeXP Genetic Analysis system 同时检测多个基因 | 第110-112页 |
| ·利用 GeXP 技术检测 5 个不同样品组的基因表达水平 | 第112-113页 |
| ·利用多参数联合检测技术和 GeXP 技术结合建立诊断模型 | 第113-115页 |
| ·基于基因芯片、外周血、GeXP 技术和多参数联合分析诊断策略 | 第115-116页 |
| ·单个基因用于区分正常组和肝癌组的诊断价值 | 第116-117页 |
| ·多个基因利用二元 Logistic 回归评价其区分正常组和肝癌组的诊断价值 | 第117-118页 |
| ·多个基因利用判别分析评价其区分正常组和肝癌组的诊断价值 | 第118-119页 |
| ·多个基因利用分类树评价其区分正常组和肝癌组的诊断价值 | 第119-120页 |
| ·多个基因利用人工神经网络评价其区分正常组和肝癌组的诊断价值 | 第120-121页 |
| ·不同多基因诊断模型联合分析的比较及模型验证 | 第121-123页 |
| 第四节 讨论 | 第123-132页 |
| 第五节 结论 | 第132-135页 |
| 第三章 基于血清多指标联合分析辅助诊断恶性肿瘤 | 第135-194页 |
| 第一节 引言 | 第135-153页 |
| 第二节 实验材料和方法 | 第153-169页 |
| ·实验样品的选择 | 第153-154页 |
| ·血清生化及免疫指标的检测 | 第154-159页 |
| ·血清细胞因子的检测 | 第159-163页 |
| ·多参数联合诊断区分正常组和疾病组，良性疾病和肿瘤组 | 第163-169页 |
| 第三节 实验结果 | 第169-188页 |
| ·健康对照组和疾病组指标检测 | 第169-170页 |
| ·健康对照组和疾病组差异指标 ROC 曲线分析 | 第170-172页 |
| ·健康对照组和疾病组具有诊断能力的 20 项指标相关性分析 | 第172页 |
| ·多项指标二元 Logistic 回归分析区分健康对照组和疾病组 | 第172-174页 |
| ·多项指标判别分析区分健康对照组和疾病组 | 第174-176页 |
| ·多项指标分类树分析区分健康对照组和疾病组 | 第176-177页 |
| ·多项指标人工神经网络区分健康对照组和疾病组 | 第177-178页 |
| ·评价单项指标和多指标联合检测区分健康对照组和疾病组 | 第178-179页 |
| ·良性疾病组和肿瘤组指标检测 | 第179-181页 |
| ·良性疾病组和肿瘤组指标差异指标 ROC 曲线分析 | 第181-182页 |
| ·多项指标二元 Logistic 回归分析区分良性疾病组和肿瘤组 | 第182-183页 |
| ·多项指标判别分析区分良性疾病组和肿瘤组 | 第183-184页 |
| ·多项指标分类树分析区分良性疾病组和肿瘤组 | 第184-186页 |
| ·多项指标人工神经网络分析区分良性疾病组和肿瘤组 | 第186-188页 |
| 第四节 讨论 | 第188-194页 |
| 附录 1 | 第194-197页 |
| 附录 2 | 第197-199页 |
| 附录 3 | 第199-201页 |
| 附录 4 | 第201-244页 |
| 附录 5 | 第244-267页 |
| 参考文献 | 第267-310页 |
| 致谢 | 第310-313页 |
| 个人简历 | 第313-317页 |
