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基于高通量测序的瓜叶菊花青素苷合成途径研究

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-9页
英文缩略表第9-15页
1 绪论第15-30页
   ·花青素苷的结构和种类第15-16页
   ·花青素苷合成途径及其分支特点第16-18页
     ·花青素苷合成途径第16-17页
     ·花青素苷合成途径分支特点第17-18页
   ·花青素苷合成途径分支的遗传调控第18-24页
     ·多个酶作用于相同底物促进分支第18-20页
     ·不同底物特异性维持不同分支途径第20-22页
     ·多基因家族的不同成员支持不同分支途径第22页
     ·花青素苷分支途径的重建第22-24页
   ·转录因子对花青素苷合成途径的调控第24-25页
   ·花青素苷的转运第25-26页
   ·转录组测序在植物次生代谢调控研究中的应用第26-28页
   ·本研究的设计思想第28-29页
     ·本研究的目的、意义第28页
     ·研究内容第28-29页
   ·本研究的技术路线第29-30页
2 瓜叶菊舌状花花青素苷成分及含量分析第30-35页
   ·材料与方法第30-32页
     ·材料处理第30-31页
     ·花青素苷的提取第31-32页
     ·瓜叶菊舌状花中花青素苷含量测定及定量分析第32页
   ·结果与分析第32-34页
   ·讨论第34页
   ·小结第34-35页
3 蓝色瓜叶菊转录组测序及花青素苷相关基因挖掘第35-48页
   ·材料与方法第35-37页
     ·样品采集及RNA提取第35页
     ·RNA样品质量检测第35页
     ·文库制备第35页
     ·文库测序第35-36页
     ·序列组装第36页
     ·功能注释第36-37页
   ·结果与分析第37-44页
     ·转录组序列组装及分析第37-39页
     ·转录组功能注释第39-41页
     ·瓜叶菊花青素苷相关基因分析第41-44页
   ·讨论第44-47页
     ·瓜叶菊舌状花转录组数据库及功能注释的评价第44-45页
     ·瓜叶菊花青素苷相关基因挖掘第45-47页
   ·小结第47-48页
4 瓜叶菊qPCR分析中内参基因选择第48-57页
   ·材料与方法第48-50页
     ·植物材料第48页
     ·RNA提取、质量检测及cDNA合成第48页
     ·qPCR引物设计第48页
     ·qPCR反应第48-50页
     ·数据分析第50页
     ·内参基因的验证第50页
   ·结果与分析第50-54页
     ·候选内参基因引物评价第50页
     ·候选内参基因的表达水平分析第50-51页
     ·内参基因的稳定性分析第51-53页
     ·内参基因的稳定性验证第53-54页
   ·讨论第54-55页
   ·小结第55-57页
5 结构基因对瓜叶菊花青素苷合成途径不同分支的影响第57-79页
   ·材料与方法第57-61页
     ·植物材料及菌株第57页
     ·RNA,DNA提取及cDNA的合成第57页
     ·qPCR引物设计第57页
     ·qPCR反应第57页
     ·qPCR数据分析第57页
     ·生物信息学分析第57-59页
     ·3’RACE及cDNA和gDNA全长扩增第59页
     ·DFR原核表达载体的构建第59-60页
     ·DFR重组蛋白的诱导表达及检测第60-61页
   ·结果与分析第61-73页
     ·花青素苷合成途径结构基因不同成员的表达模式分析第61-66页
     ·瓜叶菊花青素苷合成途径结构基因表达谱聚类分析第66-67页
     ·ScF3’5 H和ScGT2的基因组序列特征第67-69页
     ·DFR的原核表达第69-73页
   ·讨论第73-78页
     ·多基因家族中的特定成员参与花青素苷合成途径第73页
     ·参与不同花青素苷分支途径的主要成员第73页
     ·瓜叶菊花青素苷不同分支途径竞争机制第73-76页
     ·ScF3’5 H和ScGT2的基因组序列特征对基因表达的影响第76-77页
     ·竞争酶编码基因ScFLS对花青素苷分支途径的影响第77页
     ·DFR对花青素苷合成的影响第77-78页
   ·小结第78-79页
6 调控瓜叶菊花青素苷合成途径转录因子的筛选第79-85页
   ·材料与方法第79-80页
     ·植物材料第79页
     ·RNA提取及cDNA的合成第79页
     ·qPCR引物设计第79页
     ·qPCR反应第79页
     ·qPCR数据分析第79页
     ·生物信息学分析第79-80页
   ·结果与分析第80-83页
     ·ScBHLH表达模式分析第80-82页
     ·ScMYB表达模式分析第82-83页
   ·讨论第83-84页
   ·小结第84-85页
7 瓜叶菊谷胱甘肽转移酶基因GST的分离及表达分析第85-94页
   ·材料与方法第85-86页
     ·材料处理第85页
     ·目的基因全长序列的克隆第85页
     ·表达模式分析第85-86页
     ·生物信息学分析第86页
   ·结果与分析第86-92页
     ·瓜叶菊GST基因家族中与花青素苷相关的成员第86-88页
     ·瓜叶菊ScGST3基因的cDNA和DNA序列结构特征第88-90页
     ·ScGST3表达模式的特点第90-92页
   ·讨论第92-93页
   ·小结第93-94页
8. 结论与展望第94-98页
   ·主要结论第94页
   ·瓜叶菊花青素苷合成途径主要特点第94-95页
   ·创新点第95-96页
   ·展望第96-98页
参考文献第98-113页
附录第113-121页
个人简介第121-122页
获得的研究成果第122-123页
导师简介第123-124页
致谢第124-125页

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