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玉米丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶2C基因ZmPP2Cα的克隆及其在干旱胁迫下的表达特性

中文摘要第1-12页
英文摘要第12-15页
缩写词及中英文对照第15-16页
第一章 文献综述第16-50页
 1 植物水分胁迫信号转导第16-30页
   ·水分胁迫诱导表达的基因第17-21页
     ·调控蛋白第17-18页
     ·功能蛋白第18-21页
       ·渗调蛋白第18页
       ·脱水保护蛋白第18-19页
       ·运输蛋白第19-20页
       ·代谢酶类第20页
       ·植物活性氧清除蛋白第20-21页
       ·与保护细胞结构相关的酶类第21页
   ·水分胁迫应答基因的表达调控第21-24页
     ·启动子第21-22页
     ·转录水平第22-23页
       ·依赖ABA且需要蛋白质合成的表达途径(Ⅰ)第22-23页
       ·依赖ABA且不需要蛋白质合成的表达途径(Ⅱ)第23页
       ·不依赖ABA的诱导基因表达途径(Ⅲ、Ⅳ)第23页
     ·转录后水平调控第23-24页
   ·水分胁迫信号识别与转导第24-27页
     ·水分胁迫的信号识别第24-25页
     ·水分胁迫的信号转导第25-27页
       ·促分裂原活化蛋白激酶(MAPK)途径第25页
       ·钙依赖型蛋白激酶(CDPK)途径第25-26页
       ·PP2C类蛋白磷酸酶参与ABA通路的信号传导途径第26-27页
       ·酪氨酸蛋白磷酸酶(PTPase)参与ABA通路的信号传导途径第27页
   ·玉米水分胁迫应答基因的研究现状第27-30页
     ·玉米抗旱节水相关基因的分子标记研究第27-29页
     ·玉米水分胁迫应答基因的研究和克隆第29-30页
 2 高等植物的丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶2C第30-37页
   ·蛋白可逆磷酸化在生物信号传递中的作用第30-31页
   ·蛋白磷酸酶的分类第31-32页
   ·PP2C的理化性质第32页
   ·PP2C基因及其蛋白质结构特征第32-34页
   ·PP2C在高等植物中的功能与作用第34-37页
     ·PP2C参与脱落酸(ABA)信号途径第34-36页
       ·PP2C参与ABA调控的种子休眠/萌发信号途径第34-35页
       ·PP2C参与ABA调控的气孔关闭信号转导途径第35页
       ·PP2C参与ABA调控的抗逆信号转导途径第35-36页
     ·PP2C参与植物创伤信号途径第36页
     ·PP2C参与植物的发育第36页
     ·PP2C参与植物的抗病信号途径第36-37页
       ·PP2C作为转录因子作用第36-37页
       ·PP2C在植物细胞壁修饰中的作用第37页
 3 转录水平上基因定量(mRNA丰度)分析的常规方第37-44页
   ·Northern印迹(Northern Blotting Hybridization)第37-38页
   ·基因芯片技术第38页
   ·核糖核酸酶保护试验(ribonuclease protection assay,RPA)第38-39页
   ·实时荧光定量PCR第39-44页
     ·实时荧光定量PCR原理第39-41页
     ·定量理论第41页
       ·理论模式第41页
       ·绝对定量和相对定量第41页
     ·实时荧光定量PCR常见方法第41-43页
       ·荧光嵌合法(SYBR Green Ⅰ法)第41-42页
       ·荧光探针法第42-43页
     ·实时荧光定量PCR在植物研究中的应用第43-44页
 4 获取基因全长cDNA的方法及其进展第44-49页
   ·cDNA文库筛选法第44-45页
   ·cDNA末端快速扩增((Rapid amplification of cDNA ends,RACE)法第45页
   ·电子克隆(In silico cloning)第45-47页
   ·获取全长cDNA的其它方法第47-49页
     ·长距离PCR技术(Long PCR)第47页
     ·反向PCR(Inverse PCR,IPCR)第47页
     ·捕获/寡合介导PCR第47-48页
     ·载体介导的PCR(Vectorette PCR)第48页
     ·热不对称交错PCR第48页
     ·单核苷酸套式PCR第48-49页
 5 本研究的目标第49-50页
第二章 玉米ZmPP2Ca基因全长cDNA的序列克隆第50-79页
 引言第50页
 1 材料第50-53页
   ·植物材料第50-51页
   ·载体与菌株第51页
   ·网络资源与应用软件第51页
   ·主要药品和试剂第51页
   ·主要仪器第51-52页
   ·所用溶液以及配制第52-53页
     ·RNA提取试剂的配制第52页
     ·基因组DNA提取试剂的配制第52页
     ·克隆试剂的配制第52-53页
 2 实验方法第53-59页
   ·MD2片段的cDNA全序列的克第53-57页
     ·运用电子克隆的方法拼接MD2片段的cDNA全长序列第53页
     ·引物的设计第53-54页
     ·玉米叶片总RNA的提取第54页
     ·RT-PCR第54-56页
       ·cDNA第一链合成第54-55页
       ·PCR法第55-56页
       ·电泳检测第56页
     ·基因cDNA的克隆与鉴定第56-57页
       ·目的片段的回收与纯化第56页
       ·末端平滑DNA片段的3’末端加"A"反应第56页
       ·连接反应第56-57页
       ·质粒DNA的转化第57页
       ·重组菌落的鉴定与保存第57页
   ·测序及序列生物信息学分析第57-59页
     ·测序及部分特性分析第57-58页
     ·MD2基因片段的基因组序列分析第58页
       ·玉米叶片基因组DNA的提取第58页
       ·基因组序列的获得及内含子剪接特性分析第58页
     ·蛋白质性质分析与结构预测第58-59页
       ·氨基酸组成、分子量和等电点分析第58-59页
       ·蛋白质的保守结构域分析第59页
       ·蛋白质序列特征分析第59页
       ·蛋白质亚细胞定位第59页
 3 结果与分析第59-74页
   ·玉米PP2C新基因的克隆第59-62页
     ·MD2基因片段的电子延伸第59页
     ·玉米叶片总RNA和第一链cDNA的质量第59-60页
     ·电子克隆序列的验证第60-61页
     ·重组菌落的PCR鉴定第61-62页
   ·测序及序列生物信息学分析第62-74页
     ·PP2C基因的序列测定及部分特性分析第62-66页
     ·ZmPP2Cα基因编码一个新型的玉米PP2C蛋白第66页
     ·玉米ZmPP2Cα基因存在选择性剪接第66-71页
     ·ZmPP2Cα基因的QH1转录本参与玉米干旱胁迫反应第71页
     ·ZmPP2Cα基因的系统遗传学分析第71-72页
     ·ZmPP2Cα基因的蛋白质性质分析及结构功能预测第72-74页
       ·蛋白质基本性质分析第72-73页
       ·保守结构域分析第73页
       ·蛋白质序列特征分析第73页
       ·蛋白的亚细胞定位第73-74页
 4 讨论第74-78页
   ·玉米ZmPP2Cα基因的电子延伸第74-75页
   ·引物的设计第75页
   ·克隆测序第75-76页
   ·ZmPP2Cα基因的选择性剪接第76-78页
   ·ZmPP2Cα基因的可能参与的信号转导通路第78页
 5 小结第78-79页
第三章 玉米ZmPP2Cα基因的表达特性第79-94页
 引言第79页
 1 材料第79-80页
   ·植物材料第79页
   ·载体与菌株第79页
   ·主要试剂和试剂盒第79页
   ·主要仪器与耗材第79-80页
   ·所用溶液及其配制第80页
 2 实验方法第80-83页
   ·ZmPP2Cα基因在干旱胁迫下的表达特性第80-83页
     ·材料培养与干旱处理第80页
     ·玉米叶片总RNA的提取第80页
     ·引物设计第80页
     ·cDNA第一链合成第80-81页
     ·实时荧光定量PCR引物的特异性检测第81页
     ·定量标准品的制备第81-82页
     ·FQ-PCR反应及分析第82-83页
     ·统计分析第83页
   ·ZmPP2Cα基因在不同玉米组织中的表达特性第83页
 3 结果与分析第83-87页
   ·总RNA的浓度和纯度鉴定第83-84页
   ·ZmPP2Cα基因在干旱胁迫下的表达模式第84-86页
     ·常规PCR扩增结果第84-85页
     ·定量PCR的熔点曲线和标准曲线分析第85-86页
     ·定量PCR结果第86页
   ·ZmPP2Cα基因的组织表达特性第86-87页
 4 讨论第87-92页
   ·材料的干旱处理及其对玉米锈病的抗性第87-88页
   ·RNA的制备与检测第88-89页
   ·使用SYBR Green Ⅰ嵌合荧光法进行real-time PCR的条件优化第89-90页
   ·内参基因的选择第90-91页
   ·定量PCR实验中应该注意的几个问题第91页
   ·ZmPP2Cα基因在干旱胁迫下的表达模式第91-92页
   ·ZmPP2Cα基因的组织表达特性第92页
 5 小结第92-94页
第四章 本文今后的研究方向第94-95页
 1 ZmPP2Cα对金属离子的依赖性及其在ABA信号传导中作用第94页
 2 对ZmPP2Cα基因选择性剪切的2个转录本的进一步分析第94页
 3 ZmPP2Cα两个转录本编码的蛋白是否具有PP2C酶活性第94页
 4 ZmPP2Cα基因的功能验证第94页
 5 ZmPP2Cα的受体蛋白第94-95页
参考文献第95-106页
致谢第106-107页
附录1 分子生物学常用方法第107-112页
附录2 攻读博士学位期间发表的学术论文第112页

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