| 摘要 | 第1-10页 |
| ABSTRACT | 第10-13页 |
| 本文所用主要缩略词 | 第13-14页 |
| 第一部分 文献综述 | 第14-40页 |
| 第一章 棉属的起源与进化 | 第14-22页 |
| 1 二倍体棉种的起源与进化 | 第15-16页 |
| ·二倍体棉种的起源 | 第15页 |
| ·染色体组基数 | 第15页 |
| ·二倍体棉种染色体组的划分 | 第15-16页 |
| 2 异源四倍体棉种的起源 | 第16-18页 |
| ·异源四倍体棉种的起源 | 第16-17页 |
| ·异源四倍体棉的供体种 | 第17-18页 |
| 3. 棉属的分子系统进化研究 | 第18-22页 |
| ·利用分子标记技术研究棉属的进化 | 第18-19页 |
| ·利用基因组重复序列研究棉属的进化 | 第19页 |
| ·利用核基因序列研究棉属的进化 | 第19-22页 |
| 第二章 棉纤维发育相关基因的研究进展 | 第22-32页 |
| 1 棉纤维细胞发育的过程 | 第22-24页 |
| ·棉纤维起始发育 | 第22-23页 |
| ·棉纤维伸长期 | 第23页 |
| ·次生壁合成期 | 第23-24页 |
| ·成熟期 | 第24页 |
| 2 棉纤维发育相关基因研究进展 | 第24-32页 |
| ·棉纤维初始发育相关基因研究进展 | 第28-29页 |
| ·棉纤维伸长相关基因的研究进展 | 第29-30页 |
| ·棉纤维次生壁加厚相关基因的研究进展 | 第30-32页 |
| 第三章 单核苷酸多态性及其研究进展 | 第32-38页 |
| 1 SNPs的定义及特点 | 第32-33页 |
| 2 SNPs的发掘方法 | 第33-34页 |
| ·PCR产物直接测序法 | 第33页 |
| ·生物信息学方法 | 第33-34页 |
| 3 SNP的检测 | 第34-35页 |
| ·非特异性SNP的检测 | 第34页 |
| ·序列特异性SNP的检测 | 第34-35页 |
| 4 SNP的应用 | 第35-38页 |
| ·高密度遗传图谱的构建 | 第35-36页 |
| ·基因定位 | 第36页 |
| ·品种鉴定与系统进化研究 | 第36-38页 |
| 本研究的目的和意义 | 第38-40页 |
| 第二部分 研究报告 | 第40-106页 |
| 第四章 棉属二倍体D染色体组种间亲缘关系分析及与四倍体种中D染色体亚组关系研究 | 第40-58页 |
| 1 材料和方法 | 第41-45页 |
| ·材料及基因组DNA的提取 | 第41页 |
| ·EST-SSR引物的选取 | 第41-42页 |
| ·PCR扩增及检测 | 第42页 |
| ·DNA片段的回收及测序 | 第42-45页 |
| ·序列分析 | 第45页 |
| 2 结果与分析 | 第45-55页 |
| ·扩增产物 | 第45-47页 |
| ·SSR区域多态性 | 第47页 |
| ·SSR侧翼序列的多态性 | 第47-48页 |
| ·二倍体D染色体组棉种的系统进化分析 | 第48页 |
| ·异源四倍体AD染色体组棉种的系统进化分析 | 第48-49页 |
| ·二倍体D染色体组在异源四倍体AD染色体组棉种中的作用 | 第49-55页 |
| 3. 讨论 | 第55-58页 |
| ·EST-SSR序列分析是区分不同棉种间遗传差异的有效方法 | 第55页 |
| ·利用EST-SSR序列揭示棉属二倍体D染色体组和异源四倍体中D染色体亚组的关系 | 第55-58页 |
| 第五章 纤维发育相关基因在海陆栽培棉种间的分化研究 | 第58-106页 |
| 1 材料和方法 | 第59-74页 |
| ·供试材料及其基因组DNA的提取 | 第59-60页 |
| ·所选基因及引物设计 | 第60页 |
| ·PCR扩增及产物回收、克隆、测序 | 第60页 |
| ·基因结构及进化分析 | 第60-66页 |
| ·SNAP标记开发 | 第66-67页 |
| ·利用[(TM-1×Hai7124)×TM-1]BC_1群体的基因定位 | 第67页 |
| ·RNA的提取及实时荧光定量PCR | 第67-74页 |
| 2. 结果与分析 | 第74-94页 |
| ·供试棉种中19个基因的克隆 | 第74-75页 |
| ·供试棉种中19个基因的结构分析 | 第75-77页 |
| ·供试棉种中19个基因的聚类分析 | 第77-85页 |
| ·19对部分同源基因的染色体定位 | 第85页 |
| ·供试棉种中19个基因的进化速率分析 | 第85-92页 |
| ·海陆栽培种中19个基因的Q-PCR分析 | 第92-93页 |
| ·海陆栽培种各亚组中19个基因的Q-PCR分析 | 第93-94页 |
| 3. 讨论 | 第94-106页 |
| ·异源四倍体棉种的驯化 | 第94-95页 |
| ·异源四倍体中棉纤维发育相关基因的进化模式 | 第95页 |
| ·异源四倍体棉种中重复基因的进化命运 | 第95-97页 |
| ·棉纤维发育相关基因在陆地棉和海岛棉之间表达差异 | 第97-98页 |
| ·各亚组对TM-1和海7124种间转录差异的贡献 | 第98-106页 |
| 全文结论 | 第106-108页 |
| 参考文献 | 第108-124页 |
| 附录 | 第124-146页 |
| 致谢 | 第146-148页 |
| 攻读学位期间发表学术论文 | 第148页 |
