| 中文摘要 | 第3-7页 |
| Abstract | 第7-12页 |
| 缩略词表 | 第17-19页 |
| 第一章 文献综述 | 第19-31页 |
| 1 脂肪的研究进展 | 第19-22页 |
| 1.1 脂肪沉积的意义 | 第19页 |
| 1.2 脂肪的分布 | 第19页 |
| 1.3 畜禽脂肪的研究进展 | 第19-20页 |
| 1.4 禽类脂肪细胞研究进展 | 第20-22页 |
| 2 全基因组测序研究进展 | 第22-30页 |
| 2.1 高通量测序技术的发展 | 第22-23页 |
| 2.2 全基因组关联分析(GWAS)的研究进展 | 第23-27页 |
| 2.3 全转录组测序的应用 | 第27-30页 |
| 3 本研究的目的与意义 | 第30-31页 |
| 第二章 鸭前脂肪细胞诱导成脂模型的建立 | 第31-42页 |
| 1 引言 | 第31页 |
| 2 试验材料 | 第31-32页 |
| 2.1 实验动物 | 第31页 |
| 2.2 主要试剂与仪器 | 第31-32页 |
| 3 试验方法 | 第32-34页 |
| 3.1 鸭前脂肪细胞的分离培养 | 第32页 |
| 3.2 前脂肪细胞的传代与诱导分化 | 第32页 |
| 3.3 TG含量测定 | 第32-33页 |
| 3.4 油红O染色 | 第33页 |
| 3.5 细胞的增殖 | 第33-34页 |
| 3.6 数据分析及处理 | 第34页 |
| 4 结果 | 第34-40页 |
| 4.1 鸭前脂肪细胞的鉴定 | 第34页 |
| 4.2 前脂肪细胞的增殖变化 | 第34-36页 |
| 4.3 甘油三酯在诱导过程的变化 | 第36-37页 |
| 4.4 油酸对脂肪细胞分化与成脂的影响 | 第37-38页 |
| 4.5 不同品种鸭前脂肪细胞分化的差异比较 | 第38-40页 |
| 5 讨论 | 第40-42页 |
| 第三章 基于转录组测序技术筛选鸭成脂关键基因 | 第42-80页 |
| 1 引言 | 第42页 |
| 2 试验材料 | 第42-43页 |
| 2.1 实验动物 | 第42页 |
| 2.2 主要仪器与试剂 | 第42-43页 |
| 3 试验方法 | 第43-55页 |
| 3.1 样品的准备 | 第43页 |
| 3.2 总RNA的提取及反转录 | 第43页 |
| 3.3 cDNA文库的构建及测序 | 第43-44页 |
| 3.4 测序数据的质量控制 | 第44-45页 |
| 3.5 比对到参考基因组 | 第45页 |
| 3.6 分子RNA的筛选鉴定与分析 | 第45-47页 |
| 3.7 测序结果的验证 | 第47-53页 |
| 3.8 候选mRNA的功能分析 | 第53页 |
| 3.9 竞争性内源机制(Competitive endogenous)分析 | 第53页 |
| 3.10 功能基因的验证 | 第53-55页 |
| 4 结果 | 第55-77页 |
| 4.1 RNA的提取与质检 | 第55-56页 |
| 4.2 测序数据的质量评估 | 第56-57页 |
| 4.3 参考基因组比对 | 第57-61页 |
| 4.4 差异表达RNA的筛选及分析 | 第61-66页 |
| 4.5 荧光定量PCR验证测序结果 | 第66页 |
| 4.6 基因功能注释 | 第66-70页 |
| 4.7 竞争性内源机制(Competitive endogenous)分析 | 第70-71页 |
| 4.8 验证鸭前脂肪细胞成脂过程相关基因的表达变化 | 第71-72页 |
| 4.9 不同品种的前脂肪细胞成脂过程的差异 | 第72-75页 |
| 4.10 PPARγ在前脂肪细胞诱导成脂过程的作用 | 第75-77页 |
| 5 讨论 | 第77-80页 |
| 第四章 基于全基因组关联分析挖掘影响脂肪性状的候选基因及其调控通路 | 第80-101页 |
| 1 引言 | 第80页 |
| 2 试验材料 | 第80-81页 |
| 2.1 实验动物 | 第80-81页 |
| 2.2 主要仪器 | 第81页 |
| 3 试验方法 | 第81-85页 |
| 3.1 样本采集与性状测定 | 第81页 |
| 3.2 鸭血液基因组DNA的提取 | 第81-82页 |
| 3.3 全基因组关联分析 | 第82-85页 |
| 3.4 功能富集分析 | 第85页 |
| 4 结果与分析 | 第85-98页 |
| 4.1 鸭肌内脂肪与腹脂重表型数据的分析结果 | 第85-86页 |
| 4.2 基因组DNA检测结果 | 第86-87页 |
| 4.3 SNP分型及质量控制 | 第87页 |
| 4.4 群体结构 | 第87-91页 |
| 4.5 全基因组关联分析结果 | 第91-96页 |
| 4.6 功能富集分析 | 第96-98页 |
| 5 讨论 | 第98-101页 |
| 5.1 F2代资源群体 | 第98-99页 |
| 5.2 分析模型的讨论 | 第99页 |
| 5.3 脂肪性状全基因组关联分析 | 第99-101页 |
| 第五章 转录组与GWAS联合分析鉴定脂肪关键基因 | 第101-105页 |
| 0 前言 | 第101页 |
| 1 试验材料 | 第101页 |
| 2 试验方法 | 第101页 |
| 2.1 筛选关键基因 | 第101页 |
| 2.2 基因的功能分析 | 第101页 |
| 3 结果 | 第101-103页 |
| 3.1 GWAS筛选关键基因与转录组差异基因交集基因 | 第101-102页 |
| 3.2 影响脂肪沉积的候选功能基因及其调控通路 | 第102-103页 |
| 4 讨论 | 第103-105页 |
| 全文结论 | 第105页 |
| 创新点 | 第105-106页 |
| 进一步工作设想 | 第106-107页 |
| 参考文献 | 第107-119页 |
| 致谢 | 第119-120页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第120-121页 |
