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抗生素及其耐药性在畜禽粪便-土壤-蔬菜中的传播和转移

摘要第5-8页
ABSTRACT第8-11页
第一章 前言第17-33页
    1.1 环境中的抗生素污染第17-20页
        1.1.1 概述第17页
        1.1.2 环境中抗生素的来源第17-18页
        1.1.3 环境中抗生素的污染现状第18-19页
        1.1.4 环境中抗生素污染引发的问题第19-20页
    1.2 农田生态系统中的抗生素污染及耐药性传播第20-27页
        1.2.1 抗生素在农牧业生产中的应用第20-21页
        1.2.2 抗生素进入农田生态系统的途径第21-23页
        1.2.3 抗生素在农田生态系统中的迁移转化第23-25页
        1.2.4 粪源抗生素耐药性及其在土壤环境中的传播第25-27页
    1.3 抗生素及其耐药性在植物中的传播对农作物的影响第27-28页
        1.3.1 植物对抗生素的吸收第27-28页
        1.3.2 抗生素对植物的生态毒性第28页
    1.4 植物内生菌简介第28-29页
    1.5 环境样品中抗生素耐药基因的研究方法第29-30页
    1.6 研究目的及意义第30-33页
第二章 畜禽粪便和施肥土壤的抗生素残留及耐药基因污染第33-53页
    2.1 引言第33-34页
    2.2 材料与方法第34-40页
        2.2.1 化学试剂和标准品第34-35页
        2.2.2 样品选择第35-36页
        2.2.3 抗生素提取及分析第36-37页
        2.2.4 DNA提取,纯化及GeoChip分析第37-38页
        2.2.5 耐药基因的定量分析第38-40页
        2.2.6 统计分析第40页
    2.3 结果与分析第40-48页
        2.3.1 畜禽粪便及土壤中的抗生素残留第40-43页
        2.3.2 畜禽粪便及土壤中的抗生素耐药功能基因多样性第43-46页
        2.3.3 畜禽粪便及土壤中抗生素耐药基因的丰度第46-48页
    2.4 讨论第48-51页
    2.5 小结第51-53页
第三章 简单堆肥过程中抗生素耐药性的动态变化第53-69页
    3.1 引言第53-54页
    3.2 材料与方法第54-57页
        3.2.1 化学试剂及标准品第54页
        3.2.2 堆肥试验第54-55页
        3.2.3 抗生素检测第55-56页
        3.2.4 总可培养异养细菌及多重耐药细菌计数第56页
        3.2.5 DNA提取,PCR检测和耐药基因的定量分析第56-57页
        3.2.6 耐药基因的定量分析第57页
    3.3 结果与分析第57-63页
        3.3.1 堆肥过程中抗生素的降解第57-59页
        3.3.2 堆肥对总可培养异养细菌和多重耐药细菌的影响第59-60页
        3.3.3 堆肥过程中耐药基因的丰度变化第60-63页
    3.4 讨论第63-67页
    3.5 小结第67-69页
第四章 水培条件下抗生素暴露对蔬菜内生细菌耐药性的影响第69-89页
    4.1 引言第69-70页
    4.2 材料与方法第70-77页
        4.2.1 化学试剂第70-71页
        4.2.2 水培实验过程第71-72页
        4.2.3 生长参数的测量第72-73页
        4.2.4 抗生素分析第73页
        4.2.5 计数总可培养内生细菌和抗生素耐药内生细菌第73-74页
        4.2.6 DNA提取,PCR检测和耐药基因的定量分析第74-77页
    4.3 结果与分析第77-84页
        4.3.1 抗生素暴露对小白菜生长的影响第77-81页
        4.3.2 小白菜对抗生素的吸收第81-82页
        4.3.3 抗生素暴露对小白菜中耐药内生细菌的影响第82-83页
        4.3.4 小白菜内生系统中抗生素耐药基因的丰度第83-84页
    4.4 讨论第84-87页
    4.5 小结第87-89页
第五章 粪源多重耐药细菌和耐药基因通过土壤-植物根际向蔬菜内生系统的转移和定植第89-107页
    5.1 引言第89-90页
    5.2 材料与方法第90-95页
        5.2.1 抗生素及供试蔬菜第90页
        5.2.2 多重耐药细菌、鸡粪、有机肥及土壤样品第90-91页
        5.2.3 盆栽实验过程第91-92页
        5.2.4 计数蔬菜中总可培养内生细菌及多重耐药内生细菌第92页
        5.2.5 蔬菜及土壤样品中可培养多重耐药细菌的鉴定第92页
        5.2.6 蔬菜及土壤样品总DNA提取及高通量测序分析第92-93页
        5.2.7 耐药基因定量分析第93-95页
    5.3 结果与分析第95-102页
        5.3.1 添加粪肥或抗生素耐药菌群对蔬菜内生耐药细菌的影响第95-96页
        5.3.2 蔬菜及土壤中的多重耐药细菌第96-98页
        5.3.3 蔬菜内生细菌的群落结构第98-99页
        5.3.4 蔬菜内生系统中抗生素耐药基因的丰度第99-102页
    5.4 讨论第102-105页
    5.5 小结第105-107页
第六章 研究结论及展望第107-109页
    6.1 研究结论第107-108页
    6.2 研究展望第108-109页
参考文献第109-141页
致谢第141-143页
攻读学位期间发表的学术论文目录第143-144页

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