| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 研究背景 | 第10-14页 |
| 1. 菌根 | 第10页 |
| 2. “非菌根植物” | 第10-11页 |
| 3. AMF和DSE及其分布 | 第11-12页 |
| 4. 研究目的和技术路线 | 第12-14页 |
| 第二章 “非菌根植物”AMF及DSE定殖情况调查和DSE的分离 | 第14-31页 |
| 1. 材料与方法 | 第14-18页 |
| 1.1 样地介绍 | 第14-15页 |
| 1.2 样本采集 | 第15页 |
| 1.3 根样处理 | 第15-16页 |
| 1.3.1 AMF及DSE定殖情况调查 | 第15页 |
| 1.3.2 深色有隔内生真菌的分离 | 第15-16页 |
| 1.4 菌株的鉴定 | 第16-18页 |
| 1.4.1 菌株的形态学鉴定 | 第16页 |
| 1.4.2 菌株的分子生物学鉴定 | 第16-18页 |
| 1.4.2.1 CTAB法提取DNA | 第16-17页 |
| 1.4.2.2 PCR扩增 | 第17页 |
| 1.4.2.3 PCR产物测定 | 第17页 |
| 1.4.2.4 序列分析 | 第17-18页 |
| 1.4.2.5 分子系统树的构建 | 第18页 |
| 2 结果分析 | 第18-29页 |
| 2.1 “非菌根植物”DSE和AMF定殖情况 | 第18-23页 |
| 2.1.1 个旧矿区自然生长的“非菌根植物”根内的定殖情况 | 第18-22页 |
| 2.1.2 结果分析 | 第22-23页 |
| 2.2 DSE的分离 | 第23-29页 |
| 2.2.1 菌株分离情况 | 第23-26页 |
| 2.2.2 分离菌株的分子鉴定 | 第26-29页 |
| 3 讨论 | 第29-31页 |
| 第三章 中华山蓼(Oxyria sinensis)AMF及DSE定殖情况调查和DSE的分离 | 第31-38页 |
| 1. 材料与方法 | 第31-32页 |
| 1.1 样地介绍 | 第31页 |
| 1.2 样本采集 | 第31-32页 |
| 1.3 根样处理 | 第32页 |
| 1.3.1 AMF及DSE定殖情况调查 | 第32页 |
| 1.3.2 内生真菌的分离 | 第32页 |
| 1.4 菌株的鉴定 | 第32页 |
| 2 结果 | 第32-37页 |
| 2.1 “非菌根植物”DSE定殖情况 | 第32-33页 |
| 2.2 DSE的分离 | 第33-37页 |
| 2.2.1 中华山蓼菌株分离情况 | 第33-34页 |
| 2.2.2 中华山蓼分离菌株的分子鉴定 | 第34-37页 |
| 3 讨论 | 第37-38页 |
| 第四章 中华山蓼(Oxyria sinensis)根内生真菌多样性分析 | 第38-56页 |
| 1 材料与方法 | 第38-39页 |
| 1.1 材料采集 | 第38页 |
| 1.2 植物根总DNA的提取和PCR扩增 | 第38-39页 |
| 1.2.1 植物根总DNA的提取 | 第38-39页 |
| 1.2.2 PCR产物的混样和纯化 | 第39页 |
| 1.2.3 文库构建和上机测序 | 第39页 |
| 2 结果 | 第39-55页 |
| 2.1 测序数据处理 | 第39-40页 |
| 2.2 OTU聚类和物种注释 | 第40-46页 |
| 2.2.1 OTU聚类及物种注释概况 | 第41-43页 |
| 2.2.2 物种相对丰度展示 | 第43-45页 |
| 2.2.3 物种丰度聚类热图 | 第45-46页 |
| 2.3 样品复杂度分析(Alpha Diversity) | 第46-48页 |
| 2.3.1 物种多样性曲线 | 第46-48页 |
| 2.3.2 基于OTU的venn图 | 第48页 |
| 2.4 多样品比较分析(Beta Diversity) | 第48-54页 |
| 2.4.1 Beta多样性指数 | 第49-50页 |
| 2.4.2 PCA分析 | 第50-51页 |
| 2.4.3 PCoA分析 | 第51-52页 |
| 2.4.4 NMDS分析 | 第52-53页 |
| 2.4.5 样品聚类分析 | 第53-54页 |
| 2.5 统计分析(Statistics) | 第54-55页 |
| 2.5.1 LEfse分析 | 第54-55页 |
| 3 讨论 | 第55-56页 |
| 附录 | 第56-58页 |
| 参考文献 | 第58-68页 |
| 致谢 | 第68页 |
