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β-琼胶酶的纯化及新琼二糖水解酶AgWH117A结构的研究

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
0. 前言第13-21页
    0.1 琼胶及琼胶酶第13-16页
        0.1.1 琼胶第13页
        0.1.2 琼胶酶第13-16页
    0.2 琼胶寡糖第16-18页
        0.2.1 琼胶寡糖生理活性第16-17页
        0.2.2 琼胶寡糖的制备第17-18页
    0.3 琼胶酶的应用第18-19页
        0.3.1 回收琼脂糖中的DNA第18-19页
        0.3.2 制备琼胶寡糖第19页
        0.3.3 海藻生物物质的研究第19页
    0.4 本课题目的意义和主要研究内容第19-21页
        0.4.1 本课题的目的意义第19-20页
        0.4.2 本课题的主要研究内容第20-21页
1. 产琼胶酶菌株的筛选及发酵条件优化第21-33页
    1.1 引言第21页
    1.2 实验材料与仪器第21-22页
        1.2.1 原材料第21-22页
        1.2.2 主要试剂第22页
        1.2.3 培养基第22页
    1.3 实验方法第22-26页
        1.3.1 海水样品中筛选琼胶降解菌第22页
        1.3.2 从海藻中筛选琼胶降解菌第22-23页
        1.3.3 菌种保藏第23页
        1.3.4 16S rRNA物种鉴定第23页
        1.3.5 系统进化树的建立第23页
        1.3.6 琼胶酶酶学性质检测第23-24页
        1.3.7 D-半乳糖标准曲线的绘制第24-25页
        1.3.8 酶活检测条件优化第25页
        1.3.9 发酵条件的优化第25-26页
    1.4 结果与讨论第26-32页
        1.4.1 产琼胶酶菌株的筛选第26-27页
        1.4.2 16S rRNA菌株鉴定第27-28页
        1.4.3 发酵条件的优化第28-32页
    1.5 本章小结第32-33页
2. 两个Agarivorans albus OAY2来源的β-琼胶酶的纯化和酶学性质研究第33-50页
    2.1 引言第33-34页
    2.2 实验材料与仪器第34-35页
        2.2.1 材料与试剂第34-35页
        2.2.2 主要溶液的配置第35页
    2.3 实验方法第35-40页
        2.3.1 琼胶酶分离纯化流程第35-36页
        2.3.2 Agarivorans albus OAY2菌株的发酵培养第36页
        2.3.3 蛋白质标准曲线的绘制第36-37页
        2.3.4 硫酸铵分级沉淀第37页
        2.3.5 DEAE弱阴离子交换第37-38页
        2.3.6 强阴离子交换Q层析第38页
        2.3.7 SDS-PAGE凝胶电泳第38页
        2.3.8 琼胶酶酶学性质检测第38-40页
        2.3.9 基质辅助激光解析串联飞行时间质谱仪MALDI-TOF-TOF/MS第40页
    2.4 结果与讨论第40-49页
        2.4.1 硫酸铵分级沉淀第40-41页
        2.4.2 琼胶酶的纯化第41-42页
        2.4.3 温度及pH对琼胶的影响第42-45页
        2.4.4 水解产物的分析第45-47页
        2.4.5 基质辅助激光解析串联飞行时间质谱仪MALDI-TOF-TOF/MS第47-49页
    2.5 本章小结第49-50页
3. 新琼二糖水解酶AgWH117A结晶及结构分析第50-60页
    3.1 引言第50页
    3.2 实验材料与仪器第50-52页
        3.2.1 材料与试剂第50-52页
    3.3 实验方法第52-54页
        3.3.1 PET-21a-AgWH117A的诱导表达第52页
        3.3.2 AgWH117A的纯化第52-53页
        3.3.3 蛋白质浓度的测定第53页
        3.3.4 AgWH117A结晶条件的筛选第53页
        3.3.5 X-射线衍射蛋白晶体及数据收集第53-54页
        3.3.6 衍射数据处理及结构解析第54页
    3.4 结果与讨论第54-59页
        3.4.1 AgWH117A的纯化结果第54-55页
        3.4.2. 晶体筛选第55-56页
        3.4.3. 晶体解析第56页
        3.4.4 AgWH117A的整体结构第56-59页
    3.5. 本章小结第59-60页
4. 利用TK-SA模型探索影响AgWH117A热稳定性的氨基酸第60-72页
    4.1 引言第60页
    4.2 实验材料及仪器第60-62页
        4.2.1 实验试剂第60-61页
        4.2.2 实验主要仪器第61-62页
    4.3 实验方法第62-67页
        4.3.1 利用TK-SA模型计算氨基酸的能量第62页
        4.3.2 可突变氨基酸位点的选择第62-64页
        4.3.3 引物设计第64页
        4.3.4 氨基酸突变体的获得第64-66页
        4.3.5 测定突变体的酶活第66-67页
    4.4 结果与讨论第67-71页
        4.4.1 PCR获得突变DNA第67-68页
        4.4.2 突变体的纯化第68-69页
        4.4.3 新琼二糖水解酶AgWH117A及突变体热稳定性的测定第69-71页
    4.5 本章小结第71-72页
5. 结论与展望第72-74页
    5.1 结论第72-73页
    5.2 展望第73-74页
参考文献第74-83页
致谢第83-84页
个人简历第84页
发表的学术论文第84页

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