摘要 | 第2-3页 |
Abstract | 第3-4页 |
缩写词表 | 第5-9页 |
1 前言 | 第9-15页 |
1.1 叶片衰老的分子生物学研究 | 第9-11页 |
1.1.1 叶片衰老相关基因 | 第9-10页 |
1.1.2 植物激素与叶片衰老 | 第10-11页 |
1.2 蔬菜叶片衰老的调控及其机制 | 第11-14页 |
1.2.1 物理方法 | 第11-13页 |
1.2.1.1 低温 | 第11页 |
1.2.1.2 磁场与电场 | 第11-12页 |
1.2.1.3 光照 | 第12页 |
1.2.1.4 包装 | 第12-13页 |
1.2.2 化学方法 | 第13-14页 |
1.2.2.1 人工合成保鲜剂 | 第13页 |
1.2.2.2 天然保鲜剂 | 第13-14页 |
1.3 NAC转录因子与叶片衰老 | 第14页 |
1.4 研究目的与意义 | 第14-15页 |
2 材料与方法 | 第15-21页 |
2.1 供试材料与主要仪器 | 第15-16页 |
2.1.1 供试材料 | 第15页 |
2.1.2 主要试剂 | 第15页 |
2.1.3 试验仪器 | 第15-16页 |
2.2 采后处理及取样 | 第16-17页 |
2.3 生理指标的测定 | 第17页 |
2.3.1 黄化指数的测定 | 第17页 |
2.3.2 总叶绿素含量的测定 | 第17页 |
2.3.3 相对电导率的测定 | 第17页 |
2.4 菜心总RNA提取 | 第17-18页 |
2.5 RNA-SEQ及数据分析 | 第18-20页 |
2.5.1 深度质控 | 第18-19页 |
2.5.2 转录本拼接 | 第19页 |
2.5.3 转录本注释 | 第19页 |
2.5.4 转录本定量 | 第19页 |
2.5.5 差异表达分析 | 第19页 |
2.5.6 富集分析 | 第19页 |
2.5.7 叶片衰老相关基因和激素相关基因鉴定 | 第19-20页 |
2.5.8 蛋白互作网络预测 | 第20页 |
2.6 实时荧光定量PCR(QRT-PCR) | 第20-21页 |
2.6.1 cDNA(Complementary DNA)第一链的合成 | 第20页 |
2.6.2 荧光定量PCR | 第20-21页 |
2.7 数据处理与统计分析 | 第21页 |
3 结果与分析 | 第21-55页 |
3.1 菜心叶片RNA提取及质量检测 | 第21-22页 |
3.2 RNA-SEQ数据分析 | 第22-40页 |
3.2.1 测序质量评估 | 第22-29页 |
3.2.1.1 质控结果评估 | 第22-23页 |
3.2.1.2 组装结果评估 | 第23-24页 |
3.2.1.3 注释结果评估 | 第24-29页 |
3.2.2 差异表达基因的筛选及表达模式聚类 | 第29-32页 |
3.2.2.1 基因表达量估计 | 第29页 |
3.2.2.2 差异表达基因分析 | 第29-32页 |
3.2.2.3 差异基因表达趋势聚类分析 | 第32页 |
3.2.3 差异表达基因的GO显著性富集分析 | 第32-36页 |
3.2.4 差异表达基因的KEGG显著性富集分析 | 第36-38页 |
3.2.5 差异表达基因的蛋白互作网络预测 | 第38-40页 |
3.3 差异表达基因中衰老相关转录因子的鉴定 | 第40-44页 |
3.4 差异表达基因中激素信号相关基因的鉴定 | 第44-50页 |
3.5 叶片衰老过程中叶绿素降解相关基因表达变化 | 第50-51页 |
3.6 QRT-PCR验证菜心叶片衰老过程中NAC基因的表达 | 第51-55页 |
3.6.1 不同贮藏温度对菜心外观和叶片衰老的影响 | 第51-54页 |
3.6.1.1 不同贮藏温度对菜心外观的影响 | 第51-52页 |
3.6.1.2 不同贮藏温度对菜心叶片衰老相关生理指标的影响 | 第52-54页 |
3.6.2 9 个NAC基因的表达 | 第54-55页 |
4 讨论 | 第55-61页 |
4.1 转录组数据RRNA含量低 | 第55-56页 |
4.2 组装及注释可做菜心转录组分析的参考基因集 | 第56页 |
4.3 叶片衰老过程中光合作用减弱 | 第56-57页 |
4.4 叶绿素降解引起菜心叶片黄化 | 第57-58页 |
4.5 激素信号通路相关基因在叶片衰老过程中发生显著变化 | 第58-60页 |
4.6 NAC转录因子参与菜心叶片衰老的可能机制 | 第60-61页 |
5 结论 | 第61-62页 |
致谢 | 第62-63页 |
参考文献 | 第63-70页 |