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香蕉枯萎病菌2小种间Mads1和Flo1的比较与致病功能研究

摘要第3-5页
abstract第5-7页
缩略词及中英文对照第8-15页
1 前言第15-28页
    1.1 香蕉枯萎病概况第15-18页
        1.1.1 香蕉枯萎病的发生与危害情况第15-16页
        1.1.2 香蕉枯萎病菌的生理小种第16页
        1.1.3 香蕉枯萎病的防治第16-18页
            1.1.3.1 化学防治第16-17页
            1.1.3.2 生物防治第17-18页
            1.1.3.3 抗病育种第18页
    1.2 尖孢镰刀菌致病相关基因研究第18-22页
        1.2.1 G蛋白第19-20页
        1.2.2 转录因子第20-21页
        1.2.3 效应子第21页
        1.2.4 几丁质合成酶第21-22页
    1.3 MADS-Box转录因子研究慨况第22-24页
        1.3.1 MADS-Box功能介绍第22-23页
        1.3.2 MADS-Box在真菌中的研究现状第23-24页
    1.4 PA14基因家族第24-27页
    1.5 研究目的和意义第27-28页
2 材料与方法第28-59页
    2.1 主要仪器和设备第28页
    2.2 主要试剂第28-29页
    2.3 供试菌株第29页
    2.4 供试植物第29页
    2.5 宿主菌第29页
    2.6 质粒载体第29-30页
    2.7 主要培养基和溶液的配制第30-32页
    2.8 试验方法第32-59页
        2.8.1 致病相关基因的实时荧光定量检测及筛选第32-35页
            2.8.1.1 Foc1和Foc4经香蕉根部处理第32页
            2.8.1.2 Foc及香蕉根部总RNA提取第32-33页
            2.8.1.3 c DNA第一链的合成第33-34页
            2.8.1.4 Real-time PCR引物设计第34页
            2.8.1.5 Real-time PCR反应第34-35页
        2.8.2 香蕉枯萎病菌Mads1,Flo1基因的克隆第35-44页
            2.8.2.1 香蕉枯萎病菌基因组DNA的提取第35-36页
            2.8.2.2 香蕉枯萎病菌RNA提取第36-37页
            2.8.2.3 引物设计第37-38页
            2.8.2.4 香蕉枯萎病菌Mads1、Flo1基因DNA的扩增第38-39页
            2.8.2.5 香蕉枯萎病菌Mads1、Flo1基因c DNA的扩增第39-40页
            2.8.2.6 PCR产物的回收第40-41页
            2.8.2.7 宿主菌E.coli DH5α 感受态细胞的制备第41页
            2.8.2.8 回收产物的连接转化、蓝白斑筛选转化子第41-42页
            2.8.2.9 单菌落PCR筛选阳性克隆第42页
            2.8.2.10 阳性克隆质粒的抽提及测序第42-43页
            2.8.2.11 序列分析与对比第43-44页
        2.8.3 Mads1、Flo1侧翼片段hi TAIL-PCR扩增第44-47页
            2.8.3.1 Mads1、Flo1侧翼片段hi TAIL-PCR扩增引物设计及反应体系第44-46页
            2.8.3.2 PCR产物的回收第46页
            2.8.3.3 回收产物的连接转化与转化第46页
            2.8.3.4 阳性克隆的筛选与鉴定第46页
            2.8.3.5 阳性克隆质粒的抽提及测序第46-47页
        2.8.4 香蕉枯萎病菌Mads1、Flo1致病功能验证第47-59页
            2.8.4.1 基因敲除引物的设计第47页
            2.8.4.2 敲除载体构建策略第47-48页
            2.8.4.3 Mads1、Flo1上游基因敲除片段的构建第48-49页
            2.8.4.4 Mads1、Flo1下游基因敲除片段的构建第49页
            2.8.4.5 Mads1、Flo1上游同源臂与载体p BHt2相连第49-50页
            2.8.4.6 Mads1、Flo1下游同源臂与载体p BHt2相连第50-52页
            2.8.4.7 根癌农杆菌感受态细胞的制备第52页
            2.8.4.8 敲除载体质粒电击转化根癌农杆菌第52-53页
            2.8.4.9 ATMT介导转化第53页
            2.8.4.10 Mads1、Flo1基因敲除突变体的筛选鉴定第53-54页
            2.8.4.11 Southern杂交鉴定第54-57页
            2.8.4.12 敲除突变体菌落形态观察和生长速率测定第57页
            2.8.4.13 突变体的产孢量比较第57页
            2.8.4.14 Mads1、Flo1基因敲除突变体的致病性测定第57-59页
3 结果与分析第59-99页
    3.1 致病相关基因的表达量分析第59-65页
        3.1.1 香蕉枯萎病菌及香蕉根部总RNA提取第59页
        3.1.2 致病相关基因在Foc处理香蕉根部后的表达量变化第59-65页
        3.1.3 实时荧光定量结果小结第65页
    3.2 香蕉枯萎病菌总DNA和总RNA的提取第65-66页
        3.2.1 香蕉枯萎病菌1号和4号小种总DNA的提取第65-66页
        3.2.2 香蕉枯萎病菌1号和4号小种RNA的提取第66页
    3.3 香蕉枯萎病菌Mads1、Flo1基因的克隆和序列分析第66-76页
        3.3.1 Mads1、Flo1基因DNA的扩增与克隆第66-67页
        3.3.2 Mads1、Flo1基因c DNA的扩增与克隆第67-68页
        3.3.3 Mads1、Flo1基因c DNA与DNA的序列分析第68页
        3.3.4 Mads1、Flo1基因2小种的核苷酸及氨基酸的比较第68-71页
        3.3.5 Mads1、Flo1蛋白功能域预测分析第71-72页
        3.3.6 Mads1、Flo1编码蛋白二级结构预测分析第72-74页
        3.3.7 Mads1、Flo1编码蛋白三级结构预测分析第74页
        3.3.8 Mads1、Flo1氨基酸序列遗传发育树构建第74-76页
    3.4 Mads1、Flo1基因侧翼序列的扩增和克隆第76-78页
        3.4.1 hi TAIL-PCR扩增Mads1、Flo1上游序列第76-77页
        3.4.2 hi TAIL-PCR扩增Mads1、Flo1下游序列第77-78页
    3.5 香蕉枯萎病菌Mads1、Flo1基因的敲除第78-99页
        3.5.1 Mads1、Flo1基因上下游同源臂扩增第78-80页
        3.5.2 Mads1、Flo1基因的敲除载体构建第80-86页
            3.5.2.1 Mads1、Flo1基因上游同源臂与敲除载体p BHt2连接第80-83页
            3.5.2.2 Mads1、Flo1基因下游同源臂与p BHt2-Mads1-up、p BHt2-Flo1-up连接第83-86页
        3.5.3 重组敲除质粒转化根癌农杆菌AGL1的结果第86-88页
            3.5.3.1 重组敲除质粒p BHT2-△Mads1转化根癌农杆菌AGL1的结果第86-87页
            3.5.3.2 重组敲除质粒p BHT2-△Flo1转化根癌农杆菌AGL1的结果第87-88页
        3.5.4 Mads1、Flo1基因敲除突变体的PCR检测第88-91页
            3.5.4.1 Mads1基因敲除突变体的PCR检测第88-90页
            3.5.4.2 Flo1基因敲除突变体的PCR检测第90-91页
        3.5.5 Mads1、Flo1敲除突变体的Southern Blot检测第91-92页
        3.5.6 Mads1、Flo1基因敲除突变体的生物学特性第92-96页
            3.5.6.1 Mads1、Flo1基因敲除突变体的表型第92-93页
            3.5.6.2 Mads1、Flo1基因敲除突变体产孢量比较第93-95页
            3.5.6.3 Mads1、Flo1基因敲除突变体生长速率比较第95-96页
        3.5.7 Mads1、Flo1基因敲除突变体的致病性测定第96-99页
4 结论与讨论第99-105页
    4.1 致病相关基因实时荧光定量验证第99页
    4.2 Mads1、Flo1基因克隆和序列分析第99-102页
    4.3 Mads1、Flo1基因的致病功能验证第102-104页
    4.4 展望第104-105页
致谢第105-106页
参考文献第106-117页
附录第117-119页

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