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爪哇根结线虫Mj-msp-33基因的克隆及功能分析

摘要第2-3页
Abstract第3-4页
1 前言第11-19页
    1.1 根结线虫的危害第11-12页
    1.2 根结线虫的防治第12-13页
    1.3 根结线虫效应子蛋白的研究进展第13-17页
        1.3.1 改变植物细胞壁的结构第14页
        1.3.2 分子模拟寄主内源信号第14-15页
        1.3.3 抑制植物防御反应第15-16页
        1.3.4 调控寄主的转录第16-17页
        1.3.5 转录后修饰第17页
        1.3.6 未知功能的效应子蛋白第17页
    1.4 本研究的目的与意义第17-19页
2 材料与方法第19-40页
    2.1 材料第19-22页
        2.1.1 供试线虫种群与植株第19页
        2.1.2 菌株与载体第19页
        2.1.3 主要试剂与试剂盒第19页
        2.1.4 主要溶液与培养基配方第19-21页
        2.1.5 主要仪器与设备第21页
        2.1.6 主要软件与网络数据库第21-22页
        2.1.7 引物设计与合成第22页
    2.2 方法第22-40页
        2.2.1 供试番茄植株的培养第22页
        2.2.2 供试线虫的培养与收集第22页
        2.2.3 爪哇根结线虫总RNA的提取第22-23页
        2.2.4 爪哇根结线虫总RNA反转录cDNA第23页
        2.2.5 爪哇根结线虫Mj-msp33基因片段的同源克隆第23-25页
            2.2.5.1 PCR扩增Mj-msp33基因片段第23-24页
            2.2.5.2 PCR产物的纯化回收第24-25页
            2.2.5.3 回收的PCR产物连接pMD18-T载体第25页
            2.2.5.4 重组质粒的转化及筛选第25页
        2.2.6 爪哇根结线虫Mj-msp33基因全长的获得第25-27页
            2.2.6.1 5' RACE-PCR第25-26页
            2.2.6.2 3' RACE-PCR第26-27页
            2.2.6.3 Mj-msp33基因全长序列的扩增第27页
            2.2.6.4 重组质粒pMD18-T-Mj-msp33的提取第27页
        2.2.7 Mj-msp33在爪哇根结线虫中的原位杂交分析第27-30页
            2.2.7.1 原位杂交实验探针的制备第27-29页
            2.2.7.2 线虫的固定及处理第29页
            2.2.7.3 杂交实验第29-30页
        2.2.8 爪哇根结线虫Mj-msp33基因的龄期表达分析第30-33页
            2.2.8.1 爪哇根结线虫卵的收集第30-31页
            2.2.8.2 爪哇根结线虫侵染前二龄幼虫的收集第31页
            2.2.8.3 爪哇根结线虫侵染后2龄幼虫、3 龄幼虫和4龄幼虫的收集第31页
            2.2.8.4 爪哇根结线虫成熟雌虫的收集第31页
            2.2.8.5 爪哇根结线虫各龄期总RNA的提取第31页
            2.2.8.6 爪哇根结线虫各龄期cDNA的获得第31-32页
            2.2.8.7 qRT-PCR分析Mj-msp33在爪哇根结线虫不同发育阶段的表达水平第32-33页
        2.2.9 爪哇根结线虫Mj-msp33蛋白与拟南芥互作蛋白的初步鉴定第33-40页
            2.2.9.1 诱饵载体pGBKT7-Mj-msp33的构建第33-34页
            2.2.9.2 酵母菌株AH109感受态的制备第34-35页
            2.2.9.3 诱饵载体转化酵母菌株AH109第35页
            2.2.9.4 诱饵载体转化酵母菌株AH109阳性菌落的检测第35-36页
            2.2.9.5 诱饵载体毒性与自激活检测第36页
            2.2.9.6 酵母双杂交文库筛选第36-37页
            2.2.9.7 酵母阳性菌落的验证第37-38页
            2.2.9.8 酵母质粒的抽提第38-39页
            2.2.9.9 酵母质粒转化大肠杆菌DH5α第39页
            2.2.9.10 诱饵载体与筛选到的潜在互作因子的共转化第39-40页
3 结果与分析第40-54页
    3.1 爪哇根结线虫Mj-msp33基因的克隆第40-46页
        3.1.1 同源克隆第40页
        3.1.2 RACE实验第40-41页
        3.1.3 爪哇根结线虫Mj-msp33基因全长的扩增第41-43页
        3.1.4 同源性分析第43页
        3.1.5 理化性质分析第43-44页
        3.1.6 爪哇根结线虫Mj-msp33蛋白结构预测第44-46页
            3.1.6.1 Mj-msp33蛋白信号肽预测及跨膜结构域预测第44-45页
            3.1.6.2 Mj-msp33蛋白亚细胞定位预测第45页
            3.1.6.3 Mj-msp33蛋白磷酸化位点预测第45-46页
    3.2 Mj-msp33在爪哇根结线虫中的表达定位分析第46-48页
        3.2.1 探针的制备第46-48页
        3.2.2 原位杂交实验第48页
    3.3 爪哇根结线虫Mj-msp33基因的龄期表达分析第48-49页
    3.4 爪哇根结线虫Mj-msp33蛋白与拟南芥互作蛋白的初步鉴定第49-54页
        3.4.1 诱饵载体pGBKT7-Mj-msp33的构建第49-51页
        3.4.2 诱饵载体pGBKT7-Mj-msp33转化酵母菌株AH109第51-52页
        3.4.3 拟南芥互作蛋白的初步筛选第52-53页
        3.4.4 诱饵蛋白与捕获蛋白共转化酵母细胞第53-54页
4 结论与讨论第54-59页
    4.1 结论第54页
    4.2 讨论第54-58页
        4.2.1 Mj-msp33基因全长的获得第54-55页
        4.2.2 Mj-msp33蛋白是爪哇根结线虫分泌蛋白第55页
        4.2.3 Mj-msp33蛋白定位在植物的细胞核第55页
        4.2.4 磷酸化修饰第55页
        4.2.5 Mj-msp33在爪哇根结线虫pre-J2的亚腹食道腺中特异表达第55-56页
        4.2.6 Mj-msp33在爪哇根结线虫侵染前和侵染早期阶段特异表达第56页
        4.2.7 Mj-msp33蛋白与拟南芥GDPD蛋白存在互作关系第56-58页
    4.3 本论文还需进一步解决的问题第58-59页
致谢第59-60页
参考文献第60-66页
附录第66-71页

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