| 致谢 | 第7-9页 |
| 中文摘要 | 第9-11页 |
| Abstract | 第11-14页 |
| 缩略语表 | 第19-21页 |
| 第一章 文献综述 | 第21-36页 |
| 1.1 花色苷 | 第21-31页 |
| 1.1.1 花青素与花色苷 | 第21-22页 |
| 1.1.2 花色苷合成途径结构基因的协同作用 | 第22页 |
| 1.1.3 植物转录因子与花色苷的生物合成 | 第22-28页 |
| 1.1.3.1 bHLH转录因子 | 第23页 |
| 1.1.3.2 WD40转录因子 | 第23页 |
| 1.1.3.3 MYB转录因子与花色苷的合成 | 第23-25页 |
| 1.1.3.4 R2R3MYB基因家族与花色苷的合成 | 第25-28页 |
| 1.1.3.5 MYB-bHLH-WD40(MBW)复合体与花色苷的合成 | 第28页 |
| 1.1.4 花色苷生物合成的影响因子 | 第28-30页 |
| 1.1.5 花色苷生物合成的调控措施 | 第30-31页 |
| 1.2 转录组学研究进展 | 第31-33页 |
| 1.3 蛋白质组学研究进展 | 第33-34页 |
| 1.3.1 蛋白质组学概念及主要技术 | 第33页 |
| 1.3.2 蛋白质组学的应用 | 第33-34页 |
| 1.4 本研究的目的和意义 | 第34-36页 |
| 第二章 芒果果实的转录组和蛋白全谱研究 | 第36-56页 |
| 2.1 材料与方法 | 第36-40页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第36-37页 |
| 2.1.2 芒果果实转录组测序及分析 | 第37-38页 |
| 2.1.2.1 芒果果实果皮与果肉RNA提取及转录组测序 | 第37页 |
| 2.1.2.2 转录组数据组装及基因功能注释 | 第37-38页 |
| 2.1.3 蛋白质全谱鉴定 | 第38-40页 |
| 2.1.3.1 蛋白的粗提 | 第38-39页 |
| 2.1.3.2 蛋白质胶内酶解 | 第39页 |
| 2.1.3.3 肽段提取 | 第39页 |
| 2.1.3.4 基于LTQ-Orbitrap CID的LC-ESI-MS/MS分析 | 第39-40页 |
| 2.1.4 蛋白质标准生物信息分析 | 第40页 |
| 2.1.4.1 原始质谱数据 | 第40页 |
| 2.1.4.2 利用数据库比对 | 第40页 |
| 2.1.4.3 Mascot搜索 | 第40页 |
| 2.2 结果与分析 | 第40-54页 |
| 2.2.1 转录组组装结果 | 第40-41页 |
| 2.2.1.1 果实转录组组装概要 | 第40-41页 |
| 2.2.1.2 Unigene的序列同源性分析 | 第41页 |
| 2.2.2 蛋白鉴定信息概要 | 第41-44页 |
| 2.2.2.1 SDS-PAGE电泳检测结果及蛋白质相对分子质量分布情况 | 第42-43页 |
| 2.2.2.2 鉴定蛋白被鉴定肽段所覆盖比率 | 第43-44页 |
| 2.2.3 Unigene功能注释 | 第44-51页 |
| 2.2.3.1 Unigene和蛋白的GO功能分类分析 | 第44-45页 |
| 2.2.3.2 Unigene的COG功能分类 | 第45-47页 |
| 2.2.3.3 Unigene的KEGG代谢途径分类 | 第47-51页 |
| 2.2.4 编码蛋白框(CDS)的核苷酸和氨基酸序列分析 | 第51-52页 |
| 2.2.5 蛋白质鉴定 | 第52-53页 |
| 2.2.6 芒果花色苷生物合成途径相关基因和蛋白 | 第53-54页 |
| 2.3 讨论 | 第54-56页 |
| 第三章 不同芒果品种果皮色素与花色苷合成基因表达研究 | 第56-69页 |
| 3.1 材料与方法 | 第56-58页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第56页 |
| 3.1.2 测定方法 | 第56-58页 |
| 3.1.2.1 芒果果皮色度测定 | 第57页 |
| 3.1.2.2 花色苷的提取与测定 | 第57页 |
| 3.1.2.3 叶绿素及类胡萝卜素含量 | 第57页 |
| 3.1.2.4 类黄酮含量的测定 | 第57-58页 |
| 3.1.3 Q-PCR分析 | 第58页 |
| 3.1.3.1 RNA的提取 | 第58页 |
| 3.1.3.2 cDNA第一链的合成 | 第58页 |
| 3.1.3.3 实时定量PCR | 第58页 |
| 3.1.3.4 mRNA相对表达量分析 | 第58页 |
| 3.1.4 统计分析 | 第58页 |
| 3.2 结果与分析 | 第58-67页 |
| 3.2.1 不同芒果品种果皮的色泽 | 第58-61页 |
| 3.2.2 不同品种芒果果皮色素含量 | 第61-62页 |
| 3.2.2.1 不同品种芒果果皮花色苷含量 | 第61页 |
| 3.2.2.2 不同品种芒果果皮的叶绿素、类胡萝卜素含量 | 第61页 |
| 3.2.2.3 不同芒果品种类黄酮含量 | 第61-62页 |
| 3.2.3 不同品种芒果果皮花色苷合成相关基因表达分析 | 第62-66页 |
| 3.2.4 色素含量与花色苷生物合成途径相关基因的相关性分析 | 第66-67页 |
| 3.3 讨论 | 第67-69页 |
| 第四章 除袋对红芒6号和椰香芒果皮着色与相关基因表达的影响 | 第69-84页 |
| 4.1 材料与方法 | 第69页 |
| 4.2 结果与分析 | 第69-81页 |
| 4.2.1 红芒6号和椰香芒除袋果皮色素变化 | 第69-71页 |
| 4.2.2 红芒6号和椰香芒除袋后果皮颜色及色泽变化 | 第71-72页 |
| 4.2.3 果皮色素与色泽的相关性 | 第72-73页 |
| 4.2.4 红芒6号和椰香芒除袋后花色苷合成相关基因表达 | 第73-80页 |
| 4.2.4.1 红芒6号除袋后花色苷合成结构基因表达 | 第73-76页 |
| 4.2.4.2 椰香芒除袋后花色苷合成结构基因表达 | 第76-79页 |
| 4.2.4.3 红芒6号和椰香芒除袋后花色苷合成转录因子MYB基因表达 | 第79-80页 |
| 4.2.5 果皮色素与相关基因的相关性分析 | 第80-81页 |
| 4.3 讨论 | 第81-84页 |
| 第五章 两个红皮芒果品种基因表达谱分析 | 第84-105页 |
| 5.1 材料与方法 | 第84-86页 |
| 5.1.1 试验材料 | 第84-85页 |
| 5.1.2 分析方法 | 第85-86页 |
| 5.1.2.1 基因覆盖度 | 第85页 |
| 5.1.2.2 基因表达量计算 | 第85页 |
| 5.1.2.3 差异表达基因筛选 | 第85页 |
| 5.1.2.4 Q-PCR验证 | 第85-86页 |
| 5.2 结果与分析 | 第86-103页 |
| 5.2.1 表达谱测序基本信息 | 第86-89页 |
| 5.2.1.1 4个文库序列比对统计结果 | 第86页 |
| 5.2.1.2 测序饱和度分析 | 第86页 |
| 5.2.1.3 测序随机性分析 | 第86-88页 |
| 5.2.1.4 基因覆盖度分布 | 第88-89页 |
| 5.2.2 两品种在未套袋和套袋的差异表达基因模式变化 | 第89页 |
| 5.2.3 两品种未套袋和套袋(双层袋)差异表达基因的功能分类 | 第89-92页 |
| 5.2.3.1 GO功能分类 | 第89-91页 |
| 5.2.3.2 KEGG代谢途径分析 | 第91-92页 |
| 5.2.4 差异表达基因的鉴定 | 第92-102页 |
| 5.2.4.1 植物生理节律 | 第92-93页 |
| 5.2.4.2 花色苷生物合成相关代谢途径 | 第93-94页 |
| 5.2.4.3 泛素蛋白降解 | 第94页 |
| 5.2.4.4 光合生物固碳和光合作用 | 第94-102页 |
| 5.2.5 两品种及套袋处理间相关基因的RNA-Seq和Q-PCR验证分析 | 第102页 |
| 5.2.6 两个红皮芒果品种着色及花色苷含量差异 | 第102-103页 |
| 5.3 讨论 | 第103-105页 |
| 第六章 小结与展望 | 第105-108页 |
| 6.1 小结 | 第105-106页 |
| 6.2 创新点 | 第106页 |
| 6.3 展望 | 第106-108页 |
| 参考文献 | 第108-122页 |
| 作者简历及在学期间所取得的科研成果 | 第122页 |
