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基于高通量测序和形态学的黄渤海沉积物中纤毛虫生物多样性及分布特征研究

摘要第5-8页
Abstract第8-11页
第一章 绪论第15-24页
    1.1 引言第15-16页
    1.2 海洋底栖纤毛虫多样性研究方法第16-22页
        1.2.1 形态学研究方法第17-18页
        1.2.2 分子指纹图谱分析技术第18-19页
        1.2.3 克隆文库技术第19-20页
        1.2.4 DNA和cDNA高通量测序第20-22页
        1.2.5 问题的提出第22页
    1.3 本研究目的和意义第22-24页
第二章 基于形态学与核糖体DNA及其cDNA高通量测序的海洋沉积物中纤毛虫多样性比较第24-40页
    2.1 引言第24-26页
    2.2 材料与方法第26-29页
        2.2.1 调查站位与样品采集第26页
        2.2.2 形态学观察第26-27页
        2.2.3 DNA和RNA提取与PCR扩增第27-28页
        2.2.4 测序及序列数据分析第28-29页
        2.2.5 数据统计分析第29页
    2.3 结果与分析第29-37页
        2.3.1 形态观察、DNA及其cDNA测序所获纤毛虫多样性构成第29-34页
        2.3.2 形态观察、DNA及其cDNA测序所获纤毛虫丰度构成第34-37页
    2.4 讨论第37-39页
        2.4.1 形态观察、DNA及其cDNA测序对海洋底栖纤毛虫多样性的评估效能第37-38页
        2.4.2 三种方法检测的海洋底栖纤毛虫丰度/相对丰度比较第38-39页
    2.5 结论第39-40页
第三章 基于形态学与核糖体DNA及其cDNA高通量测序的黄渤海沉积物中纤毛虫多样性和分布比较第40-56页
    3.1 引言第40-42页
    3.2 材料与方法第42-43页
        3.2.1 调查站位与样品采集第42页
        3.2.2 环境因子测定第42-43页
        3.2.3 形态观察、DNA和RNA提取与PCR扩增第43页
        3.2.4 测序及序列数据分析第43页
        3.2.5 数据统计分析第43页
    3.3 结果与分析第43-52页
        3.3.1 环境因子第43-45页
        3.3.2 基本数据第45页
        3.3.3 基于形态观察的纤毛虫多样性和分布第45-46页
        3.3.4 基于DNA高通量测序的纤毛虫多样性和分布第46-48页
        3.3.5 基于cDNA高通量测序的纤毛虫多样性和分布第48-52页
    3.4 讨论第52-55页
        3.4.1 基于形态观察的纤毛虫多样性和分布第52-53页
        3.4.2 基于DNA和cDNA高通量测序的纤毛虫多样性和分布第53-55页
    3.5 结论第55-56页
第四章 黄渤海沉积物中纤毛虫群落结构和分布特征第56-74页
    4.1 引言第56-57页
    4.2 材料与方法第57-58页
        4.2.1 调查站位与样品采集第57页
        4.2.2 环境因子测定、形态观察、DNA和RNA提取与PCR扩增第57页
        4.2.3 测序及序列数据分析第57-58页
        4.2.4 数据统计分析第58页
    4.3 结果与分析第58-71页
        4.3.1 底栖环境因子第58-61页
        4.3.2 基于形态学和cDNA高通量测序的纤毛虫物种多样性和分子多样性第61-63页
        4.3.3 基于形态学和cDNA高通量测序的纤毛虫群落组成第63-67页
        4.3.4 基于形态学和cDNA高通量测序的纤毛虫聚类分析第67-69页
        4.3.5 基于形态学和cDNA高通量测序的纤毛虫群落结构参数与环境因子的相关性分析第69-71页
    4.4 讨论第71-73页
        4.4.1 基于形态观察和cDNA高通量测序的纤毛虫多样性、群落结构和分布第71-72页
        4.4.2 基于形态观察和cDNA高通量测序的纤毛虫群落结构的环境驱动因子第72-73页
    4.5 结论第73-74页
结论与创新点第74-76页
参考文献第76-84页
附录第84-89页
致谢第89-91页
作者简历及攻读学位期间发表的学术论文与研究成果第91页

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