| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第1章 绪论 | 第9-19页 |
| 1.1 课题研究背景及意义 | 第9-10页 |
| 1.1.1 课题研究背景 | 第9页 |
| 1.1.2 课题研究意义 | 第9-10页 |
| 1.2 酶的概述 | 第10-14页 |
| 1.2.1 酶的概念和特性 | 第10-11页 |
| 1.2.2 酶的组成及其活性中心 | 第11-12页 |
| 1.2.3 酶催化反应机理 | 第12-13页 |
| 1.2.4 活性中心微环境的影响 | 第13-14页 |
| 1.3 国内外研究现状分析 | 第14-17页 |
| 1.3.1 DFPase的结构及催化机理 | 第14-15页 |
| 1.3.2 PON1的结构及催化机理 | 第15页 |
| 1.3.3 蛋白酶催化机理的进化关系研究 | 第15-17页 |
| 1.4 本文主要研究内容 | 第17-19页 |
| 第2章 理论基础 | 第19-28页 |
| 2.1 量子化学简介 | 第19页 |
| 2.2 量子化学基础 | 第19-23页 |
| 2.2.1 Schr?dinger方程 | 第19-21页 |
| 2.2.2 波函数 | 第21-22页 |
| 2.2.3 Born-Oppenheimer近似 | 第22页 |
| 2.2.4 变分法 | 第22-23页 |
| 2.3 密度泛函理论（DFT） | 第23-26页 |
| 2.3.1 Hohenberg-Kohn定理 | 第23-24页 |
| 2.3.2 Kohn-Sham方程 | 第24-25页 |
| 2.3.3 相关泛函 | 第25-26页 |
| 2.3.4 色散校正密度泛函（DFT-D） | 第26页 |
| 2.4 相关基组简介 | 第26-27页 |
| 2.5 Gaussian软件包简介 | 第27-28页 |
| 第3章 DFPase催化机理的研究 | 第28-42页 |
| 3.1 引言 | 第28-29页 |
| 3.2 计算方法与基组 | 第29-30页 |
| 3.3 计算结果与讨论 | 第30-40页 |
| 3.3.1 活性中心构建 | 第30-31页 |
| 3.3.2 由Asp229作为亲核试剂的DFPase水解机理 | 第31-37页 |
| 3.3.3 由H_2O作为亲核试剂的DFPase水解机理 | 第37-40页 |
| 3.4 本章小结 | 第40-42页 |
| 第4章 野生型及突变型PON1催化机理的研究 | 第42-53页 |
| 4.1 引言 | 第42-44页 |
| 4.2 计算方法与基组 | 第44-45页 |
| 4.3 计算结果与讨论 | 第45-51页 |
| 4.3.1 野生模型与突变模型的构建 | 第45-47页 |
| 4.3.2 过渡态及反应产物 | 第47-50页 |
| 4.3.3 结果分析 | 第50-51页 |
| 4.4 本章小结 | 第51-53页 |
| 结论 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-62页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文及其它成果 | 第62-64页 |
| 致谢 | 第64页 |