| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 1 文献综述 | 第8-15页 |
| 1.1 纤毛虫简介及研究意义 | 第8页 |
| 1.2 纤毛虫系统学研究历史 | 第8-11页 |
| 1.2.1 发现时期（1880-1930）和发展时期（1930-1950） | 第8页 |
| 1.2.2 纤毛虫纤毛图示时期（1950-1970） | 第8-9页 |
| 1.2.3 超微结构时期（1970-1990） | 第9页 |
| 1.2.4 完善时期（1990-至今） | 第9-11页 |
| 1.3 纤毛虫分子系统学研究概述 | 第11-13页 |
| 1.3.1 研究意义 | 第11页 |
| 1.3.2 核糖体基因在纤毛虫分子系统学研究中的应用 | 第11-12页 |
| 1.3.3 分子系统树的构建 | 第12-13页 |
| 1.4 存在的问题及前景 | 第13-14页 |
| 1.5 本工作研究的主要内容及意义 | 第14-15页 |
| 2 材料与方法 | 第15-23页 |
| 2.1 样品采集 | 第15页 |
| 2.2 DNA提取及克隆测序 | 第15-17页 |
| 2.2.1 DNA提取 | 第15页 |
| 2.2.2 PCR扩增 | 第15-16页 |
| 2.2.3 目的片段纯化 | 第16页 |
| 2.2.4 目的片段连接、转化和测序 | 第16-17页 |
| 2.3 数据处理 | 第17-23页 |
| 2.3.1 核酸序列的初步处理 | 第17页 |
| 2.3.2 序列比对 | 第17页 |
| 2.3.3 模型筛选 | 第17页 |
| 2.3.4 构建系统树 | 第17-21页 |
| 2.3.5 AU检验 | 第21-23页 |
| 3 聚缩虫科和累枝虫科的分子系统地位研究 | 第23-36页 |
| 3.1 引言 | 第23-24页 |
| 3.2 结果 | 第24-33页 |
| 3.2.1 基于SSU rDNA的系统发生分析 | 第24-29页 |
| 3.2.2 基于ITS1-5.8S-ITS2转录区的系统发生分析 | 第29页 |
| 3.2.3 基于LSU rDNA和串联基因的系统发生分析 | 第29页 |
| 3.2.4 AU检验结果 | 第29-33页 |
| 3.3 讨论 | 第33-34页 |
| 3.4 小结 | 第34-36页 |
| 4 鞘居虫科的分子系统地位研究 | 第36-43页 |
| 4.1 引言 | 第36页 |
| 4.2 结果 | 第36-41页 |
| 4.2.1 基于SSU rDNA的系统发生分析 | 第36-38页 |
| 4.2.2 盐靴纤虫新种的形态特征 | 第38-41页 |
| 4.3 讨论 | 第41页 |
| 4.4 小结 | 第41-43页 |
| 5 结论与展望 | 第43-44页 |
| 参考文献 | 第44-51页 |
| 致谢 | 第51-52页 |
| 附录一 | 第52-53页 |
| 附录二 | 第53-56页 |
