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粘细菌中利用CRISPR-dcas9系统抑制基因表达

摘要第7-9页
ABSTRACT第9-11页
论文缩写词表第12-13页
第一章 文献综述第13-37页
    1.1 粘细菌概述第13-17页
        1.1.1 粘细菌的特征第13-15页
        1.1.2 粘细菌是次级代谢产物的微生物工厂第15-17页
    1.2 埃博霉素概述第17-19页
        1.2.1 埃博霉素生产菌株特征第17-18页
        1.2.2 埃博霉素基因簇异源表达第18-19页
    1.3 CRISPR-CAS系统概述第19-33页
        1.3.1 CRISPR-Cas发展历程第19-23页
        1.3.2 CRISPR-Cas系统的分类第23-28页
        1.3.3 CRISPR-Cas9系统的作用机制第28-29页
        1.3.4 CRISPR-Cas9系统的应用第29-32页
        1.3.5 CRISPR-Cas9系统展望第32-33页
    1.4 开展本课题的思路及研究内容第33-37页
第二章 在黄色粘球细菌中构建CRISPR-DCAS9系统第37-59页
    2.1 实验材料和仪器试剂第39-43页
        2.1.1 菌株和质粒第39-40页
        2.1.2 培养基和溶液第40-41页
        2.1.3 耗材与仪器设备第41-42页
        2.1.4 酶与试剂盒第42页
        2.1.5 分析工具第42-43页
    2.2 实验方法第43-53页
        2.2.1 密码子优化第43页
        2.2.2 cas9基因核酸酶位点突变第43-45页
        2.2.3 sgRNA的设计及表达载体的选择第45-50页
        2.2.4 验证构建好的CRISPR-dCas9系统第50-53页
    2.3 实验结果第53-58页
        2.3.1 密码子优化结果第53页
        2.3.2 cas9基因核酸酶位点突变第53-54页
        2.3.3 sgRNA设计结果第54-55页
        2.3.4 验证构建好的CRISPR-dCas9系统第55-58页
    2.4 实验讨论第58-59页
第三章 CRISPR-DCAS9系统效率的测定和优化第59-70页
    3.1 实验材料第61-63页
        3.1.1 实验菌株与质粒第61-62页
        3.1.2 主要培养基第62页
        3.1.3 实验试剂和试剂盒第62页
        3.1.4 实验仪器第62-63页
    3.2 实验方法第63-65页
        3.2.1 更换dCas9基因的启动子第63页
        3.2.2 sgRNA靶向同一基因的不同位置第63-64页
        3.2.3 CRISPR-dcas9系统抑制效率的测定第64-65页
    3.3 实验结果与分析第65-69页
        3.3.1 更换mxdCas9基因的启动子第65-67页
        3.3.2 sgRNA靶向同一基因(difA)的不同位置第67-68页
        3.3.3 CRISPR-mxdcas9系统抑制效率的测定第68-69页
    3.4 本章小结第69-70页
第四章 CRISPR-DCAS9的应用第70-83页
    4.1 实验材料和仪器试剂第72-74页
        4.1.1 菌株和质粒第72-73页
        4.1.2 培养基和溶液第73页
        4.1.3 耗材与仪器设备第73页
        4.1.4 酶与试剂盒第73-74页
    4.2 实验方法第74-77页
        4.2.1 CRISPR-dcas9系统抑制抑制脂肪酸合成第74-75页
        4.2.2 CRISPR-dcas9系统抑制转化甲基丙二酸单酰辅酶A的酶第75页
        4.2.3 CRISPR-dcas9+activator系统激活预测到的埃博霉素基因簇的启动子第75页
        4.2.4 菌株产埃博霉素能力检测第75-77页
    4.3 实验结果第77-82页
        4.3.1 系统抑制抑制脂肪酸合成质粒构建结果第77-78页
        4.3.2 抑制转化甲基丙二酸单酰辅酶A的酶质粒构建结果第78页
        4.3.3 激活预测到的埃博霉素基因簇的启动子质粒构建第78-79页
        4.3.4 抑制菌株埃博霉素生产能力检测第79-82页
    4.4 实验讨论第82-83页
全文总结与展望第83-84页
附录 文献中用到的主要引物第84-85页
参考文献第85-94页
致谢第94-95页
学位论文评阅及答辩情况表第95页

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