| 致谢 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 专业词汇中英文对照表 | 第8-11页 |
| 第一章 引言 | 第11-15页 |
| ·DNA甲基化的概况 | 第11-12页 |
| ·DNA甲基化定义 | 第11页 |
| ·DNA甲基化的研究进展 | 第11-12页 |
| ·等位基因特异DNA甲基化的概况 | 第12-13页 |
| ·等位基因特异DNA甲基化的分类 | 第12页 |
| ·亲源依赖的等位基因特异DNA甲基化 | 第12页 |
| ·序列依赖的等位基因特异DNA甲基化 | 第12-13页 |
| ·等位基因特异DNA甲基化的研究方法 | 第13-15页 |
| ·基于SNP的识别 | 第13页 |
| ·基于统计算法的识别 | 第13-14页 |
| ·当前研究方法的局限性 | 第14-15页 |
| 第二章 研究目的与策略 | 第15-18页 |
| ·研究目的 | 第15页 |
| ·研究的意义 | 第15页 |
| ·研究的目标 | 第15页 |
| ·研究策略 | 第15-18页 |
| ·研究条件 | 第15-16页 |
| ·分析策略 | 第16-18页 |
| 第三章 材料与方法 | 第18-22页 |
| ·数据来源 | 第18页 |
| ·特征提取和评估 | 第18-19页 |
| ·特征搜集 | 第18-19页 |
| ·特征提取 | 第19页 |
| ·特征评估 | 第19页 |
| ·机器学习方法 | 第19-20页 |
| ·分类器评估 | 第20页 |
| ·在特定的基因组区域预测ASM事件 | 第20-21页 |
| ·基于人脑甲基化的独立验证 | 第21页 |
| ·基因功能分析 | 第21-22页 |
| 第四章 结果与讨论 | 第22-38页 |
| ·三类等位基因特异DNA甲基化间存在差异的特征 | 第22-27页 |
| ·亲源依赖的等位基因特异DNA甲基化显示共甲基化现象 | 第22-24页 |
| ·等位基因特异DNA甲基化事件在基因组中的分布 | 第24-25页 |
| ·ASM事件与CpG岛相关特征的关联关系 | 第25-27页 |
| ·机器学习模型 | 第27-34页 |
| ·特征的选取 | 第27-28页 |
| ·特征提取与机器学习模型训练 | 第28-34页 |
| ·应用到人的数据集 | 第34-36页 |
| ·应用鼠中训练的分类器到人的基因组 | 第34-35页 |
| ·在人基因组中识别真实的S-ASM | 第35-36页 |
| ·基因富集分析 | 第36页 |
| ·讨论 | 第36-38页 |
| 第五章 结论 | 第38-39页 |
| 参考文献 | 第39-43页 |
| 附录 | 第43-51页 |
| 作者简介及在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第51页 |