酵母和大肠杆菌基因表达谱与蛋白质相互作用的相关性分析
摘要 | 第1-4页 |
Abstract | 第4-6页 |
缩略词索引 | 第6-7页 |
目录 | 第7-9页 |
第一章 引言 | 第9-19页 |
·生物信息学的发展概况 | 第9-10页 |
·基因芯片的发展概况 | 第10-12页 |
·基因芯片的产生背景 | 第10-11页 |
·cDNA微阵列芯片 | 第11-12页 |
·寡核苷酸芯片 | 第12页 |
·基因芯片的研究现状 | 第12页 |
·蛋白质相互作用及其网络的发展概况 | 第12-16页 |
·蛋白质互作概述 | 第12-13页 |
·蛋白质互作检测技术 | 第13-14页 |
·蛋白质相互作用网络 | 第14-16页 |
·本论文的主要研究工作 | 第16-19页 |
·研究的背景 | 第16页 |
·研究的目的和意义 | 第16-17页 |
·研究内容和技术路线 | 第17-19页 |
第二章 酵母基因表达谱及相关性网络分析 | 第19-39页 |
·引言 | 第19页 |
·数据库简介 | 第19-22页 |
·基因表达数据库 | 第19-21页 |
·蛋白相互作用数据库 | 第21-22页 |
·所需设备和材料 | 第22-23页 |
·主要设备 | 第22页 |
·主要软件 | 第22-23页 |
·数据获取及处理 | 第23-24页 |
·基因芯片数据 | 第23-24页 |
·蛋白相互作用数据 | 第24页 |
·实验方法与流程 | 第24-28页 |
·基因筛选 | 第24页 |
·芯片数据预处理 | 第24-25页 |
·相关性分析 | 第25-26页 |
·负样本数据筛选 | 第26-27页 |
·统计检验 | 第27页 |
·构建网络与功能分析 | 第27-28页 |
·结果与讨论 | 第28-37页 |
·统计检验结果 | 第28-29页 |
·基因共表达网络 | 第29-30页 |
·基因富集 | 第30-34页 |
·酵母GPL90相关性网络富集分析 | 第34-35页 |
·酵母GPL2529相关性网络富集分析 | 第35-37页 |
·小结 | 第37-39页 |
第三章 大肠杆菌基因表达谱及相关性网络分析 | 第39-51页 |
·引言 | 第39页 |
·数据获取及处理 | 第39-40页 |
·基因芯片数据 | 第39页 |
·蛋白相互作用数据 | 第39-40页 |
·实验方法与流程 | 第40-42页 |
·基因筛选 | 第40页 |
·芯片数据预处理 | 第40-41页 |
·相关性分析 | 第41页 |
·构建网络与功能分析 | 第41-42页 |
·结果与讨论 | 第42-49页 |
·小结 | 第49-51页 |
第四章 共表达与蛋白互作的关联分析 | 第51-55页 |
·引言 | 第51页 |
·数据处理 | 第51-53页 |
·结果与讨论 | 第53-54页 |
·小结 | 第54-55页 |
第五章 总结与展望 | 第55-57页 |
·总结 | 第55-56页 |
·展望 | 第56-57页 |
参考文献 | 第57-62页 |
附录 | 第62-63页 |
硕士期间发表文章 | 第63-64页 |
致谢 | 第64页 |