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酵母和大肠杆菌基因表达谱与蛋白质相互作用的相关性分析

摘要第1-4页
Abstract第4-6页
缩略词索引第6-7页
目录第7-9页
第一章 引言第9-19页
   ·生物信息学的发展概况第9-10页
   ·基因芯片的发展概况第10-12页
     ·基因芯片的产生背景第10-11页
     ·cDNA微阵列芯片第11-12页
     ·寡核苷酸芯片第12页
     ·基因芯片的研究现状第12页
   ·蛋白质相互作用及其网络的发展概况第12-16页
     ·蛋白质互作概述第12-13页
     ·蛋白质互作检测技术第13-14页
     ·蛋白质相互作用网络第14-16页
   ·本论文的主要研究工作第16-19页
     ·研究的背景第16页
     ·研究的目的和意义第16-17页
     ·研究内容和技术路线第17-19页
第二章 酵母基因表达谱及相关性网络分析第19-39页
   ·引言第19页
   ·数据库简介第19-22页
     ·基因表达数据库第19-21页
     ·蛋白相互作用数据库第21-22页
   ·所需设备和材料第22-23页
     ·主要设备第22页
     ·主要软件第22-23页
   ·数据获取及处理第23-24页
     ·基因芯片数据第23-24页
     ·蛋白相互作用数据第24页
   ·实验方法与流程第24-28页
     ·基因筛选第24页
     ·芯片数据预处理第24-25页
     ·相关性分析第25-26页
     ·负样本数据筛选第26-27页
     ·统计检验第27页
     ·构建网络与功能分析第27-28页
   ·结果与讨论第28-37页
     ·统计检验结果第28-29页
     ·基因共表达网络第29-30页
     ·基因富集第30-34页
     ·酵母GPL90相关性网络富集分析第34-35页
     ·酵母GPL2529相关性网络富集分析第35-37页
   ·小结第37-39页
第三章 大肠杆菌基因表达谱及相关性网络分析第39-51页
   ·引言第39页
   ·数据获取及处理第39-40页
     ·基因芯片数据第39页
     ·蛋白相互作用数据第39-40页
   ·实验方法与流程第40-42页
     ·基因筛选第40页
     ·芯片数据预处理第40-41页
     ·相关性分析第41页
     ·构建网络与功能分析第41-42页
   ·结果与讨论第42-49页
   ·小结第49-51页
第四章 共表达与蛋白互作的关联分析第51-55页
   ·引言第51页
   ·数据处理第51-53页
   ·结果与讨论第53-54页
   ·小结第54-55页
第五章 总结与展望第55-57页
   ·总结第55-56页
   ·展望第56-57页
参考文献第57-62页
附录第62-63页
硕士期间发表文章第63-64页
致谢第64页

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