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秦川牛肉用性状及八个黄牛品种遗传关系的DNA分子标记研究

中文摘要第1-14页
英文摘要第14-18页
第一部分 文献综述第18-74页
 前言第18-19页
 第一节 动物育种技术及其发展概述第19-20页
 第二节 动物分子育种研究进展第20-23页
   ·基因的定位与基因图谱的构建第20-21页
     ·概述第20页
     ·鸡、猪、羊等畜禽基因图谱的构建第20-21页
     ·基因图谱构建的意义第21页
   ·数量性状位点(QTL)与主效基因分析第21-22页
   ·标记辅助渗入第22-23页
   ·杂交优势预测第23页
   ·小结第23页
 第三节 肉牛主要经济性状及评价第23-39页
   ·肉牛的主要经济性状第23-24页
     ·繁殖性状第23-24页
     ·生长性状第24页
     ·外形评分第24页
     ·胴体性状第24页
   ·肉牛的活体评价第24-29页
     ·成熟类型第24-25页
     ·脂肪和肌肉评估第25-29页
   ·肉牛的EPD评价及应用第29-30页
     ·肉牛EPD的提出第29页
     ·肉牛EPD的意义第29-30页
   ·肉牛胴体性状的遗传评价第30-39页
     ·肉牛胴体性状的遗传力第30-32页
     ·肉牛胴体性状之间的遗传相关第32-37页
     ·超声波测定技术在肉牛胴体性状遗传评价中的应用第37-39页
 第四节 牛基因图谱的构建第39-45页
   ·牛的物理图谱第39-43页
     ·牛的物理图谱构建的原理第39-40页
     ·牛的物理图谱构建的几种方法简介第40-42页
     ·已经构建的牛的物理图谱第42-43页
   ·牛的连锁图谱的构建第43-45页
     ·参考家系第43页
     ·牛的基因连锁图谱第43-45页
 第五节 牛生长抑素(myostatin)基因突变的表型效应及其遗传特性第45-51页
   ·双肌肉牛品种的起源和历史第45-46页
   ·生长抑素(myostatin)基因突变的表型效应第46-48页
     ·双肌动物的生理特征第46-47页
     ·双肌引起的生理异常第47-48页
   ·双肌性状的遗传特征第48-51页
     ·“双肌基因”及其遗传第48页
     ·生长抑素基因及其多态性研究第48-51页
 第六节 牛生长激素(GH)基因与牛的生长发育及胴体性状第51-53页
   ·牛的生长激素及其基因第51页
   ·bGH基因的多态性及其对生产性能的影响第51-53页
     ·bGH基因的多态性第51-52页
     ·bGH基因多态性对牛生产性能的影响第52-53页
   ·小结第53页
 第七节 牛胰岛素样生长因子系统及其基因第53-55页
   ·IGF系统概述第53-54页
   ·IGF系统各因子的基因定位第54页
   ·IGF系统各因子的基因多型性与牛的生产性能第54-55页
     ·IGF-1基因第54页
     ·IGFBP-3基因第54-55页
 第八节 影响肉牛产肉性状的其它候选基因第55-57页
   ·有关基因座及染色体定位第55页
   ·生长激素受体(GHR)基因第55页
   ·垂体特异性转录因子基因第55-56页
   ·Leptin(Lep)基因第56页
   ·前脂肪因子1(PREF-1)第56-57页
   ·其它可能与肉牛产肉性状相关的基因第57页
 第九节 影响肉牛产肉性状的QTLs及其染色体定位第57-62页
   ·牛生长性状的QTL第57-58页
   ·牛胴体性状的QTL第58页
   ·牛体型性状的QTL第58-60页
   ·牛产奶性状的QTL第60-62页
 第十节 牛肉口感性状及其分子标记辅助选择第62-66页
   ·牛肉嫩度与大理石纹的关系第62页
   ·与牛肉大理石纹和嫩度有关的理论第62-63页
   ·影响牛肉适口性的因素第63-64页
     ·品种第63页
     ·年龄第63页
     ·促生长剂的埋植第63-64页
   ·牛肉口感性状的分子标记辅助选择第64-65页
     ·甲状腺球蛋白基因第64页
     ·Leptin基因第64-65页
     ·钙蛋白酶抑制蛋白(Calpastatin)基因第65页
   ·小结第65-66页
 第十一节 微卫星DNA在牛遗传分化研究和肉牛育种中的应用第66-70页
   ·微卫星DNA第66页
   ·微卫星的变异及其影响因素第66页
   ·微卫星在牛的分子进化研究中的应用第66-70页
     ·牛的起源进化第66-67页
     ·牛起源分化的微卫星标记研究第67-69页
     ·微卫星标记中肉牛育种中的应用第69-70页
 第十二节 遗传标记在肉牛育种中的应用前景第70-74页
   ·育种值的估计第70页
   ·经济性状的遗传第70-71页
   ·发现影响经济性状的新基因第71页
   ·连锁平衡与连锁不平衡第71-72页
   ·已经确定的标记和基因的应用第72-73页
   ·小结第73-74页
第二部分 试验研究第74-125页
 引言第74页
 1 材料与方法第74-82页
   ·材料第74-78页
     ·样品的采集第74-75页
     ·数据的收集第75页
     ·试剂与溶液第75-76页
     ·PCR引物第76-78页
   ·方法第78-81页
     ·牛基因组DNA的提取第78页
     ·DNA质量的检测第78页
     ·秦川牛生长激素基因外元V与3’区多态基因座PCR-RFLP分析第78-79页
     ·牛生长激素基因127位和172位基因座的ASM-PCR分析第79页
     ·牛胰岛素样生长因子-1基因5’区PCR-RFLP分析第79页
     ·牛胰岛素样生长因子-1结合蛋白3基因PCR-RFLP分析第79-80页
     ·微卫星分析第80-81页
     ·图象分析第81页
   ·资料的统计与分析第81-82页
     ·等位基因频率、基因型频率的计算及x~2检验第81页
     ·位点杂合度和平均位点杂合度第81页
     ·多态信息含量第81页
     ·有效等位基因数第81-82页
     ·遗传距离第82页
     ·生产性能数据分析模型第82页
 2 结果与分析第82-115页
   ·牛基因组DNA样品的检测第82-83页
   ·候选基因基因座多态性的检测第83-88页
     ·秦川牛生长激素外元V和3’侧翼区PCR-RFLP多态性第83-84页
     ·秦川牛生长激素基因ASM-PCR多态性第84-86页
     ·秦川牛IGFBP-3基因座多态性PCR-RFLP分析第86-87页
     ·秦川牛IGF-1基因启动子区PCR-RFLP分析第87-88页
   ·8个中国黄牛品种15个微卫星位点的多态性检测第88-92页
     ·微卫星位点的PCR扩增结果的琼脂糖凝胶电泳第88页
     ·微卫星位点的PCR产物的聚丙烯酰胺(PAGE)检测第88-92页
   ·候选基因座多态性与秦川牛的生长发育及产肉性能的相关性分析第92-103页
     ·秦川牛生长激素基因ASM-PCR多态性与秦川牛早期生长性状的相关性第92-95页
     ·牛生长激素基因外元V和3’侧翼区序列PCR-RFLP多态性与秦川屠宰性状的相关性第95-97页
     ·秦川牛IGFBP-3基因多态基因座与产肉性状的相关性分析第97-103页
   ·微卫星位点的变异与秦川牛体尺性状及部分屠宰性状的相关性分析第103-110页
     ·秦川牛14个微卫星基因座群体的遗传特性第103-104页
     ·部分微卫星为点多态性与秦川牛体尺性状的相关性分析第104页
     ·部分微卫星位点多态性与秦川牛屠宰性状的相关性分析第104-110页
   ·中国8个黄牛品种群体遗传学特征的微卫星标记分析第110-115页
     ·13个位卫星位点的等位基因频率和基因型频率第110-111页
     ·位点杂合度和平均位点杂合度(Heterozygosity)第111页
     ·多态信息含量(PIC)第111-112页
     ·有效等位基因数(Ne)第112-113页
     ·8个黄牛品种间的遗传距离和聚类分析第113-115页
 3 讨论第115-121页
   ·4种DNA分子标记技术的比较第115-116页
   ·关于分子标记的有效性第116-117页
   ·关于侯选基因多态与秦川牛肉用性能的选育第117-118页
   ·关于微卫星位点多态秦川牛与体尺性状的选择第118-119页
   ·关于中国黄牛品种的遗传多样性的分析第119-120页
   ·中国中原黄牛的分类研究第120-121页
 4 结论第121-125页
附件1 8个黄牛品种13个微卫星位点的等位基因频率第125-135页
附件2 8个黄牛品种13个微卫星位点的基因型频率第135-154页
参考文献第154-172页
作者简介第172页

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