| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 第一部分 文献综述 | 第9-22页 |
| ·微卫星标记 | 第9-12页 |
| ·水稻微卫星标记的开发 | 第9-12页 |
| ·微卫星标记在水稻遗传育种中的发展背景与应用 | 第9-10页 |
| ·目前微卫星标记开发情况 | 第10页 |
| ·全自动化的SSR标记开发的方法 | 第10-11页 |
| ·连锁图谱的绘制及其意义 | 第11-12页 |
| ·水稻基因组研究计划 | 第12-22页 |
| ·水稻基因组测序计划 | 第12-14页 |
| ·水稻基因组测序背景 | 第12-13页 |
| ·测序进展 | 第13-14页 |
| ·亚种间的多态性 | 第14-15页 |
| ·亚种间基因组长度的变化 | 第14-15页 |
| ·亚种间单核苷酸多态性(SNPs) | 第15页 |
| ·植物基因组中GC含量的梯度变化 | 第15页 |
| ·重复序列分析情况 | 第15-17页 |
| ·转座子分析 | 第15-16页 |
| ·微卫星分布情况 | 第16-17页 |
| ·水稻图谱完成的情况 | 第17-18页 |
| ·同源性分析 | 第18页 |
| ·水稻与拟南芥基因组同线性 | 第18-19页 |
| ·水稻功能基因组学研究 | 第19-20页 |
| ·突变体库的构建 | 第19-20页 |
| ·对水稻基因组学研究的展望 | 第20-22页 |
| 第二部分 材料与方法 | 第22-32页 |
| ·材料 | 第22页 |
| ·数据、脚本及程序 | 第22页 |
| ·水稻材料 | 第22页 |
| ·主要实验设备仪器和试剂 | 第22-23页 |
| ·计算机资源 | 第22-23页 |
| ·实验设备 | 第23页 |
| ·分析方法 | 第23-32页 |
| ·non-primer数据准备 | 第23-25页 |
| ·微卫星标记的搜索 | 第25-27页 |
| ·引物的设计 | 第27-28页 |
| ·引物筛选 | 第28-29页 |
| ·引物合成 | 第29页 |
| ·微卫星在连锁图的分布 | 第29页 |
| ·微卫星含量分析 | 第29页 |
| ·微卫星标记的验证 | 第29-32页 |
| ·DNA提取 | 第29-30页 |
| ·PCR PROTOCOL及检测 | 第30页 |
| ·微卫星多态性分析 | 第30-31页 |
| ·遗传多态性及聚类分析 | 第31页 |
| ·共显性验证 | 第31-32页 |
| 第三部分 结果与分析 | 第32-49页 |
| ·已公布微卫星标记的屏蔽 | 第32-33页 |
| ·SSR的搜索 | 第33页 |
| ·引物的获取 | 第33-38页 |
| ·引物在染色体的分布 | 第38-41页 |
| ·引物分析 | 第41-43页 |
| ·全部引物的统计分析 | 第41-43页 |
| ·引物的多态性分析 | 第43页 |
| ·微卫星标记的验证 | 第43-44页 |
| ·共显性标记验证 | 第44-45页 |
| ·遗传多态性分析 | 第45页 |
| ·聚类分析 | 第45-47页 |
| ·第一染色体上的标记定位 | 第47-49页 |
| 第四部分 讨论 | 第49-56页 |
| ·大规模微卫星分子标记开发的前提以及水稻基因组测序计划 | 第49-50页 |
| ·建立以PCR为基础的微卫星标记开发体系 | 第50-51页 |
| ·扩增微卫星标记所需引物的设计原则 | 第51-52页 |
| ·引物的自动搜索和评价 | 第52页 |
| ·微卫星标记在水稻图谱上的整合 | 第52-53页 |
| ·微卫星序列的motif与分布的关系 | 第53-54页 |
| ·遗传距离与品种选育 | 第54-55页 |
| ·下一步工作的开展 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-60页 |
| 致谢 | 第60页 |