| 内容提要 | 第1-9页 |
| 第1章 绪论 | 第9-15页 |
| ·研究背景 | 第9-11页 |
| ·生物信息学 | 第9-10页 |
| ·基于机器学习的生物信息学 | 第10-11页 |
| ·本文工作 | 第11-15页 |
| ·研究方法 | 第11-12页 |
| ·主要研究内容和章节安排 | 第12-15页 |
| 第2章 生物信息学与机器学习相关算法 | 第15-43页 |
| ·引言 | 第15-16页 |
| ·生物信息学中的操纵子预测研究 | 第16-23页 |
| ·操纵子的定义 | 第16页 |
| ·操纵子预测的研究现状 | 第16-18页 |
| ·操纵子预测数据源 | 第18-20页 |
| ·操纵子预测相关数据库 | 第20-22页 |
| ·操纵子预测相关前期工作 | 第22-23页 |
| ·生物信息学中pathway预测研究 | 第23-27页 |
| ·pathway预测 | 第23-24页 |
| ·pathway预测的研究现状 | 第24-26页 |
| ·pathway预测的前期工作 | 第26-27页 |
| ·生物信息学中癌症分类方法的研究现状 | 第27-29页 |
| ·机器学习相关算法 | 第29-42页 |
| ·遗传算法 | 第30-32页 |
| ·决策树 | 第32-40页 |
| ·粗糙集理论基本知识 | 第40-42页 |
| ·本章小结 | 第42-43页 |
| 第3章 基于变精度粗糙集的决策树构造方法研究 | 第43-55页 |
| ·引言 | 第43页 |
| ·基于粗糙集的决策树构造方法 | 第43-45页 |
| ·基于变精度粗糙集(VPRSM)的决策树构造方法 | 第45-50页 |
| ·基本概念 | 第45-46页 |
| ·基于变精度粗糙集的决策树构造方法 | 第46-47页 |
| ·基于变精度粗糙集的决策树构造方法的一个例子 | 第47-50页 |
| ·实验结果 | 第50-53页 |
| ·数据集 | 第50-52页 |
| ·VPRSM算法与C4.5 算法的比较 | 第52-53页 |
| ·本章小结 | 第53-55页 |
| 第4章 基于多方法引导的遗传算法的操纵子预测 | 第55-71页 |
| ·引言 | 第55页 |
| ·数据准备 | 第55-56页 |
| ·初始种群 | 第56页 |
| ·适应度函数 | 第56-63页 |
| ·基于局部熵最小化的基因间距离 | 第58-61页 |
| ·新陈代谢通路 | 第61页 |
| ·COG基因功能 | 第61页 |
| ·基因对的微阵列表达值的相关系数 | 第61-63页 |
| ·选择、交叉和变异 | 第63-64页 |
| ·实验结果 | 第64-69页 |
| ·评价方法 | 第64-65页 |
| ·实验结果 | 第65-69页 |
| ·本章小结 | 第69-71页 |
| 第5章 基于变精度粗糙集的操纵子预测方法 | 第71-81页 |
| ·引言 | 第71页 |
| ·基于变精度粗糙集的操纵子预测 | 第71-77页 |
| ·数据准备 | 第71-72页 |
| ·基因组特征属性 | 第72-75页 |
| ·基于变精度粗糙集的操纵子预测 | 第75-77页 |
| ·实验结果及分析 | 第77-80页 |
| ·实验结果 | 第77-78页 |
| ·实验结果分析 | 第78-80页 |
| ·本章小结 | 第80-81页 |
| 第6章 基于信息熵的改进k-TSP癌症分类方法研究 | 第81-93页 |
| ·引言 | 第81页 |
| ·基于信息熵的改进k-TSP方法 | 第81-87页 |
| ·基因表达数据集 | 第81-82页 |
| ·k-TSP分类方法 | 第82-84页 |
| ·基于信息熵的改进k-TSP方法 | 第84-86页 |
| ·估计参数k与准确率的方法 | 第86-87页 |
| ·实验结果 | 第87-89页 |
| ·评价方法 | 第87页 |
| ·实验结果 | 第87-89页 |
| ·结果分析与讨论 | 第89-91页 |
| ·分类器中使用的基因个数 | 第89页 |
| ·用于微阵列分析的Pathway信息 | 第89-90页 |
| ·Ik-TSP分类器的生物意义 | 第90-91页 |
| ·本章小结 | 第91-93页 |
| 第7章 展望 | 第93-95页 |
| ·本文总结 | 第93-94页 |
| ·进一步设想 | 第94-95页 |
| 参考文献 | 第95-108页 |
| 攻读博士学位期间（待）发表的学术论文及取得的科研成果 | 第108-110页 |
| 致谢 | 第110-111页 |
| 摘要 | 第111-114页 |
| Abstract | 第114-116页 |