蛋白质结构数据库的快速搜索和多重蛋白质结构比对算法研究
| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 第一章 引言 | 第7-12页 |
| 第一节 蛋白质 | 第7页 |
| 第二节 蛋白质结构 | 第7-9页 |
| 第三节 课题研究背景和意义 | 第9-12页 |
| 第二章 材料和方法 | 第12-23页 |
| 第一节 数据集 | 第12-13页 |
| 2.1.1 评价多重结构比对算法的数据集 | 第12页 |
| 2.1.2 评价结构数据库的快速搜索算法的数据集 | 第12-13页 |
| 第二节 评价指标 | 第13-15页 |
| 2.2.1 多重结构比对算法的评价指标 | 第13-14页 |
| 2.2.2 评价结构数据库的快速搜索算法的指标 | 第14-15页 |
| 第三节 TM-align算法简介 | 第15-16页 |
| 2.3.1 确定初始比对 | 第15-16页 |
| 2.3.2 启发式迭代 | 第16页 |
| 第四节 mTM-align多重结构比对算法流程 | 第16-19页 |
| 2.4.1 通过TM-align进行两两结构比对 | 第17-18页 |
| 2.4.2 构建进化树 | 第18页 |
| 2.4.3 构建多重结构比对 | 第18-19页 |
| 第五节 结构数据库的快速搜索算法流程 | 第19-23页 |
| 2.5.1 数据库处理 | 第19-20页 |
| 2.5.2 结构数据库的快速搜索算法 | 第20-23页 |
| 第三章 结果和讨论 | 第23-43页 |
| 第一节 多重结构比对算法的结果和讨论 | 第23-34页 |
| 3.1.1 参数选择 | 第23-24页 |
| 3.1.2 mTM-align和其他算法的比较 | 第24-28页 |
| 3.1.3 mTM-align的运行时间分析 | 第28-29页 |
| 3.1.4 影响mTM-align表现的因素 | 第29-31页 |
| 3.1.5 结果分析 | 第31-34页 |
| 第二节 结构数据库的快速搜索算法的结果和讨论 | 第34-38页 |
| 第三节 服务器的输入和输出 | 第38-43页 |
| 3.3.1 服务器的输入 | 第38-39页 |
| 3.3.2 服务器的输出 | 第39-43页 |
| 第四章 结论 | 第43-44页 |
| 致谢 | 第44-45页 |
| 参考文献 | 第45-48页 |
| 个人简历 | 第48页 |
