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铜绿假单胞菌关键致病因子ExsA的调节机制

中文摘要第3-4页
Abstract第4页
1 绪论第8-26页
    1.1 铜绿假单胞菌的致病性第8-9页
    1.2 群集感应系统第9-13页
        1.2.1 群集感应系统的组分第9-10页
        1.2.2 群体感应系统之间的关系第10-12页
        1.2.3 群体感应系统和多种毒性因子的形成有关第12-13页
    1.3 生物膜第13-16页
        1.3.1 生物膜的存在形式第13-14页
        1.3.2 生物膜时间上的发展第14-15页
        1.3.3 生物膜空间上的发展第15-16页
    1.4 Ⅲ型分泌系统(T3SS)第16-19页
    1.5 耐药性第19-25页
        1.5.1 细菌耐药的普遍性第19-20页
        1.5.2 细菌耐药产生的外因第20页
        1.5.3 铜绿假单胞菌耐药的机制第20-21页
        1.5.4 对细菌感染采取的策略第21-24页
        1.5.5 我国细菌耐药性的现状第24-25页
    1.6 本论文研究的内容和意义第25-26页
2 铜绿假单胞菌关键致病调节因子ExsA的转录调控分子靶标筛选第26-48页
    2.1 引言第26页
    2.2 实验材料第26-29页
        2.2.1 菌株第26-27页
        2.2.2 质粒第27页
        2.2.3 主要酶及试剂第27页
        2.2.4 实验仪器第27-28页
        2.2.5 主要试剂的配制第28-29页
    2.3 试验方法第29-38页
        2.3.1 感受态细胞的制备第29页
        2.3.2 电转化实验第29-30页
        2.3.3 铜绿假单胞菌基因组 DNA 的提取第30页
        2.3.4 质粒的提取方法(生工)第30-31页
        2.3.5 PCR产物的纯化第31-32页
        2.3.6 蛋白的小量表达第32页
        2.3.7 蛋白的大量表达第32-34页
        2.3.8 SDS-PAGE第34页
        2.3.9 Native胶的配制(6%)第34页
        2.3.10 凝胶迁移实验第34-35页
        2.3.11 Chip-sep染色质免疫共沉淀的方法第35页
        2.3.12 DNA片段构建测序文库第35-36页
        2.3.13 文库序列的测定第36页
        2.3.14 EMSA反应第36-37页
        2.3.15 PCR反应第37页
        2.3.16 样品浓度的计算第37-38页
    2.4 结果与分析第38-46页
        2.4.1 ExsA的ChIP-seq结果第38-40页
        2.4.2 MEME分析序列的mitif第40-43页
        2.4.3 ChIP-seq结果的分类第43页
        2.4.4 凝胶迁移实验(EMSA)检测ExsA与基因片段的结合力第43-44页
        2.4.5 ExsA与VqsM之间可能存在互作系统第44-45页
        2.4.6 wzZ启动子区域具有多个高度保守序列第45-46页
    2.5 讨论第46-47页
    2.6 本章小结第47-48页
3 ExsA对靶标的调控第48-72页
    3.1 引言第48-49页
    3.2 实验材料第49-50页
        3.2.1 菌株第49页
        3.2.2 表达载体第49页
        3.2.3 主要酶及试剂第49-50页
        3.2.4 实验中所用溶液的配制第50页
    3.3 试验方法第50-57页
        3.3.1 细菌的培养第50页
        3.3.2 过表达载体的构建第50-55页
        3.3.3 发光载体构建第55-56页
        3.3.4 细菌实验第56-57页
    3.4 结果第57-69页
        3.4.1 启动子载体的构建第57-58页
        3.4.2 过表达载体的构建第58-59页
        3.4.3 启动子-lux的表达第59-64页
        3.4.4 ExsA对靶基因的调节第64-66页
        3.4.5 ExsA对铜绿假单胞菌其它代谢系统的调节第66-68页
        3.4.6 细菌活性实验第68-69页
    3.5 讨论第69-71页
    3.6 本章小结第71-72页
参考文献第72-80页
在学期间的研究成果第80-82页
致谢第82页

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