LCS及其变体问题的算法研究
| 致谢 | 第1-4页 |
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-12页 |
| ·生物学背景 | 第8页 |
| ·最长公共子序列 | 第8-9页 |
| ·带约束的最长公共子序列 | 第9-10页 |
| ·本文的研究意义 | 第10页 |
| ·本文主要研究内容及组织方式 | 第10-12页 |
| 第二章 LCS 与CLCS 问题 | 第12-27页 |
| ·LCS 算法 | 第12-17页 |
| ·LCS 基本算法 | 第12-13页 |
| ·线性空间算法 | 第13-14页 |
| ·Hischberg 算法 | 第14-15页 |
| ·Hunt-Szymanski 算法 | 第15-16页 |
| ·对偶算法 | 第16-17页 |
| ·CLCS 算法 | 第17-22页 |
| ·基本CLCS 算法 | 第18页 |
| ·基于动态规划的CLCS 算法 | 第18-21页 |
| ·基于分而治之的CLCS 算法 | 第21-22页 |
| ·LCS 与CLCS 的相关问题 | 第22-25页 |
| ·多序列比对 | 第22-23页 |
| ·受限的LCS | 第23-24页 |
| ·近似字符串匹配 | 第24-25页 |
| ·编辑距离 | 第25页 |
| ·结语 | 第25-27页 |
| 第三章 多序列LCS 与CLCS 改进算法 | 第27-40页 |
| ·多序列LCS 改进算法LALCS 和RALCS | 第27-34页 |
| ·定义和符号 | 第27-28页 |
| ·基本近似LCS 算法 | 第28-29页 |
| ·线性近似LALCS 算法 | 第29-31页 |
| ·迭代近似RALCS 算法 | 第31-33页 |
| ·实验验证 | 第33-34页 |
| ·两种多序列的CLCS 改进算法 | 第34-39页 |
| ·基本近似CLCS 算法 | 第35-38页 |
| ·两种近似CLCS 改进算法 | 第38-39页 |
| ·结语 | 第39-40页 |
| 第四章 带约束的序列比对 | 第40-47页 |
| ·定义与符号 | 第40-41页 |
| ·重要推论 | 第41-42页 |
| ·基于回溯的CSA 改进算法 | 第42-43页 |
| ·基于回溯的CLCS 算法 | 第42-43页 |
| ·基于回溯的CSA 改进算法框架 | 第43页 |
| ·算法性能 | 第43页 |
| ·基于分而治之的CSA 改进算法 | 第43-44页 |
| ·基于分而治之的CSA 改进算法 | 第43-44页 |
| ·算法性能 | 第44页 |
| ·实例验证 | 第44-45页 |
| ·结语 | 第45-47页 |
| 第五章 总结与展望 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-51页 |
| 发表论文 | 第51-52页 |
| 详细摘要 | 第52-55页 |
