| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 缩略词索引 | 第7-11页 |
| 第一章 背景 | 第11-27页 |
| 1.1 CRISPR/Cas系统 | 第11-16页 |
| 1.1.1 CRISPR系统的应用 | 第12-15页 |
| 1.1.2 CRISPR/dCas9系统荧光标记的应用 | 第15-16页 |
| 1.2 染色体结构研究方法 | 第16-20页 |
| 1.2.1 荧光原位杂交 | 第17-18页 |
| 1.2.2 染色质构象捕获 | 第18-20页 |
| 1.2.3 染色体结构研究技术发展 | 第20页 |
| 1.3 染色体结构与功能研究 | 第20-27页 |
| 1.3.1 表观遗传 | 第20-21页 |
| 1.3.2 异染色质 | 第21-22页 |
| 1.3.3 粘连蛋白 | 第22页 |
| 1.3.4 CTCF | 第22-23页 |
| 1.3.5 DNA环(DNA loop) | 第23-24页 |
| 1.3.6 拓扑相关结构域TAD | 第24-25页 |
| 1.3.7 空间区室Compartment | 第25页 |
| 1.3.8 相分离Phase Separation | 第25-27页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第27-38页 |
| 2.1 主要仪器 | 第27页 |
| 2.2 主要试剂 | 第27-28页 |
| 2.3 实验方法 | 第28-38页 |
| 2.3.1 质粒构建 | 第28-32页 |
| 2.3.1.1 退火 | 第28页 |
| 2.3.1.2 聚合酶链式反应(PCR) | 第28-29页 |
| 2.3.1.3 消化反应 | 第29页 |
| 2.3.1.4 葡聚糖凝胶电泳 | 第29页 |
| 2.3.1.5 连接反应 | 第29-30页 |
| 2.3.1.6 转化反应 | 第30-31页 |
| 2.3.1.7 大肠杆菌培养与质粒抽提 | 第31-32页 |
| 2.3.1.8 验证 | 第32页 |
| 2.3.2 细胞实验 | 第32-34页 |
| 2.3.2.1 细胞培养 | 第32-33页 |
| 2.3.2.2 质粒转染 | 第33页 |
| 2.3.2.3 细胞同步化 | 第33页 |
| 2.3.2.4 成像 | 第33-34页 |
| 2.3.3 体外实验 | 第34-36页 |
| 2.3.3.1 sgRNA的制备 | 第34-35页 |
| 2.3.3.1.1 质粒构建 | 第34页 |
| 2.3.3.1.2 体外转录(In vitro transcription, IVT) | 第34-35页 |
| 2.3.3.2 dCasg制备 | 第35页 |
| 2.3.3.2.1 质粒构建 | 第35页 |
| 2.3.3.2.2 dCas9蛋白制备 | 第35页 |
| 2.3.3.3 细胞固定 | 第35页 |
| 2.3.3.4 玻片包被 | 第35-36页 |
| 2.3.3.5 染色 | 第36页 |
| 2.3.3.6 成像 | 第36页 |
| 2.3.4 数据分析与处理 | 第36-38页 |
| 第三章 实验结果 | 第38-51页 |
| 3.1 染色体荧光标记系统的建立 | 第38-40页 |
| 3.2 染色体荧光标记系统的优化 | 第40-42页 |
| 3.3 不同改造体系结果对比 | 第42-43页 |
| 3.4 体外实验 | 第43-44页 |
| 3.5 活细胞中重复序列的标记 | 第44-46页 |
| 3.6 TAD结构的观察 | 第46-48页 |
| 3.7 Compartment结构观察 | 第48-51页 |
| 第四章 讨论 | 第51-55页 |
| 参考文献 | 第55-66页 |
| 致谢 | 第66页 |
