| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 目录 | 第8-11页 |
| 第一章 文章综述 | 第11-23页 |
| 1.1 优质小麦 | 第11-16页 |
| 1.1.1 优质强筋小麦 | 第11页 |
| 1.1.2 优质弱筋小麦 | 第11页 |
| 1.1.3 小麦醇溶蛋白 | 第11-12页 |
| 1.1.4 小麦籽粒的淀粉 | 第12-13页 |
| 1.1.5 小麦的淀粉合成及其关键酶 | 第13-15页 |
| 1.1.5.1 腺苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(AGPP) | 第14页 |
| 1.1.5.2 淀粉合成酶( SS) | 第14页 |
| 1.1.5.3 淀粉分支酶( SBE) | 第14-15页 |
| 1.1.5.4 淀粉去分支酶(DBE) | 第15页 |
| 1.1.6 小麦转录组研究现状 | 第15-16页 |
| 1.2 转录组学研究的基本方法 | 第16-22页 |
| 1.2.1 Sanger 法测序 | 第16页 |
| 1.2.2 基因芯片 | 第16-18页 |
| 1.2.3 高通量测序技术 | 第18-20页 |
| 1.2.3.1 第二代测序法和 Sanger 法的差异 | 第18-19页 |
| 1.2.3.2 代测序的主要原理 | 第19页 |
| 1.2.3.3 文库测序 | 第19-20页 |
| 1.2.4 序列组装及功能注释 | 第20页 |
| 1.2.5 表达量（RPKM）计算 | 第20-21页 |
| 1.2.6 Unigenes 注释 | 第21-22页 |
| 1.2.6.1 差异表达基因 GO 及 KEGG 富集分析 | 第22页 |
| 1.3 本研究的目的和意义 | 第22-23页 |
| 第二章 优质小麦籽粒发育转录组测序及数据库建立 | 第23-38页 |
| 2.1 材料 | 第23-25页 |
| 2.1.1 研究对象 | 第23-24页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第24页 |
| 2.1.3 主要仪器 | 第24-25页 |
| 2.2 实验方法 | 第25-34页 |
| 2.2.1 样品采集 | 第25页 |
| 2.2.2 RNA 提取及纯化 | 第25-26页 |
| 2.2.3 mRNA 纯化 | 第26-27页 |
| 2.2.4 打断 mRNA | 第27-28页 |
| 2.2.5 cDNA 的合成 | 第28-32页 |
| 2.2.6 电泳切胶 | 第32页 |
| 2.2.7 PCR 扩增 | 第32-33页 |
| 2.2.8 上机测序 | 第33-34页 |
| 2.3 结果与分析 | 第34-36页 |
| 2.3.1 总 RNA、测序文库质量检测 | 第34-36页 |
| 2.3.2 测序数据分析 | 第36页 |
| 2.4 讨论 | 第36-37页 |
| 2.5 本章小结 | 第37-38页 |
| 第三章 优质小麦籽粒发育转录组功能注释及代谢通路分析 | 第38-47页 |
| 3.1 分析方法 | 第38页 |
| 3.2 分析结果 | 第38-44页 |
| 3.2.1 蛋白质数据库比对结果 | 第38-39页 |
| 3.2.2 nr数据库比对结果 | 第39-40页 |
| 3.2.3 GO 功能分类 | 第40-41页 |
| 3.2.4 COG 功能分类 | 第41-42页 |
| 3.2.5 KEGG 代谢通路分析 | 第42-44页 |
| 3.3 讨论 | 第44-45页 |
| 3.4 本章小结 | 第45-47页 |
| 第四章 优质小麦品质相关基因的挖掘 | 第47-53页 |
| 4.1 分析方法 | 第47页 |
| 4.2 结果分析 | 第47-50页 |
| 4.2.1 总体差异量分析 | 第47-48页 |
| 4.2.2 优质小麦中醇溶蛋白相关基因的挖掘 | 第48-49页 |
| 4.2.3 优质小麦中碳水化合物合成途径相关基因挖掘 | 第49-50页 |
| 4.3 讨论 | 第50-52页 |
| 4.4 本章小结 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
| 个人简历 | 第59页 |
