摘要 | 第1-9页 |
Abstract | 第9-12页 |
第一章 遗传标记和现代人的起源和迁徙 | 第12-48页 |
1 分子生物学与人类学研究 | 第12-16页 |
·人类在自然界的分类 | 第12-13页 |
·人科物种的进化 | 第13-15页 |
·用分子生物学手段研究人类学:分子人类学 | 第15-16页 |
2 遗传标记系统 | 第16-30页 |
·遗传物质和遗传标记 | 第16-17页 |
·分子遗传标记 | 第17-18页 |
·遗传标记系统 | 第18-30页 |
·父系遗传标记系统:Y染色体DNA | 第18-27页 |
·Y-SNP单倍群 | 第19-20页 |
·Y-SNP单倍群在世界范围内的分布 | 第20-25页 |
·Y-SNP与时间估计 | 第25-27页 |
·母系遗传标记系统:线粒体DNA | 第27-30页 |
·线粒体DNA单倍体群 | 第28-29页 |
·线粒体DNA单倍体群在世界范围内的分布 | 第29-30页 |
3 关于现代人的起源和迁徙问题的研究进展 | 第30-40页 |
·现代人的起源 | 第30-36页 |
·涉及现代人起源问题的两种模式 | 第30-32页 |
·线粒体DNA和Y染色体证据支持非洲起源说 | 第32-34页 |
·古DNA证据不支持多地区起源说 | 第34-36页 |
·现代人走出非洲后向亚洲和美洲的迁徙 | 第36-40页 |
参考文献 | 第40-48页 |
第二章 Y染色体、线粒体和常染色体DNA遗传标记实验研究方法 | 第48-72页 |
1 样本DNA制备 | 第48页 |
·样本DNA的提取 | 第48页 |
·样本DNA的定量和保存 | 第48页 |
2 Y染色体单倍型分型方法 | 第48-63页 |
·Y-SNP分型方法 | 第48-61页 |
·Taqman分型方法 | 第49-60页 |
·SNaPshot分析方法 | 第60-61页 |
·其他SNP分型方法 | 第61页 |
·Y-STR分型方法 | 第61-63页 |
3 线粒体编码区SNP的分型方法 | 第63-70页 |
·线粒体高变区测序 | 第63-66页 |
·线粒体编码区SNP分型 | 第66-70页 |
4 常染色体SNP分型方法 | 第70-71页 |
参考文献 | 第71-72页 |
第三章 中国西北地区群体的父系遗传结构 | 第72-96页 |
1 前言 | 第72-73页 |
2 材料与方法 | 第73-75页 |
·群体样本 | 第73页 |
·实验方法 | 第73-74页 |
·数据分析 | 第74-75页 |
3 结果 | 第75-89页 |
·Y染色体单倍群的频率分布 | 第75-79页 |
·群体聚类 | 第79-80页 |
·中国西北地区群体的Y染色体单倍群类型 | 第80-89页 |
·单倍群C | 第80-83页 |
·单倍群D | 第83-84页 |
·单倍群O | 第84-86页 |
·单倍群N | 第86-87页 |
·单倍群J | 第87-88页 |
·单倍群R | 第88-89页 |
4 讨论 | 第89-93页 |
·欧亚大陆东西部特征谱系在西北人群中的混合比例 | 第89-90页 |
·欧亚大陆的基因交流 | 第90-91页 |
·西北地区各群体的Y染色体的来源和历史 | 第91-93页 |
参考文献 | 第93-96页 |
第四章 中国西南喜马拉雅东麓群体迁徙路线 | 第96-114页 |
1 前言 | 第96页 |
2 材料与方法 | 第96-102页 |
·群体样本 | 第96-97页 |
·实验方法 | 第97页 |
·数据分析 | 第97-102页 |
3 结果 | 第102-109页 |
·Y染色体单倍群的频率分布 | 第102-103页 |
·多维尺度分析 | 第103-104页 |
·分子方差分析 | 第104-106页 |
·遗传组分结构分析 | 第106-107页 |
·单倍群网络结果分析 | 第107-108页 |
·平均基因多样性 | 第108-109页 |
4 讨论 | 第109-112页 |
·汉藏群体的起源 | 第109-110页 |
·群体进入喜马拉雅东麓的两条路径 | 第110页 |
·其他单倍群所反映的群体迁徙历史 | 第110-112页 |
参考文献 | 第112-114页 |
第五章 乙醇脱氢酶ADH1B基因在西藏群体中的多样性研究 | 第114-135页 |
1 背景介绍 | 第114-118页 |
2 材料与方法 | 第118-122页 |
·群体样本 | 第118-120页 |
·实验方法 | 第120页 |
·数据分析 | 第120-122页 |
·数据预处理及基因频率分布分析 | 第120-121页 |
·基因多样牲和网络结构分析 | 第121页 |
·正选择效应检验 | 第121-122页 |
3 结果 | 第122-131页 |
·单倍群的频率,多样性及分布 | 第122-126页 |
·长区域单倍型网络结构分析 | 第126-129页 |
·核心单倍型的正选择信号检验 | 第129-131页 |
4 讨论 | 第131-133页 |
·ADH1B基因的H7单倍群起源于汉藏共同的祖先 | 第131页 |
·ADH1B*47His基因正选择效应的驱动力 | 第131-133页 |
参考文献 | 第133-135页 |
第六章 后续研究展望与设想 | 第135-140页 |
1 汉藏同源的遗传学研究 | 第135-136页 |
2 中国各地区回族的起源 | 第136-137页 |
3 ADH和ALDH基因在东亚的进化及其与疾病的相关性研究 | 第137-139页 |
参考文献 | 第139-140页 |
攻读博士期间论文发表与项目参与情况 | 第140-142页 |
致谢 | 第142-144页 |