| Abstract | 第6-9页 |
| 摘要 | 第10-12页 |
| Abbreviations | 第12-13页 |
| 1 INTRODUCTION | 第13-24页 |
| 1.1 Background | 第13-16页 |
| 1.2 Expressed sequence tag(EST) | 第16-17页 |
| 1.3 BAC end sequence(BES)or Genome Survey Sequences(GSS) | 第17-18页 |
| 1.4 SSR(Simple sequence repeat) | 第18-19页 |
| 1.5 Utilization of EST and BES in the development of SSR marker | 第19-20页 |
| 1.6 Use of SSR marker in plant breeding | 第20-22页 |
| 1.6.1 Germplasm characterization and Genetic diversity study | 第20-21页 |
| 1.6.2 Population genetic study | 第21页 |
| 1.6.3 Hybrid identification and ploidy determination | 第21-22页 |
| 1.6.4 Genetic mapping and marker assisted selection | 第22页 |
| 1.7 Objectives | 第22-24页 |
| 2 REVIEWS | 第24-46页 |
| 2.1 Development and characterization of SSR marker in crop plants | 第24-28页 |
| 2.2 The Molecular marker research in Citrus | 第28-37页 |
| 2.2.1 RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)markers | 第29-30页 |
| 2.2.2 AFLP(Amplified Fragment Length Polymorphism)markers | 第30-31页 |
| 2.2.3 RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA)markers | 第31-33页 |
| 2.2.4 ISSR(Inter Simple Sequence Repeats)markers | 第33-34页 |
| 2.2.5 SSR(Simple Sequences Repeat)markers | 第34-36页 |
| 2.2.6 Retrotransposon base markers | 第36-37页 |
| 2.2.7 Others markers | 第37页 |
| 2.3 Utilization of SSR markers in the linkage map construction in plant | 第37-39页 |
| 2.4 Progress in linkage map of fruit tree species | 第39-46页 |
| 2.4.1 Apple(Malus×domestica) | 第40页 |
| 2.4.2 Almond(Prunus dulcis L) | 第40-41页 |
| 2.4.3 Peach(Prunus persica L) | 第41-42页 |
| 2.4.4 Apricot(Prunus.armeniaca L) | 第42-43页 |
| 2.4.5 Citrus(Citrus spp.) | 第43-46页 |
| 3 MATERIALS AND METHODS | 第46-52页 |
| 3.1 Plant Materials | 第46页 |
| 3.2 DNA extraction | 第46-47页 |
| 3.3 Retrieval and processing of BES and EST sequences | 第47-48页 |
| 3.4 Mining of BES and EST sequences for microsatellite | 第48页 |
| 3.5 Primer design | 第48页 |
| 3.6 PCR amplification and PAGE analysis | 第48-49页 |
| 3.7 Functional annotation | 第49页 |
| 3.8 Sequencing of the SSR band | 第49-50页 |
| 3.9 Data Collection and Analysis | 第50-52页 |
| 4 RESULTS | 第52-79页 |
| 4.1 Development and characterization of Citrus SSR marker | 第52-58页 |
| 4.2 Functional annotations of Citrus EST and BES SSR markers | 第58-61页 |
| 4.3 Transferability of Citrus SSR markers across the related genera | 第61-64页 |
| 4.4 Utility of Citrus SSR marker for genetic mapping | 第64-66页 |
| 4.5 Utility of Citrus SSR marker in establishing genetic relationship | 第66-70页 |
| 4.6 Utility of Citrus SSR as population genetic marker | 第70-72页 |
| 4.7 Linkage map of Citrus reticulata and Poncirus trifoliata | 第72-79页 |
| 5 DISCUSSIONS | 第79-90页 |
| 5.1 Development and characterization of citrus SSR marker | 第79-80页 |
| 5.2 Functional annotations of citrus SSR markers | 第80-81页 |
| 5.3 Transferability of citrus SSR markers across the related genera | 第81-82页 |
| 5.4 Utility of Citrus SSR marker for genetic mapping | 第82-83页 |
| 5.5 Utility of Citrus SSR marker in establishing genetic relationship | 第83-87页 |
| 5.6 Utility of Citrus SSR as population genetic marker | 第87页 |
| 5.7 Linkage map of Citrus reticulata and Poncirus trifoliata | 第87-90页 |
| 6 CONCLUSION | 第90-92页 |
| 7 REFERENCES | 第92-110页 |
| Acknowledgements | 第110-111页 |
| Appendix-Ⅰ | 第111-113页 |
| Appendix-Ⅱ | 第113-114页 |
| Appendix-Ⅲ | 第114-119页 |
| List of publication during Ph D | 第119-120页 |
| 作者简介 | 第120-125页 |
