| 摘要 | 第10-13页 |
| Abstract | 第13-16页 |
| 第一章 绪论 | 第17-47页 |
| 第一节 结核病概况 | 第17-21页 |
| 1.1 结核病流行现状 | 第17-18页 |
| 1.2 结核菌的分类、形态与结构 | 第18-20页 |
| 1.3 结核病的常规临床诊断和治疗 | 第20-21页 |
| 第二节 异烟肼耐药概述 | 第21-26页 |
| 2.1 异烟肼药物作用机制 | 第21-22页 |
| 2.2 异烟肼耐药机制 | 第22-26页 |
| 第三节 结核耐药突变检测现状 | 第26-28页 |
| 3.1 结核耐药传统和分子检测平台 | 第26页 |
| 3.2 结核耐药突变分子检测试剂盒 | 第26-27页 |
| 3.3 结核异烟肼耐药突变分子检测的意义 | 第27-28页 |
| 第四节 熔解曲线分析技术 | 第28-35页 |
| 4.1 PMA适用机型 | 第28-29页 |
| 4.2 PMA在结核耐药突变检测上的应用 | 第29-33页 |
| 4.3 改良分子信标 | 第33页 |
| 4.4 PMA动力学 | 第33-35页 |
| 第五节 本论文的研究目的、内容和意义 | 第35-37页 |
| 参考文献 | 第37-47页 |
| 第二章 异烟肼耐药突变PMA检测体系的建立和性能评价 | 第47-79页 |
| 第一节 引言 | 第47-48页 |
| 第二节 材料和方法 | 第48-53页 |
| 2.1 实时PCR扩增的引物及探针的设计 | 第48-49页 |
| 2.2 菌株和质粒来源 | 第49-50页 |
| 2.3 核酸提取 | 第50-51页 |
| 2.4 PCR仪器 | 第51页 |
| 2.5 PCR扩增和熔解程序 | 第51页 |
| 2.6 结果统计 | 第51-52页 |
| 2.7 测序分析 | 第52-53页 |
| 第三节 结果与分析 | 第53-74页 |
| 3.1 人工靶序列熔解曲线 | 第53-59页 |
| 3.2 标本DNA提取方法比较 | 第59页 |
| 3.3 PMA体系的分析灵敏度评价 | 第59-61页 |
| 3.4 PMA体系的特异性评价 | 第61-63页 |
| 3.5 PMA体系的NTM特异性评价 | 第63-64页 |
| 3.6 PMA体系不均一耐药突变检测能力评价 | 第64-68页 |
| 3.7 PMA体系重复性评价 | 第68-69页 |
| 3.8 PMA体系适用机型评价 | 第69-74页 |
| 第四节 讨论 | 第74-77页 |
| 参考文献 | 第77-79页 |
| 第三章 PMA体系的多中心验证 | 第79-99页 |
| 第一节 引言 | 第79-80页 |
| 第二节 材料和方法 | 第80-81页 |
| 2.1 参考菌株 | 第80页 |
| 2.2 结核临床菌株 | 第80页 |
| 2.3 核酸提取 | 第80页 |
| 2.4 PCR仪器 | 第80页 |
| 2.5 PCR扩增和熔解程序 | 第80-81页 |
| 2.6 统计分析 | 第81页 |
| 2.7 测序分析 | 第81页 |
| 第三节 结果与分析 | 第81-91页 |
| 3.1 PMA体系检测通量 | 第81页 |
| 3.2 PMA体系判定标准 | 第81-82页 |
| 3.3 PMA体系检测结果与药敏比较 | 第82-83页 |
| 3.4 PMA体系检测结果与测序结果比较 | 第83-88页 |
| 3.5 临床异烟肼不均一耐药突变株 | 第88-91页 |
| 第四节 讨论 | 第91-94页 |
| 参考文献 | 第94-99页 |
| 第四章 厦门和漳州两地异烟肼耐药的流行病学分析 | 第99-110页 |
| 第一节 前言 | 第99-100页 |
| 第二节 材料与方法 | 第100-101页 |
| 2.1 结核分枝杆菌标准株H37Rv | 第100页 |
| 2.2 菌株来源 | 第100-101页 |
| 2.3 核酸提取 | 第101页 |
| 2.4 主要试剂、仪器与PCR扩增和熔解程序 | 第101页 |
| 2.5 判读标准 | 第101页 |
| 2.6 测序分析 | 第101页 |
| 第三节 结果 | 第101-105页 |
| 3.1 临床标本检测流程 | 第101-102页 |
| 3.2 临床标本检测 | 第102-105页 |
| 第四节 讨论 | 第105-108页 |
| 参考文献 | 第108-110页 |
| 第五章 实时PAP定量检测结核异烟肼耐药突变 | 第110-133页 |
| 第一节 引言 | 第110-113页 |
| 第二节 材料和方法 | 第113-115页 |
| 2.1 质粒和痰标本的来源及提取方法 | 第113页 |
| 2.2 引物设计和合成制备 | 第113-114页 |
| 2.3 实时PAP反应体系、扩增程序和仪器 | 第114页 |
| 2.4 DNA测序分析 | 第114-115页 |
| 2.5 统计分析 | 第115页 |
| 第三节 结果与分析 | 第115-126页 |
| 3.1 PAP引物制备验证 | 第115-116页 |
| 3.2 实时PAP体系分析灵敏度评价 | 第116-117页 |
| 3.3 实时PAP体系分析特异性评价 | 第117-119页 |
| 3.4 实时PAP体系分析选择性评价 | 第119-122页 |
| 3.5 实时PAP检测阈值定义 | 第122-123页 |
| 3.6 临床标本检测 | 第123-126页 |
| 第四节 讨论 | 第126-130页 |
| 参考文献 | 第130-133页 |
| 附表 46株分枝杆菌中文名和拉丁文名索引 | 第133-135页 |
| 英文缩写索引 | 第135-137页 |
| 博士期间发表交流论文 | 第137-138页 |
| 致谢 | 第138页 |