| 摘要 | 第9-11页 |
| Abstract | 第11-12页 |
| 缩略词表 | 第13-14页 |
| 第一部分 基因变异对奶牛繁殖产奶性状影响的分析 | 第14-59页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-23页 |
| 1.1 引言 | 第14-16页 |
| 1.2 候选基因研究进展 | 第16-22页 |
| 1.2.1 甲状旁腺素相关蛋白(parathyroid hormone-related protein,PTHRP)基因 | 第16-19页 |
| 1.2.2 TGFB1(转化生长因子-β1)基因 | 第19-20页 |
| 1.2.3 PTK2(粘着斑激酶)基因 | 第20-21页 |
| 1.2.4 MAF1(同源酿酒酵母)基因 | 第21页 |
| 1.2.5 PHF20(指蛋白20)基因 | 第21-22页 |
| 1.3 研究目的和意义 | 第22-23页 |
| 第二章 材料与方法 | 第23-34页 |
| 2.1 实验材料 | 第23页 |
| 2.1.1 实验牛 | 第23页 |
| 2.1.2 血液样品的采集和提取方法 | 第23页 |
| 2.2 主要仪器与设备 | 第23-24页 |
| 2.3 主要的试剂及配制 | 第24-26页 |
| 2.3.1 主要试剂的配制 | 第24-25页 |
| 2.3.2 其他试剂 | 第25-26页 |
| 2.4 试验方法 | 第26-34页 |
| 2.4.1 基因组DNA的提取 | 第26-28页 |
| 2.4.2 聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction,PCR) | 第28-29页 |
| 2.4.3 SNPs的检测 | 第29页 |
| 2.4.4 PCR产物酶切及电泳 | 第29-30页 |
| 2.4.5 分子生物学软件和数据分析软件 | 第30页 |
| 2.4.6 群体遗传学研究和数据统计分析 | 第30-34页 |
| 第三章 结果与分析 | 第34-55页 |
| 3.1 PTHRP基因 | 第34-39页 |
| 3.1.1 牛的PTHRP基因目的片段扩增结果 | 第34页 |
| 3.1.2 PTHRP基因的基因多态性检测 | 第34页 |
| 3.1.3 牛PTHRP基因SNP位点的PCR-RFLP多态性检测结果 | 第34-35页 |
| 3.1.4 奶牛PTHRP基因的变异特征 | 第35-36页 |
| 3.1.5 PTHRP基因型与荷斯坦奶牛生产性状的关联分析 | 第36-39页 |
| 3.2 PTK2基因 | 第39-43页 |
| 3.2.1 牛的PTK2基因目的片段扩增结果 | 第39页 |
| 3.2.2 牛PTK2基因SNP位点的CRS-PCR-RFLP多态性检测结果 | 第39页 |
| 3.2.3 奶牛PTK2基因的变异特征 | 第39-41页 |
| 3.2.4 PTK2基因型与荷斯坦奶牛生产性状的关联分析 | 第41-43页 |
| 3.3 MAF1基因 | 第43-48页 |
| 3.3.1 牛的MAF1基因目的片段扩增结果 | 第43页 |
| 3.3.2 牛MAF1基因SNP位点的PCR-RFLP多态性检测结果 | 第43页 |
| 3.3.3 奶牛MAF1基因的变异特征 | 第43-45页 |
| 3.3.4 MAF1基因型与荷斯坦奶牛生产性状的关联分析 | 第45-48页 |
| 3.4 PHF20基因 | 第48-53页 |
| 3.4.1 牛的PHF20基因目的片段扩增结果 | 第48页 |
| 3.4.2 牛PHF20基因SNP位点的PCR-RFLP多态性检测结果 | 第48页 |
| 3.4.3 奶牛PHF20基因的变异特征 | 第48-50页 |
| 3.4.4 PHF20基因型与荷斯坦奶牛生产性状的关联分析 | 第50-53页 |
| 3.5 TGFB1基因 | 第53-55页 |
| 3.5.1 牛的TGFBl基因目的片段扩增结果 | 第53-54页 |
| 3.5.2 TGFB1基因的基因变异位点的发现 | 第54-55页 |
| 第四章 讨论 | 第55-59页 |
| 4.1 PTHRP基因内含子变异对奶牛产奶性能影响的讨论 | 第55-56页 |
| 4.2 MAF1、PTK2和PHF20基因变异对奶牛繁殖和产奶性状产生遗效应的验证及其讨论 | 第56-59页 |
| 4.2.1 PTK2基因多态性和性状关联分析 | 第56-57页 |
| 4.2.2 MAF1基因多态性和性状关联分析 | 第57页 |
| 4.2.3 PHF20基因多态性和性状关联分析 | 第57-59页 |
| 第二部分 隐性遗传疾病致病位点检测技术的建立 | 第59-79页 |
| 第一章 文献综述 | 第59-68页 |
| 1.1 引言 | 第59-62页 |
| 1.2 脊髓型肌萎缩症(Spinal muscular atrophy,SMA)的研究进展 | 第62-63页 |
| 1.2.2 SMA的检测方法与分布 | 第63页 |
| 1.3 牛锌缺乏症(bovine hereditary zinc deficiency,BHZD)的研究进展 | 第63-64页 |
| 1.3.1 牛锌缺乏症(bovine hereditary zinc deficiency,BHZD)的发病机制及临床症状 | 第63-64页 |
| 1.3.2 BHZD的检测方法与分布 | 第64页 |
| 1.4 血友病(hemophilia A)的研究进展 | 第64-66页 |
| 1.4.1 血友病(hemophilia A)的发病机制与临床症状 | 第64-65页 |
| 1.4.2 血友病(hemophilia A)的检测方法和分布 | 第65-66页 |
| 1.5 轴突病变(Degenerative Axonopathy)的研究进展 | 第66-67页 |
| 1.5.1 轴突病变(Degenerative Axonopathy)的发病机制及临床症状 | 第66页 |
| 1.5.2 轴突病变(Degenerative Axonopathy)的检测方法和分布 | 第66-67页 |
| 1.6 研究目的和意义 | 第67-68页 |
| 第二章 材料与方法 | 第68-70页 |
| 2.1 试验材料 | 第68页 |
| 2.1.1 试验牛来源 | 第68页 |
| 2.1.2 血液样品的采集和提取方法(见第一部分的材料与方法) | 第68页 |
| 2.2 主要仪器与设备(见第一部分的材料与方法) | 第68页 |
| 2.3 主要的试剂及配制(见第一部分的材料与方法) | 第68页 |
| 2.4 试验方法 | 第68-70页 |
| 2.4.1 基因组DNA的提取(见第一部分的材料与方法) | 第68页 |
| 2.4.2 聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction,PCR) | 第68页 |
| 2.4.3 PCR产物酶切及电泳(见第一部分的材料与方法) | 第68-69页 |
| 2.4.4 PCR产物回收及测序 | 第69-70页 |
| 第三章 结果与分析 | 第70-77页 |
| 3.1 牛锌缺乏症(BHZD)致病位点检测技术的建立 | 第70-71页 |
| 3.1.1 BHZD致病位点PCR-RFLP(BtsC Ⅰ)检测技术的建立 | 第70-71页 |
| 3.1.2 利用序列测序技术对BHZD致病位点检测技术进行验证 | 第71页 |
| 3.1.3 PCR-RFLP致病位点检测技术在荷斯坦奶牛上的应用 | 第71页 |
| 3.2 牛脊髓型肌萎缩症(SMA)致病位点检测技术的建立 | 第71-73页 |
| 3.2.1 SMA致病位点PCR-RFLP(Mva Ⅰ)检测技术的建立 | 第71-72页 |
| 3.2.2 利用序列测序技术对SMA致病位点检测技术进行验证 | 第72-73页 |
| 3.2.3 PCR-RFLP致病位点检测技术在荷斯坦奶牛上的应用 | 第73页 |
| 3.3 牛血友病(Hemophilia A)致病位点检测技术的建立 | 第73-75页 |
| 3.3.1 血友病致病位点PCR-RFLP(Ear Ⅰ)检测技术的建立 | 第73-74页 |
| 3.3.2 利用序列测序技术对Hemophilia A致病位点检测技术进行验证 | 第74-75页 |
| 3.3.3 PCR-RFLP致病位点检测方法在荷斯坦奶牛上的应用 | 第75页 |
| 3.4 牛轴突病变(Degenerative Axonopathy)致病位点检测技术的建立 | 第75-77页 |
| 3.4.1 轴突病变致病位点PCR-RFLP(TspR Ⅰ)检测技术的建立 | 第75页 |
| 3.4.2 利用序列测序技术对轴突病变致病位点检测技术进行验证 | 第75-76页 |
| 3.4.3 PCR-RFLP致病位点检测技术在荷斯坦奶牛上的应用 | 第76-77页 |
| 第四章 讨论 | 第77-79页 |
| 4.1 关于建立SMA、BHZD、Hemophilia A以及Degenerative Axonopathy四种隐性遗传疾病致病位点的PCR-RFLP检测技术 | 第77-78页 |
| 4.2 荷斯坦奶牛隐性遗传疾病的检测 | 第78-79页 |
| 第三部分 小结 | 第79-80页 |
| 1.1 主要结论 | 第79页 |
| 1.2 本研究创新点 | 第79页 |
| 1.3 本研究的进一步研究内容 | 第79-80页 |
| 参考文献 | 第80-89页 |
| 致谢 | 第89页 |
