摘要 | 第6-7页 |
Abstract | 第7-8页 |
英文缩略表 | 第14-16页 |
第一章 引言 | 第16-26页 |
1.1 甘薯概况 | 第16页 |
1.2 测序技术发展及转录组测序技术应用 | 第16-18页 |
1.2.1 测序技术发展 | 第16-17页 |
1.2.2 转录组测序技术 | 第17页 |
1.2.3 甘薯转录组测序应用 | 第17-18页 |
1.3 基因差异表达分析的研究方法 | 第18-20页 |
1.3.1 差减杂交法 | 第18页 |
1.3.2 mRNA差异显示逆转录PCR | 第18-19页 |
1.3.3 抑制差减杂交分析 | 第19页 |
1.3.4 基因芯片技术 | 第19-20页 |
1.3.5 转录组测序分析 | 第20页 |
1.4 基因差异表达分析技术的应用 | 第20-23页 |
1.4.1 基因差异表达分析技术在环境胁迫方面的研究 | 第20-21页 |
1.4.2 基因差异表达分析技术在生物胁迫方面的研究 | 第21-22页 |
1.4.3 基因差异表达分析技术在杂种优势方面的研究 | 第22页 |
1.4.4 基因差异表达分析技术在其他性状方面的研究 | 第22-23页 |
1.5 甘薯淀粉合成相关基因的研究进展 | 第23页 |
1.6 果糖-1,6-二磷酸醛缩酶基因的研究进展 | 第23-25页 |
1.7 本研究的目的及意义 | 第25-26页 |
第二章 甘薯淀粉合成相关差异表达基因的表达模式分析 | 第26-49页 |
2.1 材料与方法 | 第26-31页 |
2.1.1 实验材料 | 第26页 |
2.1.2 试剂与仪器设备 | 第26页 |
2.1.3 实验材料的种植与取样 | 第26-27页 |
2.1.4 植物总RNA提取 | 第27-28页 |
2.1.5 cDNA第一链合成 | 第28页 |
2.1.6 淀粉合成相关基因筛选 | 第28页 |
2.1.7 引物设计及荧光定量PCR(qRT-PCR) | 第28-30页 |
2.1.8 甘薯栽后不同时间淀粉含量的测定及计算 | 第30-31页 |
2.1.9 甘薯栽后不同时间可溶糖含量的测定 | 第31页 |
2.2 结果与分析 | 第31-44页 |
2.2.1 淀粉相关差异表达基因的生物信息学分析 | 第31-32页 |
2.2.2 淀粉合成相关差异表达基因在甘薯不同生长时期的表达分析 | 第32-38页 |
2.2.3 淀粉合成相关差异表达基因的表达模式 | 第38-39页 |
2.2.4 栽后不同时间甘薯淀粉的含量分析 | 第39-41页 |
2.2.5 栽后不同时间甘薯可溶糖的含量分析 | 第41页 |
2.2.6 栽后不同时间甘薯淀粉相关差异表达基因与淀粉及可溶糖的含量变化分析 | 第41-44页 |
2.3 讨论 | 第44-49页 |
2.3.1 转录组测序与基因表达模式 | 第44页 |
2.3.2 不同品种、不同组织以及不同时期的基因差异表达模式 | 第44-46页 |
2.3.3 甘薯块根膨大不同期淀粉和可溶糖的变化 | 第46-47页 |
2.3.4 甘薯块根膨大不同时期淀粉及可溶糖含量与基因表达的相关性 | 第47-49页 |
第三章 甘薯IbFBA基因克隆及功能初步分析 | 第49-70页 |
3.1 材料与方法 | 第49-57页 |
3.1.1 实验材料 | 第49页 |
3.1.2 实验试剂及仪器 | 第49-50页 |
3.1.3 植物总RNA/DNA提取及cDNA的合成 | 第50页 |
3.1.4 IbFBA2和IbFBA5基因克隆 | 第50-51页 |
3.1.5 生物信息学分析 | 第51-52页 |
3.1.6 IbFBA在甘薯不同组织中的相对表达及胁迫条件下的表达分析 | 第52页 |
3.1.7 超表达载体构建及根癌农杆菌菌液制备 | 第52-53页 |
3.1.8 在烟草叶片中瞬时表达IbFBA2和IbFBA5 | 第53-54页 |
3.1.9 拟南芥消毒及培养 | 第54-55页 |
3.1.10 拟南芥突变体的PCR检测 | 第55页 |
3.1.11 拟南芥转化 | 第55页 |
3.1.12 碘染处理转基因烟草叶片 | 第55-56页 |
3.1.13 转基因拟南芥T1代的筛选及PCR阳性检测 | 第56页 |
3.1.14 转基因拟南芥的ABA处理 | 第56-57页 |
3.2 结果与分析 | 第57-67页 |
3.2.1 甘薯总RNA和DNA的提取 | 第57-58页 |
3.2.2 IbFBA2和IbFBA5基因的克隆 | 第58页 |
3.2.3 IbFBA2和IbFBA5的生物信息学分析 | 第58-61页 |
3.2.4 IbFBA2和IbFBA5在甘薯不同组织中的差异表达分析 | 第61-62页 |
3.2.5 IbFBA2和IbFBA5在胁迫条件下的表达分析 | 第62-64页 |
3.2.6 瞬时表达IbFBA2和IbFBA5 | 第64页 |
3.2.7 拟南芥突变体的PCR检测 | 第64-65页 |
3.2.8 转基因阳性拟南芥的筛选 | 第65页 |
3.2.9 用不同浓度的ABA处理转基因阳性拟南芥 | 第65-67页 |
3.3 讨论 | 第67-70页 |
3.3.1 IbFBA2和IbFBA5基因的鉴定、克隆与序列比较 | 第67页 |
3.3.2 IbFBA2和IbFBA5响应ABA处理和NaCl、PEG胁迫 | 第67-68页 |
3.3.3 FBA基因响应其他环境胁迫 | 第68页 |
3.3.4 IbFBA2和IbFBA5与淀粉合成的关系 | 第68-70页 |
第四章 结果与结论 | 第70-71页 |
参考文献 | 第71-80页 |
致谢 | 第80-81页 |
作者简历 | 第81页 |