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甘薯徐薯18和徐781淀粉合成相关差异表达基因分析及IbFBA基因克隆

摘要第6-7页
Abstract第7-8页
英文缩略表第14-16页
第一章 引言第16-26页
    1.1 甘薯概况第16页
    1.2 测序技术发展及转录组测序技术应用第16-18页
        1.2.1 测序技术发展第16-17页
        1.2.2 转录组测序技术第17页
        1.2.3 甘薯转录组测序应用第17-18页
    1.3 基因差异表达分析的研究方法第18-20页
        1.3.1 差减杂交法第18页
        1.3.2 mRNA差异显示逆转录PCR第18-19页
        1.3.3 抑制差减杂交分析第19页
        1.3.4 基因芯片技术第19-20页
        1.3.5 转录组测序分析第20页
    1.4 基因差异表达分析技术的应用第20-23页
        1.4.1 基因差异表达分析技术在环境胁迫方面的研究第20-21页
        1.4.2 基因差异表达分析技术在生物胁迫方面的研究第21-22页
        1.4.3 基因差异表达分析技术在杂种优势方面的研究第22页
        1.4.4 基因差异表达分析技术在其他性状方面的研究第22-23页
    1.5 甘薯淀粉合成相关基因的研究进展第23页
    1.6 果糖-1,6-二磷酸醛缩酶基因的研究进展第23-25页
    1.7 本研究的目的及意义第25-26页
第二章 甘薯淀粉合成相关差异表达基因的表达模式分析第26-49页
    2.1 材料与方法第26-31页
        2.1.1 实验材料第26页
        2.1.2 试剂与仪器设备第26页
        2.1.3 实验材料的种植与取样第26-27页
        2.1.4 植物总RNA提取第27-28页
        2.1.5 cDNA第一链合成第28页
        2.1.6 淀粉合成相关基因筛选第28页
        2.1.7 引物设计及荧光定量PCR(qRT-PCR)第28-30页
        2.1.8 甘薯栽后不同时间淀粉含量的测定及计算第30-31页
        2.1.9 甘薯栽后不同时间可溶糖含量的测定第31页
    2.2 结果与分析第31-44页
        2.2.1 淀粉相关差异表达基因的生物信息学分析第31-32页
        2.2.2 淀粉合成相关差异表达基因在甘薯不同生长时期的表达分析第32-38页
        2.2.3 淀粉合成相关差异表达基因的表达模式第38-39页
        2.2.4 栽后不同时间甘薯淀粉的含量分析第39-41页
        2.2.5 栽后不同时间甘薯可溶糖的含量分析第41页
        2.2.6 栽后不同时间甘薯淀粉相关差异表达基因与淀粉及可溶糖的含量变化分析第41-44页
    2.3 讨论第44-49页
        2.3.1 转录组测序与基因表达模式第44页
        2.3.2 不同品种、不同组织以及不同时期的基因差异表达模式第44-46页
        2.3.3 甘薯块根膨大不同期淀粉和可溶糖的变化第46-47页
        2.3.4 甘薯块根膨大不同时期淀粉及可溶糖含量与基因表达的相关性第47-49页
第三章 甘薯IbFBA基因克隆及功能初步分析第49-70页
    3.1 材料与方法第49-57页
        3.1.1 实验材料第49页
        3.1.2 实验试剂及仪器第49-50页
        3.1.3 植物总RNA/DNA提取及cDNA的合成第50页
        3.1.4 IbFBA2和IbFBA5基因克隆第50-51页
        3.1.5 生物信息学分析第51-52页
        3.1.6 IbFBA在甘薯不同组织中的相对表达及胁迫条件下的表达分析第52页
        3.1.7 超表达载体构建及根癌农杆菌菌液制备第52-53页
        3.1.8 在烟草叶片中瞬时表达IbFBA2和IbFBA5第53-54页
        3.1.9 拟南芥消毒及培养第54-55页
        3.1.10 拟南芥突变体的PCR检测第55页
        3.1.11 拟南芥转化第55页
        3.1.12 碘染处理转基因烟草叶片第55-56页
        3.1.13 转基因拟南芥T1代的筛选及PCR阳性检测第56页
        3.1.14 转基因拟南芥的ABA处理第56-57页
    3.2 结果与分析第57-67页
        3.2.1 甘薯总RNA和DNA的提取第57-58页
        3.2.2 IbFBA2和IbFBA5基因的克隆第58页
        3.2.3 IbFBA2和IbFBA5的生物信息学分析第58-61页
        3.2.4 IbFBA2和IbFBA5在甘薯不同组织中的差异表达分析第61-62页
        3.2.5 IbFBA2和IbFBA5在胁迫条件下的表达分析第62-64页
        3.2.6 瞬时表达IbFBA2和IbFBA5第64页
        3.2.7 拟南芥突变体的PCR检测第64-65页
        3.2.8 转基因阳性拟南芥的筛选第65页
        3.2.9 用不同浓度的ABA处理转基因阳性拟南芥第65-67页
    3.3 讨论第67-70页
        3.3.1 IbFBA2和IbFBA5基因的鉴定、克隆与序列比较第67页
        3.3.2 IbFBA2和IbFBA5响应ABA处理和NaCl、PEG胁迫第67-68页
        3.3.3 FBA基因响应其他环境胁迫第68页
        3.3.4 IbFBA2和IbFBA5与淀粉合成的关系第68-70页
第四章 结果与结论第70-71页
参考文献第71-80页
致谢第80-81页
作者简历第81页

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