| 符号说明 | 第4-8页 |
| 中文摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 1 前言 | 第13-27页 |
| 1.1 影响植物果实发育的主要因素 | 第13-18页 |
| 1.1.1 环境因素 | 第13-15页 |
| 1.1.2 植物激素 | 第15-18页 |
| 1.2 植物果实发育调控的分子机制 | 第18-23页 |
| 1.2.1 转录因子对植物果实发育的调控 | 第18-20页 |
| 1.2.2 非编码RNA对植物果实发育的调控 | 第20-21页 |
| 1.2.3 翻译后修饰对植物果实发育的调控 | 第21-23页 |
| 1.3 DNA甲基化对果实发育的调控作用 | 第23-26页 |
| 1.3.1 DNA甲基化的作用机制 | 第23-24页 |
| 1.3.2 DNA甲基化在果实发育过程中的作用 | 第24-26页 |
| 1.4 研究的目的意义 | 第26-27页 |
| 2 材料与方法 | 第27-42页 |
| 2.1 材料 | 第27-29页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第27页 |
| 2.1.2 菌株和载体 | 第27页 |
| 2.1.3 主要试剂 | 第27-28页 |
| 2.1.4 PCR引物 | 第28-29页 |
| 2.1.5 主要仪器 | 第29页 |
| 2.2 方法 | 第29-42页 |
| 2.2.1 桑椹转录组测序文库的构建和测序分析 | 第29-31页 |
| 2.2.2 DNA甲基化测序文库构建与测序分析 | 第31-34页 |
| 2.2.3 DNA甲基化水平与基因表达水平的联合分析 | 第34页 |
| 2.2.4 基因的克隆及序列分析 | 第34-35页 |
| 2.2.5 基因植物表达载体的构建 | 第35-37页 |
| 2.2.6 转基因拟南芥的获得、筛选及鉴定 | 第37-38页 |
| 2.2.7 Mul-bZIP60 蛋白质的亚细胞定位观察 | 第38页 |
| 2.2.8 启动子序列扩增及活性分析 | 第38-39页 |
| 2.2.9 转基因植株表型分析 | 第39-40页 |
| 2.2.10 Mul-bZIP60 的互作蛋白质的筛选 | 第40-42页 |
| 3 结果与分析 | 第42-94页 |
| 3.1 不同发育阶段桑椹的转录组分析 | 第42-53页 |
| 3.1.1 转录组文库测序质量评估 | 第42页 |
| 3.1.2 差异表达基因筛选 | 第42-43页 |
| 3.1.3 差异表达基因差异显著性验证 | 第43-44页 |
| 3.1.4 差异表达基因的KEGG分析 | 第44-45页 |
| 3.1.5 差异表达基因的聚类分析 | 第45-53页 |
| 3.2 桑椹不同发育时期基因组DNA甲基化差异分析 | 第53-75页 |
| 3.2.1 DNA甲基化文库测序数据分析 | 第53-54页 |
| 3.2.2 DNA甲基化水平及位点分布分析 | 第54-56页 |
| 3.2.3 DNA甲基化差异位点分析 | 第56-57页 |
| 3.2.4 DNA甲基化差异基因分析 | 第57-58页 |
| 3.2.5 DNA甲基化水平差异验证 | 第58-59页 |
| 3.2.6 DNA甲基化水平差异基因的KEGG分析 | 第59-60页 |
| 3.2.7 DNA甲基化水平差异基因的聚类分析 | 第60-75页 |
| 3.3 不同发育时期桑椹基因的表达水平与DNA甲基化水平的关联分析 | 第75-77页 |
| 3.4 Mul-bZIP60 基因的功能研究 | 第77-89页 |
| 3.4.1 Mul-bZIP60 基因的克隆及序列分析 | 第77-78页 |
| 3.4.2 Mul-bZIP60 蛋白质的生物信息学分析 | 第78-79页 |
| 3.4.3 Mul-bZIP60 的同源比较及其进化分析 | 第79-80页 |
| 3.4.4 Mul-ZIP60 基因的组织表达特性分析 | 第80-81页 |
| 3.4.5 Mul-bZIP60 蛋白质的亚细胞定位分析 | 第81-83页 |
| 3.4.6 Mul-bZIP60 基因启动子的表达特性分析 | 第83-86页 |
| 3.4.7 Mul-bZIP60 基因的生物学功能分析 | 第86-89页 |
| 3.5 Mul-bZIP60 互作蛋白的筛选 | 第89-94页 |
| 3.5.1 诱饵载体的构建 | 第89页 |
| 3.5.2 BD-Mul-bZIP60 的毒性及自激活检测 | 第89-90页 |
| 3.5.3 酵母双杂交文库的筛选及捕获蛋白的鉴定 | 第90-91页 |
| 3.5.4 Mul-bZIP60与Mul-LBP5 的互作关系验证 | 第91-94页 |
| 4 讨论 | 第94-99页 |
| 4.1 桑椹发育过程中的差异表达基因 | 第94-95页 |
| 4.2 桑椹发育过程中基因组DNA甲基化变化 | 第95-97页 |
| 4.3 Mul-bZIP60 的功能及作用机制 | 第97-99页 |
| 5 结论 | 第99-100页 |
| 参考文献 | 第100-111页 |
| 致谢 | 第111-112页 |
| 攻读学位期间发表的论文及成果 | 第112页 |
