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茶树被茶尺蠖取食后引起差异表达的miRNA研究

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
1 文献综述第10-15页
    1.1 植物对害虫取食的防御机制第10-11页
    1.2 植物miRNA概述第11-15页
        1.2.1 植物miRNA的基本特点与分类第11页
        1.2.2 植物miRNA的生物合成和作用方式第11-12页
        1.2.3 miRNA在植物中的功能第12-13页
            1.2.3.1 miRNA与植物生长发育第12页
            1.2.3.2 miRNA与植物非生物胁迫第12页
            1.2.3.3 植物miRNA与生物胁迫第12-13页
        1.2.4 植物miRNA的鉴定方法第13-14页
        1.2.5 植物miRNA靶基因的预测第14页
        1.2.6 miRNA靶基因的生物学验证第14-15页
2 引言第15-17页
    2.1 研究意义、目的及内容第15-16页
    2.2 技术路线第16-17页
3 材料与方法第17-23页
    3.1 试验材料与处理第17页
        3.1.1 试验材料第17页
        3.1.2 试验处理第17页
    3.2 试验试剂第17页
    3.3 试验方法第17-23页
        3.3.1 总RNA的提取和检测第17页
            3.3.1.1 茶树叶片总RNA的提取第17页
            3.3.1.2 总RNA的质量检测第17页
        3.3.2 miRNA的鉴定第17-18页
            3.3.2.1 smRNA文库的构建及Solexa高通量测序第17-18页
            3.3.2.2 smRNA生物信息学分析第18页
        3.3.3 基因芯片表达谱分析第18-19页
        3.3.4 miRNA差异表达分析第19页
            3.3.4.1 通过高通量测序进行miRNA差异表达分析第19页
            3.3.4.2 通过微列阵芯片技术进行miRNA差异表达分析第19页
        3.3.5 降解组测序预测miRNA靶基因第19页
        3.3.6 RLM-5’RACE试验验证miRNA靶基因裂解位点第19-23页
4 结果与分析第23-39页
    4.1 RNA的提取第23页
    4.2 高通量测序鉴定差异表达的miRNA第23-30页
        4.2.1 序列质量分析第23-25页
        4.2.2 smRNA长度分布第25-26页
        4.2.3 三组样品中茶树miRNA的鉴定第26-27页
        4.2.4 基于高通量测序检测茶尺蠖取食及机械损伤后差异表达的miRNA第27-30页
    4.3 基于微列阵芯片技术检测茶尺蠖取食及机械损伤后差异表达的miRNA第30-33页
    4.4 结合高通量测序与微列阵芯片技术分析茶尺蠖取食响应及特异性响应的差异表达的miRNA第33-34页
    4.5 基于降解组测序预测响应茶尺蠖取食后的差异表达miRNA的靶基因第34-36页
    4.6 miRNA靶基因裂解位点验证试验(RLM-5’RACE)第36-39页
        4.6.1 RLM -5’RACE试验第36-37页
        4.6.2 靶基因裂解位点分析第37-39页
5 讨论第39-42页
    5.1 高通量测序对不同样品间smRNA序列表达特征分析第39页
    5.2 高通量测序鉴定不同样品中的miRNA序列第39页
    5.3 鉴定茶尺响应蠖取食及茶尺蠖口腔分泌液特异性引起的差异表达的miRNA第39-40页
    5.4 使用降解组预测响应茶尺蠖取食的差异表达的 mi RNA 的靶基因第40-42页
6 结论第42-43页
参考文献第43-51页
致谢第51-52页
作者简介第52页

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