| 摘要 | 第9-11页 |
| Abstract | 第11-12页 |
| 第一章 前言 | 第13-33页 |
| 1.1 生物膜 | 第13-22页 |
| 1.1.1 生物膜的定义 | 第13-14页 |
| 1.1.2 生物膜的组成 | 第14-17页 |
| 1.1.3 生物膜的形成过程 | 第17-18页 |
| 1.1.4 生物膜内部异质性特征 | 第18-19页 |
| 1.1.5 生物膜的功能 | 第19-22页 |
| 1.2 生物膜培养的主要方法 | 第22-26页 |
| 1.2.1 微孔板法 | 第22-23页 |
| 1.2.2 平板法 | 第23-25页 |
| 1.2.3 置片法 | 第25页 |
| 1.2.4 流室法（Flow cell） | 第25-26页 |
| 1.3 生物膜主要的检测方法 | 第26-28页 |
| 1.3.1 染色法 | 第26页 |
| 1.3.2 激光共聚焦显微镜 | 第26-27页 |
| 1.3.3 原子力显微镜 | 第27-28页 |
| 1.3.4 傅里叶变换红外光谱 | 第28页 |
| 1.3.5 其他技术 | 第28页 |
| 1.4 影响生物膜形成的因素 | 第28-30页 |
| 1.4.1 养分因素 | 第29页 |
| 1.4.2 温度、氧气、渗透压 | 第29-30页 |
| 1.4.3 群体感应 | 第30页 |
| 1.5 土壤中的生物膜 | 第30-32页 |
| 1.6 论文研究目的和内容 | 第32-33页 |
| 第二章 细菌生物膜细胞和游离态细胞的形态及性质差异 | 第33-49页 |
| 2.1 引言 | 第33-34页 |
| 2.2 材料与方法 | 第34-36页 |
| 2.2.1 实验菌株 | 第34页 |
| 2.2.2 生物膜细胞的生长曲线 | 第34页 |
| 2.2.3 生物膜细胞的收集 | 第34-35页 |
| 2.2.4 原子力显微镜（AFM）原位观察 | 第35页 |
| 2.2.5 扫描电子显微镜 | 第35页 |
| 2.2.6 衰减全反射傅里叶变换红外光谱实验（ATR-FTIR） | 第35页 |
| 2.2.7 Zeta电位和粒径的测定 | 第35-36页 |
| 2.2.8 疏水性的测定 | 第36页 |
| 2.2.9 细胞等电点的测定 | 第36页 |
| 2.2.10 自动电位滴定 | 第36页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第36-48页 |
| 2.3.1 细菌生物膜生长曲线 | 第36-38页 |
| 2.3.2 细胞形貌 | 第38-42页 |
| 2.3.3 细菌表面疏水性和电荷性质 | 第42-44页 |
| 2.3.4 ATR-FTIR | 第44-46页 |
| 2.3.5 电位滴定 | 第46-48页 |
| 2.4 结论 | 第48-49页 |
| 第三章 土壤矿物对枯草芽孢杆菌生物膜形成的影响及机制 | 第49-72页 |
| 3.1 引言 | 第49-50页 |
| 3.2 材料与方法 | 第50-55页 |
| 3.2.1 实验菌株 | 第50-51页 |
| 3.2.2 土壤矿物 | 第51页 |
| 3.2.3 微孔法培养生物膜 | 第51页 |
| 3.2.4 激光共聚焦显微镜观察（CLSM） | 第51页 |
| 3.2.5 衰减全反射傅里叶红外光谱分析（ATR-FTIR） | 第51-52页 |
| 3.2.6 生物膜内组分的测定 | 第52页 |
| 3.2.7 细菌在矿物表面的存活 | 第52-53页 |
| 3.2.8 细菌在矿物悬液中的存活 | 第53页 |
| 3.2.9 死细胞对生物膜形成的影响 | 第53页 |
| 3.2.10 原子力显微镜（AFM）观察生物膜在矿物表面上的形成 | 第53页 |
| 3.2.11 实时荧光聚合酶链反应（qRT-PCR） | 第53-55页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第55-71页 |
| 3.3.1 蒙脱石、高岭石、针铁矿对枯草芽孢杆菌生物膜的不同影响 | 第55-57页 |
| 3.3.2 不同矿物对生物膜结构的影响 | 第57-64页 |
| 3.3.3 不同矿物影响生物膜的机制 | 第64-67页 |
| 3.3.6 细胞对矿物的响应 | 第67-68页 |
| 3.3.7 生物膜形成过程中基因的调控 | 第68-69页 |
| 3.3.8 枯草芽孢杆菌在矿物悬液中形成生物膜的模型 | 第69-71页 |
| 3.4 结论 | 第71-72页 |
| 第四章 土壤金属氧化物对恶臭假单胞菌生长和生物膜形成的影响 | 第72-88页 |
| 4.1 引言 | 第72-73页 |
| 4.2 材料与方法 | 第73-74页 |
| 4.2.1 实验菌株 | 第73页 |
| 4.2.2 实验矿物 | 第73页 |
| 4.2.3 粒径测定 | 第73页 |
| 4.2.4 细菌在矿物悬液中生长和生物膜的形成 | 第73页 |
| 4.2.5 CLSM | 第73页 |
| 4.2.6 AFM | 第73-74页 |
| 4.2.7 沉降实验 | 第74页 |
| 4.2.8 死细胞存在下生物膜的形成 | 第74页 |
| 4.2.9 含/无可溶性EPS条件下矿物对生物膜的影响 | 第74页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第74-87页 |
| 4.3.1 不同金属氧化物对细菌生长和生物膜形成的影响 | 第74-77页 |
| 4.3.2 恶臭假单胞菌（P. putida KT2440）在矿物表面的吸附和存活 | 第77-80页 |
| 4.3.3 死细胞促进细胞生长和生物膜的形成 | 第80-82页 |
| 4.3.4 细菌与矿物共沉淀 | 第82-83页 |
| 4.3.5 EPS在成熟生物膜中的作用 | 第83-87页 |
| 4.4 结论 | 第87-88页 |
| 第五章 研究结论、创新点和展望 | 第88-90页 |
| 5.1 研究结论 | 第88页 |
| 5.2 创新点 | 第88-89页 |
| 5.3 研究展望 | 第89-90页 |
| 参考文献 | 第90-109页 |
| 攻读博士学位期间撰写的论文 | 第109-110页 |
| 致谢 | 第110-112页 |
