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绿脓杆菌蛋白质组和gyrA基因突变在其对环丙沙星耐药进化过程中变化的研究

第一章 前言第9-43页
    第一节 细菌对抗生素耐药性的概述第9-26页
        一 菌耐药性机制概述第9-11页
        二 细菌对喹诺酮类抗菌药物产生耐药性的作用机制第11-25页
            (一) 喹诺酮类抗菌药物的作用机制第11-12页
            (二) 喹诺酮类抗菌药物的作用靶位第12-14页
            (三) 喹诺酮类与 DNA 拓扑异构酶复合物的交互作用第14-15页
            (四) 喹诺酮类-DNA-拓扑异构酶复合物与 DNA 复制叉 和 RNA 多聚酶的交互作用第15-16页
            (五) 细菌对喹诺酮类抗菌药物产生耐药性的基因突变机制第16-22页
            (六) 细菌对喹诺酮类药物产生耐药性的主动外排机制第22-25页
        三 细菌耐药性的检测第25-26页
    第二节 蛋白质组技术及其应用现状第26-41页
        一 蛋白质组学研究的意义及发展趋势第26-28页
        二 蛋白质组学研究的相关技术第28-37页
            (一) 蛋白质组研究中的样品制备第28-29页
            (二) 双向电泳技术第29-31页
            (三) 图像分析技术第31-33页
            (四) 蛋白质的质谱分析技术第33-35页
            (五) 蛋白质微测序第35页
            (六) 蛋白组数据库第35-36页
            (七) 蛋白质组研究的新技术第36-37页
        三 医学蛋白质组学研究的应用第37-41页
            (一) 人类疾病的蛋白质组研究第37-39页
            (二) 病源微生物蛋白组研究第39-41页
    第三节 本研究的立题依据及意义第41-43页
第二章 实验方法及结果第43-114页
    第一节 体外模拟绿脓杆菌对环丙沙星耐药的进化过程第44-59页
        实验材料及试剂第44-45页
        实验仪器第45页
        实验方法第45-53页
            1 细菌菌株的保存第45-46页
            2 连续琼脂糖扩散法体外模拟绿脓杆菌环丙沙星耐药的进化过程第46-49页
            3 连续试管稀释法体外模拟绿脓杆菌环丙沙星耐药的进化过程第49-51页
            4 环丙沙星在绿脓杆菌体内浓度的测定第51-53页
        实验结果第53-59页
            1 连续药物扩散法体外模拟细菌耐药的进化过程第53-56页
            2 连续试管稀释法体外模拟细菌耐药的进化过程第56页
            3 环丙沙星在绿脓杆菌体内浓度的测定第56-59页
    第二节 绿脓杆菌耐药进化过程中基因突变的分析第59-76页
        实验材料及试剂第59-60页
        实验仪器第60页
        实验方法第60-63页
            1 DNA 提取第60-61页
            2 PCR 扩增第61-62页
            3 SSCP 分析第62-63页
            4 基因突变的稳定性分析第63页
            5 PCR 产物的序列测定第63页
            6 DNA 测序结果的计算机分析第63页
        实验结果第63-76页
            1 PCR-SSCP 检测 QRDRs 基因突变第63-65页
            2 PCR 产物的序列测定及计算机分析第65-67页
            3 突变稳定性的分析第67-76页
    第三节 绿脓杆菌耐药进化过程的蛋白质组学研究第76-105页
        实验材料及试剂第76-79页
        实验仪器及计算机软件第79-80页
        实验方法第80-93页
            一 样品准备第80-82页
            二 双向电泳第82-86页
                1 第一向等电聚焦电泳第82-83页
                2 第二向聚丙烯酰胺凝胶电泳第83-84页
                3 聚丙烯酰胺凝胶染色第84-86页
            三 绿脓杆菌的理论蛋白组数据库的建立第86页
            四 双向电泳凝胶的计算机图像分析第86-87页
            五 蛋白质的质谱分析第87-92页
            六 蛋白质 N 末端氨基酸测序第92-93页
        实验结果第93-105页
            1 标准蛋白质浓度 OD595 曲线的绘制第93页
            2 2D 电泳样品上样量测定第93-94页
            3 双向电泳结果第94-95页
            4 Phoretix-2D 图像分析第95-96页
            5 差异蛋白的质谱分析第96-103页
            6 N 末端氨基酸测序第103-105页
    第四节 “可能的 ABC-ATP 结合因子”的功能分析第105-114页
        实验材料及试剂第105-106页
        实验仪器第106页
        实验方法第106-109页
            1 细菌 RNA 提取第106页
            2 RT-PCR 扩增第106-107页
            3 DNAzyme 的设计与构建第107-108页
            4 DNAzyme 转染 P. aeruginosa第108-109页
        实验结果第109-114页
            1 在细菌耐药进化过程中'可能的ABC-ATP结合因子'mRNA的表达第109-110页
            2 DNAzyme 抑制细菌耐药性第110-112页
            3 DNAzyme 及对照 H2O/对照 DNAzyme处理菌体,其体内环丙沙星菌体浓度的变化第112-114页
第三章 实验结果讨论第114-129页
    一 研究绿脓杆菌对环丙沙星耐药进化过程的意义第114-117页
    二 绿脓杆菌对环丙沙星耐药进化过程中基因突变的分析第117-120页
    三 绿脓杆菌对环丙沙星耐药进化过程蛋白组变化的分析第120-129页
        1 蛋白组研究方法第120-125页
        2 绿脓杆菌对环丙沙星耐药进化过程蛋白组变化第125-127页
        3 “可能的 ABC-ATP 结合因子”功能研究第127-129页
实验结论第129-131页
参考文献第131-144页
攻博期间发表的学术论文及其他成果第144-145页
中文摘要 第145-152页
英文摘要 第152页
致谢第157-160页

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