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基于高通量测序技术分析菌根对蒙古扁桃抗旱机制的影响

摘要第3-5页
Abstract第5-7页
第一章 前言第14-37页
    1.1 蒙古扁桃研究现状综述第14-21页
        1.1.1 蒙古扁桃系统分类的争议第14-15页
        1.1.2 蒙古扁桃的形态特征第15-16页
        1.1.3 蒙古扁桃的生态和经济价值第16-17页
        1.1.4 蒙古扁桃研究现状第17-21页
    1.2 菌根对干旱胁迫的响应第21-32页
        1.2.1 菌根植物抗旱机制第22-30页
        1.2.2 干旱对菌根真菌及其群落的影响第30-32页
        1.2.3 菌根技术在干旱地区的应用第32页
    1.3 高通量测序技术第32-34页
        1.3.1 高通量测序技术简介第32-33页
        1.3.2 高通量测序在李属植物上的运用第33-34页
        1.3.3 高通量测序在菌根研究中运用第34页
    1.4 研究目的与意义第34-36页
    1.5 研究技术路线第36-37页
第二章 纯培养条件下非菌根化蒙古扁桃抗旱机制第37-67页
    2.1 材料与方法第37-46页
        2.1.1 苗木培育及水分胁迫第37页
        2.1.2 生长状况以及生理生化指标的测定第37-38页
        2.1.3 总RNA提取、mRNA文库构建及测序第38-42页
        2.1.4 测序Reads的处理及组装第42页
        2.1.5 功能注释与分类第42页
        2.1.6 检测不同表达的转录本第42-43页
        2.1.7 实时荧光定量PCR第43-46页
    2.2 结果与分析第46-61页
        2.2.1 RNA提取及质检第46页
        2.2.2 蒙古扁桃转录组测序第46-49页
        2.2.3 蒙古扁桃转录组一般特征第49-51页
        2.2.4 差异表达转录本一般分析第51-52页
        2.2.5 qRT-PCR验证第52-55页
        2.2.6 干旱胁迫下蒙古扁桃的光合作用第55-56页
        2.2.7 蒙古扁桃体内激素平衡及激素信号传导路径中DETs第56-57页
        2.2.8 蒙古扁桃体叶片水势及水孔通道蛋白家族中DETs第57-60页
        2.2.9 蒙古扁桃体总SDO活性及SOD家族中DETs第60-61页
    2.3 讨论第61-65页
        2.3.1 蒙古扁桃NGS测序第61-62页
        2.3.2 蒙古扁桃生理生化水平和分子水平的抗旱机制第62-65页
    2.4 本章结论第65-67页
第三章 菌根化蒙古扁桃分子水平抗旱机理第67-119页
    3.1 本章研究背景第67-69页
        3.1.1 前期研究结果第67-68页
        3.1.2 本章研究内容第68-69页
    3.2 材料与方法第69-72页
        3.2.1 菌根化苗木的培育及水分胁迫第69页
        3.2.2 总RNA提取、RNA文库构建及测序第69页
        3.2.3 测序数据分析第69-72页
        3.2.4 实时荧光定量PCR第72页
    3.3 结果与分析第72-109页
        3.3.1 菌根侵染状况第72页
        3.3.2 RNA提取及质检第72-73页
        3.3.3 测序数据统计第73-75页
        3.3.4 拼接结果统计第75-77页
        3.3.5 转录本表达定量及RNA分类分析第77-79页
        3.3.6 差异表达转录本分析第79-83页
        3.3.7 菌根化蒙古扁桃分子水平抗旱机理第83-107页
        3.3.8 差异转录本聚类分析第107-108页
        3.3.9 qRT-PCR验证第108-109页
    3.4 讨论第109-117页
        3.4.1 菌根化蒙古扁桃测序及拼接质量的评估第109-110页
        3.4.2 差异基因的GO分类第110-111页
        3.4.3 分子水平上分析菌根化蒙古扁桃抗旱机理第111-117页
    3.5 本章结论第117-119页
第四章 结论与展望第119-120页
    4.1 菌根对蒙古扁桃抗旱机制影响的分子路径第119页
    4.2 展望第119-120页
致谢第120-121页
参考文献第121-149页
作者简介第149页

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