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StPP2A-c调控大斑刚毛座腔菌致病性的分子机制

摘要第4-5页
Abstract第5-6页
缩写词表第7-11页
1 引言第11-14页
    1.1 玉米大斑病及其危害第11页
    1.2 PP2A蛋白磷酸酶第11页
    1.3 PP2A与信号途径的关系第11-13页
    1.4 研究内容以及研究意义第13-14页
        1.4.1 大斑刚毛座腔菌中PP2A的功能研究第13页
        1.4.2 大斑刚毛座腔菌中CaMKs家族的基因鉴定与表达模式分析第13页
        1.4.3 大斑刚毛座腔菌中PP2A与3条信号转导通路的关系第13-14页
2 材料和方法第14-22页
    2.1 试验材料第14页
        2.1.1 供试菌株、寄主和质粒第14页
        2.1.2 试剂和试验所用的培养基第14页
        2.1.3 DNA和RNA的提取第14页
    2.2 大斑刚毛座腔菌StPP2A-c蛋白的生物信息学分析第14-15页
    2.3 大斑刚毛座腔菌StPP2A-c基因回复载体的构建第15-16页
        2.3.1 StPP2A-c基因的PCR扩增第15页
        2.3.2 PCR产物测序第15-16页
        2.3.3 基因片段的连接第16页
    2.4 大斑刚毛座腔菌StPP2A-c基因回复突变体的创制第16-17页
        2.4.1 StPP2A-c基因回复载体转化StPP2A-c缺失突变体的原生质体第16页
        2.4.2 大斑刚毛座腔菌StPP2A-c基因回复突变体的获得第16-17页
    2.5 大斑刚毛座腔菌StPP2A-c突变体分析第17-18页
        2.5.1 表型分析以及菌丝观察第17页
        2.5.2 生长速度及产孢量测定第17页
        2.5.3 转化子孢子的萌发、附着胞形成及穿透能力第17页
        2.5.4 转化子的胞内黑色素分析第17页
        2.5.5 转化子的胞壁降解酶活性测定第17页
        2.5.6 转化子的细胞壁对H2O2的敏感性影响第17-18页
    2.6 野生型与StPP2A-c突变体的转录组测序第18-19页
        2.6.1 试验流程第18页
        2.6.2 信息分析流程第18-19页
    2.7 大斑刚毛座腔菌CaMK家族的基因鉴定与表达模式分析第19页
        2.7.1 生物信息学分析第19页
        2.7.2 基因表达模式分析第19页
    2.8 StPP2A-c基因与Ca2+信号途径的关系第19-20页
    2.9 StPP2A-c基因与MAPK(STK1/STK2/STK3)信号途径的关系第20-22页
3 结果与分析第22-44页
    3.1 StPP2A-c蛋白的生物信息学分析第22-23页
        3.1.1 保守结构域分析第22页
        3.1.2 结构预测第22-23页
    3.2 StPP2A-c基因回复载体的构建第23-24页
        3.2.1 基因克隆第23-24页
        3.2.2 回复载体的酶切验证第24页
    3.3 StPP2A-c基因回复突变体的获得与验证第24-25页
    3.4 StPP2A-c调控分生孢子的发育和黑色素的合成第25-31页
        3.4.1 菌落及菌丝形态观察第25-26页
        3.4.2 StPP2A-c基因对大斑刚毛座腔菌菌丝生长的调控第26-27页
        3.4.3 StPP2A-c基因对大斑刚毛座腔菌分生孢子发育的调控第27页
        3.4.4 StPP2A-c基因对大斑刚毛座腔菌附着胞和侵染丝发育的调控第27-28页
        3.4.5 StPP2A-c基因参与调控大斑刚毛座腔菌胞内黑色素合成的调控第28-29页
        3.4.6 StPP2A-c基因对大斑刚毛座腔菌细胞壁降解酶活性的调控第29-30页
        3.4.7 StPP2A-c基因的缺失导致大斑刚毛座腔菌对氧胁迫敏感第30-31页
    3.5 野生型和StPP2A-c突变体的转录组测序结果与分析第31-37页
        3.5.1 测序数据统计第31页
        3.5.2 RNA-Seq质量的评价与估测第31-32页
        3.5.3 基因表达分析第32-33页
        3.5.4 差异表达分析第33页
        3.5.5 功能分类结果与分析第33-35页
        3.5.6 差异表达基因KEGG注释第35-37页
    3.6 大斑刚毛座腔菌CaMK家族的基因鉴定与表达模式分析第37-41页
        3.6.1 大斑刚毛座腔菌CaMK家族基因系统发育分析第37页
        3.6.2 CaMK家族编码蛋白保守结构域分析第37-38页
        3.6.3 病菌侵染结构形成过程中的基因表达模式分析第38-41页
    3.7 StPP2A-c基因与Ca2+信号途径的关系第41-42页
        3.7.1 StPP2A-c基因与CaMK家族的相互关系第41-42页
        3.7.2 StPP2A-c与钙调素(CAM)、钙调磷酸酶(CNA/CNB)的相互关系第42页
    3.8 StPP2A-c基因与MAPK(STK1/STK2/STK3)信号途径的关系第42-44页
4 讨论第44-48页
    4.1 StPP2A-c基因调控大斑刚毛座腔菌分生孢子的发育及黑色素的合成第44-45页
        4.1.1 StPP2A-c基因的功能研究第44页
        4.1.2 转录组数据分析第44-45页
    4.2 大斑刚毛座腔菌中CaMK家族的研究与鉴定第45-46页
    4.3 StPP2A-c基因参与调节3条信号途径第46-48页
5 结论第48-49页
参考文献第49-53页
附录第53-71页
    1 引言第55-56页
    2 材料与方法第56-59页
        2.1 材料第56页
        2.2 方法第56-59页
            2.2.1 GPCR基因家族的鉴定第56页
            2.2.2 系统发育树构建第56页
            2.2.3 蛋白质保守基序分析第56-57页
            2.2.4 基因结构分析第57页
            2.2.5 基因转录模式分析第57-59页
    3 结果与分析第59-64页
        3.1 大斑刚毛座腔菌GPCR超家族的鉴定第59页
        3.2 大斑刚毛座腔菌GPCR超家族基因组定位及基因结构分析第59-60页
        3.3 大斑刚毛座腔菌GPCR超家族系统进化分析第60页
        3.4 大斑刚毛座腔菌GPCR超家族保守结构域分析第60-62页
        3.5 GPCR超家族基因转录模式分析第62-64页
    4 讨论第64-66页
    5 结论第66-67页
    参考文献第67-71页
在读期间发表的学术论文第71-72页
作者简历第72-73页
致谢第73-74页

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