摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
缩写词表 | 第7-11页 |
1 引言 | 第11-14页 |
1.1 玉米大斑病及其危害 | 第11页 |
1.2 PP2A蛋白磷酸酶 | 第11页 |
1.3 PP2A与信号途径的关系 | 第11-13页 |
1.4 研究内容以及研究意义 | 第13-14页 |
1.4.1 大斑刚毛座腔菌中PP2A的功能研究 | 第13页 |
1.4.2 大斑刚毛座腔菌中CaMKs家族的基因鉴定与表达模式分析 | 第13页 |
1.4.3 大斑刚毛座腔菌中PP2A与3条信号转导通路的关系 | 第13-14页 |
2 材料和方法 | 第14-22页 |
2.1 试验材料 | 第14页 |
2.1.1 供试菌株、寄主和质粒 | 第14页 |
2.1.2 试剂和试验所用的培养基 | 第14页 |
2.1.3 DNA和RNA的提取 | 第14页 |
2.2 大斑刚毛座腔菌StPP2A-c蛋白的生物信息学分析 | 第14-15页 |
2.3 大斑刚毛座腔菌StPP2A-c基因回复载体的构建 | 第15-16页 |
2.3.1 StPP2A-c基因的PCR扩增 | 第15页 |
2.3.2 PCR产物测序 | 第15-16页 |
2.3.3 基因片段的连接 | 第16页 |
2.4 大斑刚毛座腔菌StPP2A-c基因回复突变体的创制 | 第16-17页 |
2.4.1 StPP2A-c基因回复载体转化StPP2A-c缺失突变体的原生质体 | 第16页 |
2.4.2 大斑刚毛座腔菌StPP2A-c基因回复突变体的获得 | 第16-17页 |
2.5 大斑刚毛座腔菌StPP2A-c突变体分析 | 第17-18页 |
2.5.1 表型分析以及菌丝观察 | 第17页 |
2.5.2 生长速度及产孢量测定 | 第17页 |
2.5.3 转化子孢子的萌发、附着胞形成及穿透能力 | 第17页 |
2.5.4 转化子的胞内黑色素分析 | 第17页 |
2.5.5 转化子的胞壁降解酶活性测定 | 第17页 |
2.5.6 转化子的细胞壁对H2O2的敏感性影响 | 第17-18页 |
2.6 野生型与StPP2A-c突变体的转录组测序 | 第18-19页 |
2.6.1 试验流程 | 第18页 |
2.6.2 信息分析流程 | 第18-19页 |
2.7 大斑刚毛座腔菌CaMK家族的基因鉴定与表达模式分析 | 第19页 |
2.7.1 生物信息学分析 | 第19页 |
2.7.2 基因表达模式分析 | 第19页 |
2.8 StPP2A-c基因与Ca2+信号途径的关系 | 第19-20页 |
2.9 StPP2A-c基因与MAPK(STK1/STK2/STK3)信号途径的关系 | 第20-22页 |
3 结果与分析 | 第22-44页 |
3.1 StPP2A-c蛋白的生物信息学分析 | 第22-23页 |
3.1.1 保守结构域分析 | 第22页 |
3.1.2 结构预测 | 第22-23页 |
3.2 StPP2A-c基因回复载体的构建 | 第23-24页 |
3.2.1 基因克隆 | 第23-24页 |
3.2.2 回复载体的酶切验证 | 第24页 |
3.3 StPP2A-c基因回复突变体的获得与验证 | 第24-25页 |
3.4 StPP2A-c调控分生孢子的发育和黑色素的合成 | 第25-31页 |
3.4.1 菌落及菌丝形态观察 | 第25-26页 |
3.4.2 StPP2A-c基因对大斑刚毛座腔菌菌丝生长的调控 | 第26-27页 |
3.4.3 StPP2A-c基因对大斑刚毛座腔菌分生孢子发育的调控 | 第27页 |
3.4.4 StPP2A-c基因对大斑刚毛座腔菌附着胞和侵染丝发育的调控 | 第27-28页 |
3.4.5 StPP2A-c基因参与调控大斑刚毛座腔菌胞内黑色素合成的调控 | 第28-29页 |
3.4.6 StPP2A-c基因对大斑刚毛座腔菌细胞壁降解酶活性的调控 | 第29-30页 |
3.4.7 StPP2A-c基因的缺失导致大斑刚毛座腔菌对氧胁迫敏感 | 第30-31页 |
3.5 野生型和StPP2A-c突变体的转录组测序结果与分析 | 第31-37页 |
3.5.1 测序数据统计 | 第31页 |
3.5.2 RNA-Seq质量的评价与估测 | 第31-32页 |
3.5.3 基因表达分析 | 第32-33页 |
3.5.4 差异表达分析 | 第33页 |
3.5.5 功能分类结果与分析 | 第33-35页 |
3.5.6 差异表达基因KEGG注释 | 第35-37页 |
3.6 大斑刚毛座腔菌CaMK家族的基因鉴定与表达模式分析 | 第37-41页 |
3.6.1 大斑刚毛座腔菌CaMK家族基因系统发育分析 | 第37页 |
3.6.2 CaMK家族编码蛋白保守结构域分析 | 第37-38页 |
3.6.3 病菌侵染结构形成过程中的基因表达模式分析 | 第38-41页 |
3.7 StPP2A-c基因与Ca2+信号途径的关系 | 第41-42页 |
3.7.1 StPP2A-c基因与CaMK家族的相互关系 | 第41-42页 |
3.7.2 StPP2A-c与钙调素(CAM)、钙调磷酸酶(CNA/CNB)的相互关系 | 第42页 |
3.8 StPP2A-c基因与MAPK(STK1/STK2/STK3)信号途径的关系 | 第42-44页 |
4 讨论 | 第44-48页 |
4.1 StPP2A-c基因调控大斑刚毛座腔菌分生孢子的发育及黑色素的合成 | 第44-45页 |
4.1.1 StPP2A-c基因的功能研究 | 第44页 |
4.1.2 转录组数据分析 | 第44-45页 |
4.2 大斑刚毛座腔菌中CaMK家族的研究与鉴定 | 第45-46页 |
4.3 StPP2A-c基因参与调节3条信号途径 | 第46-48页 |
5 结论 | 第48-49页 |
参考文献 | 第49-53页 |
附录 | 第53-71页 |
1 引言 | 第55-56页 |
2 材料与方法 | 第56-59页 |
2.1 材料 | 第56页 |
2.2 方法 | 第56-59页 |
2.2.1 GPCR基因家族的鉴定 | 第56页 |
2.2.2 系统发育树构建 | 第56页 |
2.2.3 蛋白质保守基序分析 | 第56-57页 |
2.2.4 基因结构分析 | 第57页 |
2.2.5 基因转录模式分析 | 第57-59页 |
3 结果与分析 | 第59-64页 |
3.1 大斑刚毛座腔菌GPCR超家族的鉴定 | 第59页 |
3.2 大斑刚毛座腔菌GPCR超家族基因组定位及基因结构分析 | 第59-60页 |
3.3 大斑刚毛座腔菌GPCR超家族系统进化分析 | 第60页 |
3.4 大斑刚毛座腔菌GPCR超家族保守结构域分析 | 第60-62页 |
3.5 GPCR超家族基因转录模式分析 | 第62-64页 |
4 讨论 | 第64-66页 |
5 结论 | 第66-67页 |
参考文献 | 第67-71页 |
在读期间发表的学术论文 | 第71-72页 |
作者简历 | 第72-73页 |
致谢 | 第73-74页 |