| 摘要 | 第1-12页 |
| ABSTRACT | 第12-18页 |
| 缩略词 | 第18-20页 |
| 第一章 绪论 | 第20-27页 |
| ·嗜盐微生物的分类 | 第20-21页 |
| ·环境多样性和嗜盐菌的环境适应性 | 第21-24页 |
| ·嗜盐菌的应用 | 第24-26页 |
| ·环境友好材料PHB的生物合成 | 第24-25页 |
| ·生物处理高盐有机废水 | 第25-26页 |
| ·立题依据 | 第26-27页 |
| 第二章 山东省盐场环境中嗜盐菌的筛选及其区系调查 | 第27-47页 |
| ·实验材料 | 第27-29页 |
| ·样品 | 第27-28页 |
| ·培养基及溶液 | 第28页 |
| ·实验试剂 | 第28页 |
| ·要实验仪器 | 第28-29页 |
| ·实验方法 | 第29-31页 |
| ·样品处理 | 第29页 |
| ·样品的稀释涂布及培养 | 第29页 |
| ·样品的富集培养 | 第29-30页 |
| ·菌落的统计及分离纯化 | 第30页 |
| ·基于16s RNA基因的菌株鉴定 | 第30-31页 |
| ·实验结果与分析 | 第31-47页 |
| ·预实验结果分析 | 第31-38页 |
| ·实验结果分析 | 第38-47页 |
| 第三章 免培养细菌区系的演替规律的研究 | 第47-67页 |
| ·ILLUMINA MISEQ高通量测序 | 第47-51页 |
| ·生物信息学分析 | 第47-51页 |
| ·不同盐场样品中免培养细菌区系的分布规律 | 第51-66页 |
| ·原始数据质量控制 | 第51-53页 |
| ·OTU聚类结果展示及说明 | 第53-54页 |
| ·基于物种丰度分析结果展示 | 第54-57页 |
| ·基于群落结构分析结果展示 | 第57-66页 |
| ·可培养细菌与免培养细菌区系的比较 | 第66-67页 |
| 第四章 六株嗜盐菌新物种的多相分类学研究 | 第67-124页 |
| ·实验材料 | 第67-69页 |
| ·实验对象 | 第67页 |
| ·培养基与溶液 | 第67-68页 |
| ·实验试剂 | 第68页 |
| ·主要实验仪器 | 第68-69页 |
| ·实验方法 | 第69-73页 |
| ·基于遗传学的分类鉴定 | 第69-70页 |
| ·微生物表型及生理生化特征的测定 | 第70-71页 |
| ·化学特征分析 | 第71-73页 |
| ·菌株保藏 | 第73页 |
| ·实验结果与分析 | 第73-124页 |
| ·嗜盐长单胞菌(Longimonas halophila gen.nov.,sp.nov.)SYD6~T的多相分类鉴定 | 第73-81页 |
| ·赭色嗜盐丝状菌(Halofilum ochraceum gen.nov.,sp.nov.)XJ16~T的多相分类鉴定 | 第81-89页 |
| ·嗜盐螺旋杆菌(Spiribacter halophilus sp.nov.)2W06~T的多相分类鉴定 | 第89-96页 |
| ·嗜盐另矿生菌(Aliifodinibius halophilus sp.nov.)2W32~T的多相分类鉴定以及巴纽尔斯菌科的建立 | 第96-108页 |
| ·嗜盐红色盐杆菌(Rhodohalobacter halophilus gen.nov.,sp.nov.)JZ3C29~T的多相分类鉴定以及关于鞘脂杆菌纲分类单元重新划分的思考 | 第108-116页 |
| ·盐场长杆菌(Longibacter salinarum gen.nov.,sp.nov.)WDS2C18~T的多相分类鉴定 | 第116-124页 |
| 第五章 嗜盐菌XJ16~T,2W06~T和JZ3C29~T基因组生物信息学分析 | 第124-137页 |
| ·实验材料和方法 | 第124-126页 |
| ·实验材料 | 第124页 |
| ·实验方法 | 第124-126页 |
| ·实验结果与分析 | 第126-137页 |
| ·基因组序列拼装与分析 | 第126-128页 |
| ·功能元件分析 | 第128-131页 |
| ·亚系统分析 | 第131-132页 |
| ·蛋白编码基因的亚细胞定位分析 | 第132页 |
| ·蛋白编码基因功能注释 | 第132-137页 |
| 第六章 总结与展望 | 第137-139页 |
| 参考文献 | 第139-155页 |
| 附录 | 第155-188页 |
| 致谢 | 第188-189页 |
| 资助情况 | 第189-190页 |
| 攻读学位期间发表和撰写的学术论文目录 | 第190-191页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第191页 |
