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里氏木霉内切纤维素酶活性架构及关键亚位点功能研究

中文摘要第1-10页
ABSTRACT第10-13页
缩略词表第13-14页
第一章 绪论第14-34页
   ·木质纤维素原材料的特征第14-20页
     ·半纤维素及木素等成分第15-17页
     ·纤维素第17-20页
   ·降解纤维素的微生物第20-23页
     ·细菌域微生物第20-22页
     ·真菌域微生物第22-23页
     ·古菌域微生物第23页
   ·纤维素高效降解菌株——丝状真菌第23-27页
     ·状真菌的高效分泌特性第24-25页
     ·状真菌分泌的游离胞外酶系第25-27页
   ·碳水化合物活性酶类数据库(CAZy)第27-32页
     ·CAZy数据库的概述第27-28页
     ·糖苷水解酶家族第28页
     ·主要糖苷水解酶家族第28-32页
   ·立项依据第32-34页
第二章 内切纤维素酶和底物糖环的结构生物信息学分析第34-48页
   ·材料与方法第34-36页
     ·生物信息学网站及数据库第34页
     ·生物信息学软件第34页
     ·数据的获取与处理第34-35页
     ·序列与结构比对第35页
     ·糖苷水解酶家族活性架构区域氨基酸频率分析第35-36页
     ·糖苷水解酶家族活性架构序列谱的制作第36页
   ·结构与分析第36-45页
     ·底物扭曲的多样性与内切纤维素酶的分型第36-39页
     ·主要糖苷水解酶家族信息分析第39-40页
     ·糖苷水解酶活性架构区域第40-41页
     ·糖苷水解酶家族活性架构部位氨基酸使用频率第41-43页
     ·糖苷水解酶家族的活性架构序列谱第43-44页
     ·糖苷水解酶家族关键亚位点氨基酸分析第44-45页
   ·小结与讨论第45-48页
第三章 异源表达系统及重组酶性质分析第48-60页
   ·材料与方法第48-56页
     ·菌株及质粒第48页
     ·试剂及培养基第48-49页
     ·主要仪器与试剂第49-50页
     ·以大肠杆菌为宿主的原核表达系统第50-53页
     ·以毕赤酵母为宿主的真核表达体系第53-55页
     ·蛋白浓度的测定第55页
     ·酶活性测定第55页
     ·酶分子最适反应条件的测定第55-56页
   ·结果与分析第56-58页
     ·基因克隆与重组质粒的构建第56页
     ·外源基因在大肠杆菌中的诱导表达第56-57页
     ·外源基因在毕赤酵母GS115中的诱导表达第57-58页
     ·两种表达体系的比较第58页
   ·小结与讨论第58-60页
第四章 TrCe15A酶分子活性架构关键亚位点功能研究第60-72页
   ·材料与方法第60-64页
     ·菌株与质粒第60页
     ·主要仪器及试剂第60-61页
     ·定点突变引物第61页
     ·定点突变第61-62页
     ·突变体蛋白在大肠杆菌Origami(DE3)菌株中的表达和纯化第62页
     ·突变体蛋白的酶活性质测定第62页
     ·荧光辅助糖电泳(FACE)技术展示蛋白降解产物谱第62-64页
   ·结果与分析第64-70页
     ·TrCe15A关键位点-2位点的选择第64页
     ·基因egl2关键氨基酸的定点突变第64-65页
     ·突变体蛋白的纯化第65-66页
     ·突变体蛋白的酶活性质测定第66-69页
     ·突变体蛋白的产物谱变化第69-70页
   ·小结与讨论第70-72页
第五章 TrCe17B酶分子活性架构关键亚位点功能研究第72-82页
   ·材料与方法第72-74页
     ·菌株与质粒第72页
     ·主要仪器及试剂第72页
     ·基因克隆与重组质粒的构建第72-73页
     ·定点突变引物第73页
     ·定点突变第73页
     ·重组质粒的转化及异源蛋白的诱导表达第73-74页
     ·突变体蛋白的性质测定第74页
     ·突变体蛋白降解RAC分析第74页
   ·结果与分析第74-81页
     ·TrCe17B(EGI)的基因克隆与异源表达第74-75页
     ·TrCe17B关键位点-2位点的选择第75-76页
     ·基因egl1关键氨基酸的定点突变第76-77页
     ·突变体蛋白的纯化第77页
     ·突变体蛋白的酶活性质测定第77-80页
     ·突变体蛋白的产物谱变化第80-81页
   ·小结与讨论第81-82页
全文总结与展望第82-86页
参考文献第86-96页
致谢第96-98页
攻读学位期间发表的学术论文第98-99页
附件第99页

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