| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-8页 |
| 1 绪论 | 第8-11页 |
| ·引言 | 第8页 |
| ·研究背景及意义 | 第8-9页 |
| ·核小体位置信息预测 | 第8-9页 |
| ·DNA甲基化位点预测 | 第9页 |
| ·DNA剪切位点预测 | 第9页 |
| ·论文的工作内容及结构安排 | 第9-11页 |
| 2 DNA序列的特征提取方法 | 第11-23页 |
| ·核苷酸成份法 | 第11-13页 |
| ·核苷酸组成成份法(Mononucleotide Composition,MNC) | 第11页 |
| ·核苷酸二联体组成成份法(Dinucleotide Composition,DNC) | 第11-12页 |
| ·核苷酸三联体组成成份法(Trinucleotide Composition,TNC) | 第12-13页 |
| ·伪核苷酸组成成份法 | 第13-18页 |
| ·基于核苷酸结构属性法 | 第13-14页 |
| ·基于DNA蛋白质的物理化学属性法 | 第14-18页 |
| ·基于图像信息的DNA序列特征提取法 | 第18-22页 |
| ·2D图像表示法 | 第18-19页 |
| ·3D图像表示法 | 第19-20页 |
| ·4D图像表示法 | 第20-22页 |
| ·本章小结 | 第22-23页 |
| 3 基于序列信息的特征融合方法的核小体预测 | 第23-33页 |
| ·引言 | 第23-24页 |
| ·核小体数据集的建立 | 第24页 |
| ·基于核苷酸结构属性的样本特征的构建 | 第24-27页 |
| ·Ziv-Lempel复杂度影响因子和元胞自动机(ZLC) | 第25-26页 |
| ·马尔科夫信息熵 | 第26-27页 |
| ·核小体的分类预测 | 第27-32页 |
| ·预测器的性能评估 | 第28-29页 |
| ·结果与讨论 | 第29-31页 |
| ·在线预测系统的建立 | 第31-32页 |
| ·本章小结 | 第32-33页 |
| 4 基于序列信息的DNA甲基化位点在线预测预测系统的建立 | 第33-44页 |
| ·引言 | 第33-34页 |
| ·DNA甲基化数据集的建立 | 第34-36页 |
| ·DNA样本片段特征提取方法 | 第36-39页 |
| ·优化非平衡数据集 | 第37-39页 |
| ·基于伪核苷酸组成成分的DNA甲基化位点的预测 | 第39-42页 |
| ·分类器的性能评价指标 | 第39页 |
| ·Jackknife和Target-Jackknife交叉验证测试 | 第39-40页 |
| ·与当前存在的数据器进行比较 | 第40-42页 |
| ·在线系统的建立 | 第42-43页 |
| ·本章小结 | 第43-44页 |
| 5 基于序列信息的特征选择的DNA剪切位点在线预测预测系统的建立 | 第44-59页 |
| ·引言 | 第44-45页 |
| ·DNA剪切位点数据集的建立 | 第45-46页 |
| ·DNA样本片段特征提取方法 | 第46-50页 |
| ·核苷酸二联体成分(Dinucleotide Composition,DNC) | 第46-47页 |
| ·基于核苷酸结构属性法 | 第47-50页 |
| ·基于D特征选择的剪切位点的预测 | 第50-56页 |
| ·模糊K近邻分类器 | 第50页 |
| ·分类器的性能评价指标 | 第50页 |
| ·特征选择 | 第50页 |
| ·结果与讨论 | 第50-56页 |
| ·在线系统的建立 | 第56-58页 |
| ·本章小结 | 第58-59页 |
| 6 结论与展望 | 第59-61页 |
| ·结论 | 第59-60页 |
| ·进一步工作展望 | 第60-61页 |
| 致谢 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-71页 |
| 攻读硕士学位期间参加的项目和所发表的论文 | 第71页 |
