基于序列信息的酵母重组热点和冷点的分析与预测研究
| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-7页 |
| 1 绪论 | 第7-11页 |
| ·引言 | 第7页 |
| ·酵母重组的研究背景及研究意义 | 第7-10页 |
| ·基因重组的概念 | 第8-9页 |
| ·酵母重组冷点和热点研究背景、意义及现状 | 第9-10页 |
| ·论文的工作内容安排 | 第10-11页 |
| 2 基于酵母DNA序列统计特征及分析 | 第11-30页 |
| ·数据集的构建 | 第11页 |
| ·基于酵母序列提取单词的频率分析 | 第11-19页 |
| ·单核苷酸的频率 | 第12-13页 |
| ·二联核苷酸的频率 | 第13-15页 |
| ·三联核苷酸的频率 | 第15-19页 |
| ·GC含量分析 | 第19-20页 |
| ·二联核苷酸相对丰度分析 | 第20-22页 |
| ·碱基对的关联性分析 | 第22-25页 |
| ·密码子的偏性分析 | 第25-30页 |
| ·同义密码子使用度 | 第25-27页 |
| ·密码子适用指数 | 第27页 |
| ·密码子偏好参数 | 第27-30页 |
| 3 常用的序列特征提取方法 | 第30-41页 |
| ·概述 | 第30页 |
| ·基于序列组成成分法提取特征 | 第30页 |
| ·基于序列的物理化学属性提取特征 | 第30-39页 |
| ·基于氨基酸的物理化学属性 | 第30-35页 |
| ·基于二联核苷酸的结构属性 | 第35-39页 |
| ·基于图像信息的DNA序列特征提取 | 第39-41页 |
| ·2D图像表示法 | 第39页 |
| ·3D图像表示法 | 第39-41页 |
| 4 基于酵母序列冷点和热点的分类预测结果 | 第41-56页 |
| ·酵母序列信息的特征提取 | 第41-46页 |
| ·基于灰色理论的伪核苷酸特征提取 | 第41-43页 |
| ·基于结构属性的伪二联核苷酸的特征提取 | 第43页 |
| ·基于复杂度的特征提取 | 第43-46页 |
| ·对酵母序列分类和检验评估 | 第46-52页 |
| ·基于支持向量机对酵母序列分类与评估 | 第47-50页 |
| ·基于随机森林对酵母序列分类与评估 | 第50页 |
| ·基于K近邻法对酵母序列分类与评估 | 第50-52页 |
| ·基于酵母序列优化测试结果 | 第52-54页 |
| ·特征选择概念 | 第52-53页 |
| ·特征选择方法具体介绍 | 第53-54页 |
| ·基于酵母序列的前向特征选择方法 | 第54页 |
| ·基于酵母序列的预测结果与比较 | 第54-56页 |
| 5 总结与展望 | 第56-57页 |
| ·总结 | 第56页 |
| ·展望 | 第56-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-65页 |
| 攻读硕士学位期间参加的项目和所发表的论文 | 第65页 |
