| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-14页 |
| 第1章 绪论 | 第14-36页 |
| ·蛋白质-蛋白质对接方法的研究意义和进展 | 第14-18页 |
| ·分子对接的基本原理 | 第15页 |
| ·蛋白质-蛋白质对接方法的研究进展 | 第15-18页 |
| ·计算机辅助药物设计的基本理论和方法 | 第18-23页 |
| ·计算机辅助药物设计的基本理论 | 第19-20页 |
| ·常用的计算机辅助药物设计方法 | 第20-23页 |
| ·HIV 整合酶抑制剂的研究意义和研究进展 | 第23-36页 |
| ·抗HIV 药物的研究意义和研究进展 | 第23-29页 |
| ·HIV 整合酶抑制剂的研究进展 | 第29-36页 |
| 第2章 蛋白质-蛋白质对接方法的研究 | 第36-60页 |
| ·基于结合位点信息的蛋白质-蛋白质对接方法 | 第36-46页 |
| ·计算方法 | 第37-40页 |
| ·结果与讨论 | 第40-46页 |
| ·基于蛋白质复合物类型的组合打分函数 | 第46-58页 |
| ·对接体系和方法 | 第46-47页 |
| ·结果与讨论 | 第47-58页 |
| ·本章小结 | 第58-60页 |
| 第3章 HIV-1 整合酶抑制剂的设计研究 | 第60-98页 |
| ·苯乙烯基喹啉类整合酶抑制剂的3D-QSAR 和结合模式的研究 | 第60-73页 |
| ·计算方法 | 第60-62页 |
| ·结果与讨论 | 第62-73页 |
| ·苯乙烯基喹啉类抑制剂的改造研究 | 第73-78页 |
| ·计算方法 | 第73页 |
| ·结果讨论 | 第73-78页 |
| ·整合酶二聚体的相互作用和界面小肽抑制剂的设计研究 | 第78-91页 |
| ·体系和方法 | 第80-82页 |
| ·结果与讨论 | 第82-91页 |
| ·基于整合酶结构的计算机虚拟筛选 | 第91-96页 |
| ·体系和方法 | 第92-93页 |
| ·结果讨论 | 第93-96页 |
| ·本章小结 | 第96-98页 |
| 第4章 HIV-1 整合酶的表达和纯化 | 第98-120页 |
| ·材料与方法 | 第100-109页 |
| ·实验材料 | 第100-103页 |
| ·实验方法 | 第103-109页 |
| ·HIV-1 整合酶表达载体的构建 | 第103-106页 |
| ·HIV-1 整合酶的表达和纯化 | 第106-108页 |
| ·ELISA 鉴定重组整合酶蛋白活性 | 第108-109页 |
| ·实验结果与讨论 | 第109-119页 |
| ·整合酶DNA 片段的扩增和鉴定 | 第110-111页 |
| ·重组表达质粒的构建及鉴定 | 第111-114页 |
| ·整合酶基因在大肠杆菌中的表达 | 第114-116页 |
| ·表达产物的纯化 | 第116-117页 |
| ·整合酶融合蛋白的功能研究 | 第117-119页 |
| ·本章小结 | 第119-120页 |
| 第5章 结束语 | 第120-125页 |
| ·论文工作总结 | 第120-121页 |
| ·论文创新点 | 第121-122页 |
| ·展望 | 第122-125页 |
| 参考文献 | 第125-141页 |
| 附录 | 第141-158页 |
| 攻读博士学位期间所发表的学术论文和软件著作权 | 第158-162页 |
| 致谢 | 第162-163页 |