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钝齿棒杆菌SYPA5-5发酵产L-精氨酸的代谢工程改造

摘要第1-5页
Abstract第5-11页
第一章 绪论第11-23页
   ·L-精氨酸及其生产第11-17页
     ·L-精氨酸的性质第11页
     ·L-精氨酸的用途及市场第11-12页
     ·L-精氨酸的生产方法第12页
     ·L-精氨酸生产菌株的国内外研究现状第12-14页
     ·L-精氨酸合成代谢途径及其代谢调控第14-17页
   ·代谢工程育种第17-21页
     ·代谢工程第17-18页
     ·代谢工程及相关技术在氨基酸育种中的应用第18-20页
     ·L-精氨酸代谢工程育种研究进展第20-21页
   ·立题背景与研究目的及意义第21页
   ·本课题研究思路及研究内容第21-23页
第二章 钝齿棒杆菌L-精氨酸合成相关基因簇的克隆及功能研究第23-41页
   ·引言第23-24页
   ·材料与方法第24-29页
     ·菌株、质粒及相关引物第24页
     ·主要试剂、相关培养基及培养条件第24-25页
     ·钝齿棒杆菌染色体的提取第25-26页
     ·相关PCR 反应及其产物回收第26页
     ·重组质粒的构建与验证第26页
     ·感受态细胞制备与转化第26-27页
     ·阳性转化子的鉴定及质粒稳定性检测第27页
     ·重组菌的蛋白表达分析第27页
     ·目标蛋白纯化和蛋白含量测定第27页
     ·酶活检测分析第27-28页
     ·酶学性质的初步研究第28-29页
     ·菌体生长量测定第29页
     ·钝齿棒杆菌L-精氨酸发酵条件第29页
     ·葡萄糖含量及氨基酸浓度测定第29页
   ·结果与讨论第29-40页
     ·钝齿棒杆菌SYPA 5-5 argCH 基因簇的克隆及其序列分析第29-30页
     ·钝齿棒杆菌阻遏蛋白编码基因argR 突变分析第30-31页
     ·钝齿棒杆菌SYPA 5-5 argC~argH 基因的克隆及其酶学性质研究第31-34页
     ·基因argC~argH 分别在钝齿棒杆菌中的加强表达第34-36页
     ·基因簇argCH 在钝齿棒杆菌中的克隆表达及其产酸研究第36-40页
   ·本章小结第40-41页
第三章 钝齿棒杆菌L-精氨酸合成途径中阻遏蛋白ArgR 功能分析第41-67页
   ·引言第41页
   ·材料与方法第41-47页
     ·菌株、质粒及相关引物第41页
     ·主要试剂、相关培养基及培养条件第41-43页
     ·相关酶活力测定第43页
     ·钝齿棒杆菌RNA 的提取与纯化第43页
     ·RT-PCR第43页
     ·双向电泳(2-DE)第43-47页
   ·结果与讨论第47-66页
     ·钝齿棒杆菌阻遏蛋白编码基因argR 的克隆及其序列分析第47-48页
     ·钝齿棒杆菌CcargR 基因在大肠杆菌中的表达第48页
     ·C. crenatum SYA 5 来源的argR (CcR) 在钝齿棒杆菌中过量表达第48-49页
     ·ArgR 对钝齿棒杆菌精氨酸合成途径酶活的影响第49-50页
     ·阻遏蛋白ArgR 对钝齿棒杆菌argC~argH 基因转录水平的影响第50-51页
     ·阻遏蛋白ArgR 对精氨酸积累的影响第51-52页
     ·采用2-DE 进行ArgR 差异蛋白质组学分析第52-66页
   ·本章小结第66-67页
第四章 钝齿棒杆菌精氨酸合成关键酶NAGK 抗反馈抑制定点改造第67-91页
   ·引言第67页
   ·材料与方法第67-71页
     ·菌株、质粒和引物第67-69页
     ·主要试剂、相关培养基及培养条件第69页
     ·NAGK 的酶活测定及蛋白纯化第69页
     ·精氨酸抑制实验第69-70页
     ·酶反应动力学参数测定第70页
     ·NAGK 二级结构预测第70页
     ·同源建模及NAGK 蛋白结构同源比对第70页
     ·蛋白结构三维空间模型的构建第70页
     ·定点突变第70-71页
     ·Western Blot 杂交验证第71页
   ·结果与讨论第71-90页
     ·大肠杆菌Ecol_NAGK 编码基因EcargB 的克隆表达第71-72页
     ·Ccre_NAGK、Ecol_NAGK 的反馈抑制考察第72-73页
     ·钝齿棒杆菌Ccre_NAGK 的二级结构分析第73页
     ·不同来源的NAGK 序列同源比对第73-75页
     ·钝齿棒杆菌Ccre_NAGK 的三级结构同源建模第75-77页
     ·基于NAGK 三维结构的反馈抑制机理分析第77-78页
     ·Ccre_NAGK 解除反馈抑制理性设计第78-80页
     ·突变型argB’基因的克隆第80-81页
     ·突变型Ccre_argB’在大肠杆菌BL21(DE3)中的表达第81-83页
     ·突变型Ccre_NAGK 的反馈抑制机理分析第83-84页
     ·多点突变argB_(21) 及argB_(36) 的克隆第84-85页
     ·突变型NAGK_(21) 和NAGK_(36) 的反馈抑制第85-86页
     ·构建重组钝齿棒杆菌 SYPA 5-5-EcB 、SYPA 5-5-CCB_(36) 及 SYPA 5-5-CCB_(36H)第86-87页
     ·NAGK_(36) 及NAGK_(36H) 在钝齿棒杆菌中的表达、纯化及验证第87-88页
     ·钝齿棒杆菌SYPA 5-5 与SYPA 5-5-CCB_(36) 发酵L-精氨酸分析比较第88-90页
   ·本章小结第90-91页
第五章 钝齿棒杆菌L-精氨酸合成竞争支路敲除及其发酵分析第91-105页
   ·引言第91-92页
   ·材料与方法第92-95页
     ·菌株与质粒第92-93页
     ·主要试剂、相关培养基及培养条件第93页
     ·钝齿棒杆菌SYPA 5-5 染色体的提取第93页
     ·缺失型片段的克隆第93页
     ·重组自杀型质粒的构建第93页
     ·自杀型质粒的转化原理与二次同源重组示意图第93-94页
     ·缺失基因转化子的筛选第94页
     ·转化子的菌落PCR 验证第94页
     ·酶活测定实验第94-95页
     ·重组钝齿棒杆菌产酸发酵第95页
   ·结果与讨论第95-104页
     ·精氨酸合成相关旁路基因proB、glnA、lysC 基因的克隆第95页
     ·含同源整合片段的proB’等缺失型基因的克隆第95页
     ·重组质粒pK18mobsacB-proB’等的构建及其验证第95页
     ·重组钝齿棒杆菌△proB、△glnA、△lysC 缺失型菌株的筛选及验证第95-96页
     ·重组C. crenatum SYPA 5-5 △proB 转化子的鉴定及酶活检测第96-97页
     ·重组C. crenatum SYPA 5-5 △proB 转化子摇瓶发酵实验第97-98页
     ·重组C. crenatum SYPA 5-5 △glnA 转化子的鉴定及酶活检测第98-99页
     ·重组C. crenatum SYPA 5-5 △glnA 转化子摇瓶发酵实验第99-100页
     ·重组C. crenatum SYPA 5-5 △lysC 转化子的鉴定及酶活检测第100-101页
     ·重组C. crenatum SYPA 5-5 △lysC 转化子摇瓶发酵实验第101-104页
   ·本章小结第104-105页
第六章 高产L-精氨酸重组钝齿棒杆菌的构建及其代谢网络分析第105-118页
   ·引言第105-106页
   ·材料与方法第106-108页
     ·菌株与质粒第106页
     ·主要试剂、相关培养基及培养条件第106页
     ·发酵液中氨基酸含量分析第106-107页
     ·发酵液中有机酸含量测定第107页
     ·代谢网络模型的计算方法第107页
     ·钝齿棒杆菌SYPA 5-5 代谢网络的建立和简化第107-108页
   ·结果与讨论第108-117页
     ·钝齿棒杆菌SYPA 5-5 argCH 基因簇的定点突变第108页
     ·重组质粒pJC1-9039_(SDB) 的构建第108页
     ·重组菌C. crenatum SYPA 5-5△proB-9039_(SDB) 的构建第108-109页
     ·重组菌C. crenatum SYPA 5-5△proB-9039_(SDB) 的遗传稳定性分析第109页
     ·重组菌C. crenatum SYPA 5-5△proB-9039_(SDB) 相关酶活力测定第109-110页
     ·重组菌C. crenatum△proB-9039_(SDB)摇瓶发酵产酸稳定性研究第110页
     ·重组菌C. crenatum△proB-9039_(SDB) 5 L 发酵罐发酵产酸研究第110-111页
     ·钝齿棒杆菌产酸发酵液中氨基酸和有机酸含量测定第111-112页
     ·钝齿棒杆菌合成L-精氨酸代谢网络模型的简化第112-113页
     ·重组菌C. crenatum △proB-9039_(SDB) 与SYPA 5-5 代谢流量分布第113-115页
     ·重组菌C. crenatum SYPA 5-5 △proB-9039_(SDB) 的L-精氨酸合成代谢优势分析第115-117页
   ·本章小结第117-118页
主要结论与展望第118-120页
 主要结论第118-119页
 展望第119-120页
论文创新点第120-121页
致谢第121-123页
参考文献第123-132页
附录Ⅰ第132-138页
 核苷酸及氨基酸序列第132-136页
 Corynebacterium crenatum SYPA 5-5 胞内代谢反应方程第136-137页
 英文缩略语中文对照表第137-138页
附录Ⅱ 作者在攻读博士学位期间发表的论文第138页

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