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应用糖蛋白组学技术对肿瘤特征糖蛋白的研究

中文摘要第1-7页
Abstract第7-16页
第一章 引言第16-39页
 第一节 糖蛋白第16-22页
     ·蛋白编译后修饰概述第16页
     ·蛋白糖基化的类型第16-19页
       ·N-连糖蛋白第16-18页
       ·O-连糖蛋白第18页
       ·S-糖苷键型第18-19页
       ·GPI 锚定蛋白第19页
       ·C-糖蛋白第19页
     ·蛋白糖的功能第19-20页
     ·蛋白糖与肿瘤第20-22页
 第二节 糖蛋白组学第22-29页
     ·糖蛋白的富集纯化第22-26页
       ·凝集素富集法第23-25页
       ·硼酸法第25页
       ·酰肼化学富集法第25页
       ·β-消除米氏加成反应第25-26页
     ·蛋白组学分析第26-29页
 第三节 点击化学以及其在生物研究中的应用第29-35页
     ·点击化学概念第29页
     ·点击化学生物研究中的应用—生物正交反应第29-35页
       ·叠氮化物-炔环加成(Azide-Alkyne Cycloaddition)第29-31页
       ·无铜催化叠氮化物炔环加成(Copper-Free Azide-Alkyne Cycloaddition)第31-33页
       ·施陶丁格链接反应(Staudinger Ligation)第33页
       ·基于四半胱氨酸的蛋白标记(tetracysteine-based protein detection)第33-34页
       ·羰基化合物温和的缩合反应第34-35页
 第四节 细胞表面糖蛋白的分离技术第35-38页
     ·细胞表面分子生物素化技术第35-37页
     ·点击化学在糖蛋白组学中的应用第37-38页
 第五节 目的和意义第38-39页
第二章 人乳腺癌细胞糖蛋白组学研究第39-56页
 第一节 材料与方法第39-47页
     ·实验材料和仪器第39-43页
       ·细胞株第39页
       ·相关试剂第39-40页
       ·培养基和主要试剂的配制方法第40-42页
       ·主要仪器第42-43页
     ·实验方法第43-47页
       ·细胞培养及蛋白的提取第43页
       ·使用 LCA 凝集素对糖蛋白的富集第43-44页
       ·使用 TCA 沉淀对糖蛋白进行纯化第44页
       ·双向电泳第44-45页
       ·硝酸银染色第45-46页
       ·二维电泳对比分析第46页
       ·蛋白酶切及质谱鉴定第46-47页
 第二节 实验结果第47-53页
     ·LCA 凝集素亲和富集 Hs578BST 与 Hs578T 的 N-糖基化蛋白第47页
     ·Hs578BST 与 Hs578T 的 N-糖基化蛋白组的比较分析第47-49页
     ·Hs578BST 与 Hs578T 中显著差异糖蛋白的鉴定及分析第49-53页
 第三节 讨论第53-55页
 本章小结第55-56页
第三章 P4HA2 表达及其在乳腺癌细胞系中作用的研究第56-84页
 第一节 材料与方法第56-70页
     ·实验材料和仪器第56-59页
       ·细胞株第56页
       ·相关试剂第56-57页
       ·培养基和主要试剂的配制方法第57-59页
       ·主要仪器第59页
     ·实验方法第59-70页
       ·Hs578T RNA 的提取第59-60页
       ·Realtime PCR第60页
       ·Western Blotting第60-61页
       ·P4HA2 在乳腺癌组织中的免疫组化分析第61-62页
       ·P4HA2 基因的扩增第62-63页
       ·P4HA2 基因片段 PCR 产物的酶切第63页
       ·pcDNA3.1 载体质粒的制备第63-64页
       ·pcDNA3.1 载体质粒的酶切第64-65页
       ·P4HA2 基因片段和 pcDNA3.1 载体质粒的连接第65页
       ·CaCl2法转化连接产物入大肠杆菌 DH5α第65页
       ·转化子的 PCR 初步鉴定第65-66页
       ·转化子的酶切鉴定第66页
       ·P4HA2 基因测序第66页
       ·Hs578T-P4HA2 细胞的培养与瞬时转染第66-67页
       ·Hs578T-P4HA2 细胞增殖计数第67页
       ·Hs578T-P4HA2 细胞迁移能力检测第67-68页
       ·P4HA2 在 Hs578T 细胞系中 RNA 干扰转染第68-69页
       ·Hs578T-shP4HA2 细胞增殖计数第69页
       ·Hs578T-shP4HA2 细胞迁移能力检测第69页
       ·293T-P4HA2 细胞的培养与转染, 细胞增殖计数以及迁移能力的检测第69-70页
 第二节 实验结果第70-82页
     ·P4HA1,P4HA2 二维电泳结果差异第70页
     ·P4HA1,P4HA2 以及 P4HB 在细胞系中表达的检测第70-71页
     ·P4HA2 在乳腺癌与正常乳腺组织中的表达第71-72页
     ·pcDNA3.1-P4HA2 重组质粒的构建第72-78页
     ·pcDNA3.1-P4HA2 及 P4HA2-shRNA 瞬时转染及对 Hs578T 细胞行为的影响第78-79页
     ·pcDNA3.1-P4HA2 瞬时转染及对 293T 细胞行为的影响第79-82页
 第三节 讨论第82-83页
 本章小结第83-84页
第四章 基于点击化学反应标记细胞表面糖蛋白技术的建立第84-108页
 第一节 材料与方法第84-93页
     ·实验材料和仪器第84-85页
       ·细胞株第84页
       ·相关试剂第84页
       ·培养基和主要试剂的配制方法第84-85页
       ·主要仪器第85页
     ·实验方法第85-93页
       ·非天然单糖及探针的合成第85-86页
       ·Ac4ManNAz 与 4-EN 的体外化学反应第86-87页
       ·流式细胞仪检测分析第87页
       ·激光共聚焦检测分析第87-88页
       ·直链炔基探针的合成第88-89页
       ·共聚焦检测合成探针活性第89页
       ·DTT 对 Alykne-SS- Biotin 的还原反应第89-90页
       ·共聚焦检测细胞表面糖蛋白的生物素化第90页
       ·反应试剂对细胞膜功能的影响第90页
       ·Alykne-SS-Biotin 细胞膜的穿透性研究第90-91页
       ·Western blot 检测 Alkyne-LC-Biotin 标记的细胞总蛋白第91页
       ·Western blot 检测 Alkyne-LC-Biotin 对细胞表面糖蛋白的分离第91-92页
       ·Alkyne-SS-Biotin 对细胞表面糖蛋白的分离第92-93页
 第二节 实验结果第93-106页
     ·Ac4ManNAz 与 4-EN 的体外化学反应第93-94页
     ·Ac4ManNAz 与 4-EN 在细胞中的化学反应第94-95页
     ·直链炔基探针的合成第95-97页
     ·对直链炔基探针在细胞反应性的检测第97-98页
     ·Alykne-SS- Biotin 的还原断裂检测第98-99页
     ·共聚焦检测细胞表面糖蛋白的生物素化第99页
     ·反应试剂对细胞膜功能的影响第99-101页
     ·Alykne-SS-Biotin 细胞膜的穿透性研究第101-102页
     ·Alkyne-LC-Biotin 对细胞膜表面糖蛋白的分离第102-104页
     ·Alkyne-SS-Biotin 对细胞膜表面糖蛋白的分离第104-106页
 第三节 讨论第106-107页
 本章小结第107-108页
第五章 癌细胞表面糖蛋白组学研究及 NrCAM 在肺腺癌细胞中的表达第108-127页
 第一节 材料与方法第108-112页
     ·实验材料和仪器第108-109页
       ·细胞株第108页
       ·相关试剂第108页
       ·培养基和主要试剂的配制方法第108-109页
       ·主要仪器第109页
     ·实验方法第109-112页
       ·使用 Alkyne-SS-Biotin 分离癌细胞表面糖蛋白第109页
       ·HPLC-MS/MS 分析 Alkyne-SS-Biotin 分离糖蛋白第109-110页
       ·生物信息学分析第110页
       ·对鉴定蛋白可靠性的考察第110-111页
       ·免疫荧光检测 NrCAM 在 A549 细胞表面的表达第111页
       ·免疫组化检测 NrCAM 在人非小细胞肺癌中的表达第111-112页
 第二节 实验结果第112-124页
     ·HPLC-MS/MS 鸟枪法检测第112页
     ·鉴定蛋白的生物信息学分析第112-113页
     ·随机鉴定蛋白表达第113-120页
     ·NrCAM 在 A549 中的鉴定以及表达第120-121页
     ·NrCAM 的免疫组化分析第121-124页
 第三节 讨论第124-126页
 本章小结第126-127页
第六章 gp96 在不同癌细胞中唾液酸修饰差异的研究第127-134页
 第一节 材料与方法第127-130页
     ·实验材料和仪器第127页
       ·相关试剂第127页
       ·培养基和主要试剂的配制方法第127页
       ·主要仪器第127页
     ·实验方法第127-130页
       ·HPLC-MS/MS 对 gp96 的鉴定第127-128页
       ·gp96 在不同细胞中表达分析第128页
       ·ELISA 检测 gp96 生物素化第128页
       ·使用凝集素 WGA 检测 gp96 的唾液酸化差异第128-130页
 第二节 实验结果第130-133页
     ·gp96 在不同细胞系和相应细胞表面糖蛋白组分中的表达第130-131页
     ·ELISA 检测 gp96 生物素化及唾液酸含量第131-133页
 第三节 讨论第133页
 本章小结第133-134页
总结与展望第134-137页
 一 总结第134-136页
 二 展望第136-137页
创新点第137-138页
参考文献第138-144页
致谢第144-145页
附录第145-166页
 使用 HPLC-MS/MS 在鉴定蛋白信息第145-166页
个人简历第166页
在学期间研究成果第166-168页

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