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基于RNA-seq技术对鼠疫耶尔森氏菌小RNA的筛选与鉴定

摘要第1-4页
ABSTRACT第4-6页
缩略语第6-9页
第一部分 文献综述及选题的目的和意义第9-20页
 1. 鼠疫的流行与危害第9-12页
   ·鼠疫菌的传播途径第10页
   ·鼠疫菌的病原学特征第10-12页
 2. 细菌基因表达调控第12-14页
   ·细菌基因表达调控类型及特点第12-13页
   ·细菌的转录调控子第13-14页
 3. sRNAs的调控与功能研究进展第14-16页
   ·sRNAs概述第14页
   ·sRNAs的作用机制第14-15页
   ·sRNAs调控细菌生理与毒力第15-16页
 4. Hfq蛋白密切参与sRNAs调控第16-17页
 5. sRNAs的大规模筛选与鉴定技术第17-18页
 6. 选题的目的和意义第18-20页
第二部分 材料和方法第20-42页
 1. 材料第20-30页
   ·菌株第20页
   ·培养基第20-24页
   ·主要仪器和设备第24-25页
   ·其他试剂及配制方法第25-28页
   ·实验动物第28-29页
   ·实验所用引物汇总第29-30页
 2. 方法第30-42页
   ·细菌的培养与体内感染BALB/c小鼠第30页
   ·体内感染BALB/c小鼠第30-31页
   ·Trizol提取总RNA和sRNAs片段富集第31-33页
   ·cDNA文库的制备、测序与数据分析第33-34页
   ·引物延伸实验确定sRNAs的转录起始位点第34-36页
   ·Northern Blotting验证sRNAs的存在与大小第36-42页
第三部分 结果及讨论第42-57页
 1. 结果第42-53页
   ·基于RNA-seq技术筛选到104个sRNAs第42-45页
   ·部分sRNAs转录起始位点的确定第45-48页
   ·部分sRNAs存在与大小的验证第48-49页
   ·sR034与sR035表达丰度验证第49-50页
   ·部分sRNAs稳定性的Hfq依赖性验证第50-51页
   ·CRP调控sRNAs的预测与验证第51-53页
 2. 讨论第53-57页
   ·RNA-seq用于致病菌和宿主转录组的研究第53-54页
   ·sRNAs与鼠疫菌进化第54页
   ·Hfq对鼠疫菌sRNAs的作用第54-55页
   ·sRNAs与鼠疫菌生理和毒力第55-57页
第四部分 结论第57-58页
参考文献第58-62页
致谢第62-64页
攻读硕士期间主要成果第64页

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