摘要 | 第1-4页 |
ABSTRACT | 第4-6页 |
缩略语 | 第6-9页 |
第一部分 文献综述及选题的目的和意义 | 第9-20页 |
1. 鼠疫的流行与危害 | 第9-12页 |
·鼠疫菌的传播途径 | 第10页 |
·鼠疫菌的病原学特征 | 第10-12页 |
2. 细菌基因表达调控 | 第12-14页 |
·细菌基因表达调控类型及特点 | 第12-13页 |
·细菌的转录调控子 | 第13-14页 |
3. sRNAs的调控与功能研究进展 | 第14-16页 |
·sRNAs概述 | 第14页 |
·sRNAs的作用机制 | 第14-15页 |
·sRNAs调控细菌生理与毒力 | 第15-16页 |
4. Hfq蛋白密切参与sRNAs调控 | 第16-17页 |
5. sRNAs的大规模筛选与鉴定技术 | 第17-18页 |
6. 选题的目的和意义 | 第18-20页 |
第二部分 材料和方法 | 第20-42页 |
1. 材料 | 第20-30页 |
·菌株 | 第20页 |
·培养基 | 第20-24页 |
·主要仪器和设备 | 第24-25页 |
·其他试剂及配制方法 | 第25-28页 |
·实验动物 | 第28-29页 |
·实验所用引物汇总 | 第29-30页 |
2. 方法 | 第30-42页 |
·细菌的培养与体内感染BALB/c小鼠 | 第30页 |
·体内感染BALB/c小鼠 | 第30-31页 |
·Trizol提取总RNA和sRNAs片段富集 | 第31-33页 |
·cDNA文库的制备、测序与数据分析 | 第33-34页 |
·引物延伸实验确定sRNAs的转录起始位点 | 第34-36页 |
·Northern Blotting验证sRNAs的存在与大小 | 第36-42页 |
第三部分 结果及讨论 | 第42-57页 |
1. 结果 | 第42-53页 |
·基于RNA-seq技术筛选到104个sRNAs | 第42-45页 |
·部分sRNAs转录起始位点的确定 | 第45-48页 |
·部分sRNAs存在与大小的验证 | 第48-49页 |
·sR034与sR035表达丰度验证 | 第49-50页 |
·部分sRNAs稳定性的Hfq依赖性验证 | 第50-51页 |
·CRP调控sRNAs的预测与验证 | 第51-53页 |
2. 讨论 | 第53-57页 |
·RNA-seq用于致病菌和宿主转录组的研究 | 第53-54页 |
·sRNAs与鼠疫菌进化 | 第54页 |
·Hfq对鼠疫菌sRNAs的作用 | 第54-55页 |
·sRNAs与鼠疫菌生理和毒力 | 第55-57页 |
第四部分 结论 | 第57-58页 |
参考文献 | 第58-62页 |
致谢 | 第62-64页 |
攻读硕士期间主要成果 | 第64页 |