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猪繁殖与呼吸综合征病毒感染猪肺泡巨噬细胞基因表达谱差异研究

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-11页
缩略语表(Abbreviation)第11-13页
第1章 文献综述第13-34页
   ·猪繁殖与呼吸综合征第13页
   ·PRRS的危害及流行病学特点第13-14页
   ·PRRSV病原特性第14-17页
     ·PRRSV的分类第14页
     ·PRRSV的理化学特性第14-15页
     ·PRRSV的抗原性第15页
     ·PRRSV的致病机理及生物学特性第15-17页
   ·PRRSV分子生物学研究进展第17-24页
     ·PRRSV基因组的结构与功能第17-19页
     ·PRRSV的蛋白质第19-23页
     ·PRRSV的基因组变异和 RNA重组第23-24页
     ·PRRSV的抗原性变异第24页
     ·PRRSV的毒力变异第24页
   ·PRRSV的免疫学反应第24-29页
     ·抗 PRRSV的体液免疫反应第25-27页
     ·抗 PRRSV的细胞免疫反应第27-28页
     ·PRRSV与免疫抑制第28-29页
     ·PRRSV与猪肺泡巨噬细胞第29页
   ·基因芯片的技术背景、工作原理及技术流程第29-32页
     ·生物芯片的技术背景第29-30页
     ·基因芯片的工作原理第30-32页
   ·Affymetrix基因芯片系统简介第32-34页
第2章 研究目的与意义第34-35页
第3章 材料与方法第35-50页
   ·试验材料第35-37页
     ·试验动物、细胞与毒株第35页
     ·工具酶及主要试剂第35-36页
     ·基因芯片第36页
     ·培养基与抗生素及其配制第36页
     ·主要缓冲液与相关试剂及其配制第36-37页
   ·试验方法第37-50页
     ·支气管肺泡灌洗和肺泡巨噬细胞的获取第37页
     ·总 RNA的提取和纯化第37-39页
     ·cDNA的合成和纯化第39-41页
     ·cRNA的合成和纯化第41-42页
     ·cRNA片段化、配制杂交液第42-43页
     ·芯片杂交第43页
     ·洗脱芯片第43页
     ·扫描芯片第43页
     ·数据分析第43-44页
     ·PRRSV的增殖,复壮与感染第44-45页
     ·半数细胞培养物感染量(TCID_(50))的测定第45页
     ·细胞、感染病毒的细胞样品、血清或组织的病毒总 RNA的提取第45页
     ·PRRSV的RT-PCR检测第45-46页
     ·实时荧光定量 PCR验证芯片的结果第46-47页
     ·统计学方法第47页
     ·基因芯片的操作系统设备,流程及示意图第47-50页
第4章 结果与分析第50-92页
   ·筛选 PRRSV阴性猪肺泡巨噬细胞第50页
   ·RNA样品质量控制第50-51页
   ·芯片杂交质量控制及扫描图谱第51-53页
   ·芯片结果的散点图第53-55页
   ·筛选差异表达基因第55-56页
   ·芯片差异表达基因归类第56-57页
   ·显著差异表达的已知基因第57-74页
   ·各类基因表达情况分类分析第74-85页
     ·芯片中IFN相关基因的表达情况第74页
     ·芯片中干扰素效应基因的表达情况第74-75页
     ·芯片中干扰素信号基因的表达情况第75-76页
     ·芯片中白介素相关基因表达情况第76-78页
     ·芯片中TLR相关基因的表达情况第78-79页
     ·趋化因子相关基因的表达情况第79-81页
     ·CD分子相关基因的表达情况第81-83页
     ·热效应蛋白相关基因表达情况第83-85页
   ·RT-PCR验证结果和数据分析第85-87页
   ·Genmapp软件对基因芯片中差异表达基因的Pathway分析第87页
   ·猪肺泡巨噬细胞感染PRRS病毒后趋化因子表达情况差异研究第87-92页
     ·CC趋化因子家族第88-89页
     ·CXC趋化因子家族第89-90页
     ·CX3C趋化因子家族第90-92页
第5章 讨论与结论第92-97页
   ·讨论第92-96页
   ·结论第96-97页
参考文献第97-106页
致谢第106页

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