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粉棒束孢的主要生物学特性及其响应海拔高度变化的组学分析

摘要第3-4页
Abstract第4-5页
第一章 文献综述第9-21页
    1.1 粉棒束孢的生物学特性第9-11页
    1.2 粉棒束孢药效学研究第11-12页
    1.3 药用真菌液体深层培养的影响因素第12-14页
    1.4 转录组学在真菌研究中的应用第14-15页
    1.5 代谢组学在真菌研究中的应用第15-17页
    1.6 海拔高度对生物体的影响第17-19页
    1.7 研究目的与意义第19页
    1.8 技术路线第19-21页
第二章 粉棒束孢的分离鉴定及其致病性研究第21-35页
    2.1 实验材料第21-23页
        2.1.1 感病材料及供试寄主幼虫第21页
        2.1.2 供试幼虫的食料来源第21-22页
        2.1.3 主要仪器第22-23页
        2.1.4 主要用具和试剂第23页
    2.2 实验方法第23-25页
        2.2.1 昆虫病原菌的分离鉴定第23-24页
        2.2.2 孢子悬浮液的配制第24页
        2.2.3 其对不同寄主幼虫的致死率第24-25页
        2.2.4 统计分析第25页
    2.3 结果与分析第25-33页
        2.3.1 形态学鉴定第25-26页
        2.3.2 分子鉴定第26-30页
        2.3.3 不同浓度粉棒束孢接种贡嘎勾蝠蛾幼虫后的死亡动态第30-31页
        2.3.4 粉棒束孢对农业害虫的侵染效果第31-33页
    2.4 小结与讨论第33-35页
第三章 粉棒束孢的发酵工艺优化第35-51页
    3.1 实验材料第35-36页
        3.1.1 菌株来源第35页
        3.1.2 主要用具和试剂第35-36页
        3.1.3 主要仪器第36页
    3.2 实验方法第36-39页
        3.2.1 菌种的准备第36页
        3.2.2 培养条件对菌丝生长的影响第36-37页
        3.2.3 营养条件对菌丝生长的影响第37-38页
        3.2.4 正交实验研究最佳营养条件组合第38页
        3.2.5 菌丝最佳采收时期第38页
        3.2.6 不同采收时间发酵液清除羟自由基能力的比较第38-39页
        3.2.7 统计分析第39页
    3.3 结果与分析第39-47页
        3.3.1 装瓶量和接种量分别对菌丝产量的影响第39页
        3.3.2 摇床速度和光照分别对菌丝产量的影响第39-40页
        3.3.3 温度对菌丝生长速度的影响第40-42页
        3.3.4 碳氮源对菌丝生长的影响第42-43页
        3.3.5 C/N比的影响第43-44页
        3.3.6 微量元素的影响第44页
        3.3.7 化学合成培养基正交实验第44-46页
        3.3.8 菌丝体生物产量及发酵液pH值的动态变化第46-47页
        3.3.9 发酵液清除羟基自由基能力第47页
    3.4 小结与讨论第47-51页
第四章 基于代谢组学技术研究海拔高度对菌丝生长的影响第51-59页
    4.1 实验材料第51页
        4.1.1 主要试剂第51页
        4.1.2 主要仪器设备第51页
    4.2 实验方法第51-53页
        4.2.1 不同海拔高度条件下的菌丝发酵第51-52页
        4.2.2 菌丝前处理第52页
        4.2.3 实验条件第52页
        4.2.4 数据处理和统计分析第52页
        4.2.5 差异代谢物识别第52-53页
    4.3 结果与分析第53-57页
        4.3.1 海拔高度对菌丝生长的影响第53页
        4.3.2 非靶向代谢谱分析第53-54页
        4.3.3 代谢产物的鉴定第54-57页
    4.4 小结与讨论第57-59页
第五章 基于转录组学技术研究海拔高度对菌丝生长的影响第59-79页
    5.1 实验材料第59-60页
        5.1.1 主要试剂及其配制第59页
        5.1.2 主要仪器设备第59-60页
    5.2 实验方法第60-62页
        5.2.1 菌丝取样第60页
        5.2.2 采用酚/氯仿法提取总RNA第60页
        5.2.3 文库构建第60页
        5.2.4 Illumina测序第60页
        5.2.5 数据质控第60页
        5.2.6 组装第60-61页
        5.2.7 组装后评估第61页
        5.2.8 基因预测第61页
        5.2.9 ORF功能注释第61页
        5.2.10 表达量分析第61页
        5.2.11 基因的差异表达分析第61页
        5.2.12 差异表达基因的富集分析第61页
        5.2.13 目的差异表达基因的q-PCR验证第61-62页
        5.2.14 数据分析第62页
    5.3 结果与分析第62-77页
        5.3.1 总RNA的检测结果第62-63页
        5.3.2 测序数据质量的统计分析第63-64页
        5.3.3 序列的组装与评估第64-67页
        5.3.4 注释结果第67-68页
        5.3.5 表达量分析第68页
        5.3.6 基因差异表达分析第68-69页
        5.3.7 差异表达基因的功能富集分析第69-74页
        5.3.8 呼吸电子传递链相关酶基因的转录差异第74-77页
    5.4 小结与讨论第77-79页
第六章 海拔高度影响菌丝生长代谢组和转录组的关联分析第79-89页
    6.1 关联分析方法第79页
    6.2 结果与分析第79-88页
        6.2.1 L-leucine代谢与转录的关联分析第80-81页
        6.2.2 Xanthurenic acid的代谢与转录的关联分析第81-82页
        6.2.3 Uridine 5'-diphosphate代谢与转录的关联分析第82-83页
        6.2.4 S-adenosylhomocysteine代谢与转录的关联分析第83-84页
        6.2.5 L-Phenylalanine代谢与转录的关联分析第84-85页
        6.2.6 Pantothenic acid代谢与转录的关联分析第85-88页
    6.3 小结与讨论第88-89页
第七章 结论第89-90页
参考文献第90-103页
致谢第103-104页
附件第104-105页
作者简介第105页

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